The Stargate base is put in deadly peril when it is contaminated with a dangerous infection which causes its victims to become mindlessly animalistic brutes.

Cuando Teal'c hace que Sam Carter se dé cuenta de lo valioso que es el conocimiento dejado por Tok'ra Jolinar en su cerebro y la oportunidad de una alianza, convencen al General Hammond de que permita a SG-1 intentar una reunión. Llegan a un planeta que está desierto en la superficie, pero son esperados por Tok'ra bien camuflados y armados que los llevan a túneles que crean mediante un misterioso cristal, que también puede deshacerlos después. Ambas partes son bastante sospechosas, el equipo se siente como prisionero, y de hecho, el líder Tok'ra Yosuuf teme que no puedan ser liberados, al menos hasta que todo el sitio sea trasladado. Mientras tanto, los Tau'ri apenas superan su sospecha contra la biología Tok'ra Goa'uld (con simbionte), cuando se les pide que se ofrezcan como "huéspedes", y Carter descubre que Martouf (y su simbionte, Lantash) era el amante de Jolinar, por lo tanto, tiene una conexión especial con ella.

El intento de forjar una alianza con los Tok'ra parece ser un fracaso miserable, ya que el SG-1 está prácticamente encarcelado como un riesgo de seguridad y se considera prácticamente hostil debido a la "fusión", ya que aceptar ser huéspedes de un simbionte es un paso demasiado lejos para cada uno de ellos. Cuando el SG-3 llega e informa a Sam sobre la condición cada vez peor de su padre, el General Jacob Carter, quien está gravemente enfermo, ella se da cuenta de que los poderes curativos del simbionte, confirmados para aplicarse al cáncer, hacen que la oferta de ser huésped sea demasiado buena para rechazarla. Garshaw permite que Sam y Jack regresen y convenzan a ambos generales de permitir el plan, lo cual se logra. Mientras tanto, los Tok'ra deben evacuar rápidamente, destruyendo los túneles a su paso, porque se espera un ataque a gran escala por parte de las tropas de Apophis, mientras Jacob conoce a su posible pareja simbiótica, Selmak, y a su predecesor terminal para ayudarlo a decidir. Jack verifica su fuerte sospecha de que hay un traidor entre los Tok'ra que está comunicándose con los Goa'uld.

O'Neill, Carter y Jackson están atrapados en el planeta de Hathor. Teal'c y Hammond van a Chulak para forjar un plan de rescate y recuperar al equipo.

El Coronel O'Neill es despedido del SGC por robar tecnología alienígena y posteriormente se le acerca para participar en una operación del Stargate aún más encubierta.

Cuando un miembro del equipo SG intenta asesinar al líder de los Tok'ra, se cree que algunos miembros del SGC han sido convertidos en Za'tarcos: asesinos programados. La Tok'ra Freya llega al SGC con Martouf para intentar probar a todos los miembros del equipo SG. Pero el detector de Za'tarcos sugiere que O'Neill y Carter en realidad son Za'tarcos. ¿Es esto correcto y hay otro Za'tarc en el SGC?