A bordo del Air Force One, un oficial de la Marina muere después de comer con el Potus, luego otro oficial de la Marina (relacionado con el AF1) también muere en Georgetown de la misma manera. Abby identifica la causa, y Gibbs frustra un intento de asesinato al PotUS.

Durante un salto de entrenamiento, un Marine muere cuando su paracaídas principal no se abre y no logra activar su paracaídas de reserva. Kate se une al equipo de NCIS y comienzan a investigar; logran identificar no solo al asesino y su método, sino también una conexión con drogas.

El comandante de la Armada de los Estados Unidos "Seadog" aparece muerto en una playa del norte de Virginia. Se encuentran cerca 2 presuntos traficantes de drogas también muertos. Los 3 fueron disparados. La NCIS, junto con la DEA y el FBI, investigan.

Un chef encuentra a un marinero desnudo dentro de un congelador en un restaurante en Rota, España, durante una visita al puerto del USS Enterprise; poco después en el mar, otro marinero se vuelve loco en la cubierta de vuelo; pronto uno de ellos muere. Gibbs y su equipo lo resuelven.

Los trabajadores encuentran el cuerpo en descomposición de un hombre, aparentemente un submarinista, dentro de un tambor de ácido. El equipo trata el caso como un asesinato y un robo de identidad. Gibbs y Kate se embarcan en un submarino en alta mar, encuentran al malo y salvan a la tripulación.

Un suboficial naturalizado de origen egipcio muere en Estados Unidos debido a una hemorragia masiva causada por una obstrucción intestinal causada por esmeraldas; acababa de llegar del Campamento Delta en Gitmo. Gibbs y otros investigan en Gitmo y evitan un asesinato.

Dos mayores de la Marina supuestamente mueren durante una operación clasificada en un país extranjero no revelado; uno de ellos pretende llamar a casa. El equipo investiga; encuentran mucha interferencia, pero tienen éxito y llegan a un final feliz.

Una joven emerge de una tumba improvisada y poco profunda en Rock Creek Park, Washington, DC; aunque sufre de amnesia, dice que no hay tiempo, que hay una bomba a bordo de un barco naval y que la gente morirá. Un conductor que pasa por allí la ayuda y llama al 911; la Policía del Metro responde y luego llama al NCIS. Gibbs y su equipo investigan. Kate se hace amiga de la víctima y la lleva a su lugar, y poco a poco ella recupera algunos recuerdos. Gibbs encuentra una llave, luego Abby lo descifra y Gibbs y Tony encuentran un cuerpo. El barco en cuestión resulta estar en tierra y dentro de un edificio. El equipo descubre el nombre de la víctima y luego ella comienza a recuperar más recuerdos de los que revela. Eventualmente, ella se enfrenta a la persona responsable de su tratamiento y le da una sorpresa.

Un oficial naval, un buzo de los SEAL, muere por una herida de puñal después de nadar mientras probaba un dispositivo de sonar portátil clasificado, que desaparece. Un llamante anónimo informa del asesinato. Gibbs y el equipo encuentran tanto al asesino como al dispositivo desaparecido.

Un reclutador de Marines muere en su oficina de un solo disparo; Gibbs y el equipo investigan; luego otro muere de la misma manera. El grupo de Gibbs espera otro asesinato, así que preparan una trampa y funciona; Tony y los agentes del FBI capturan al francotirador.

Un dentista de la Armada de una base aérea naval muere de un solo disparo en la espalda, aparentemente en un asesinato estilo ejecución; el NCIS investiga. Dos hombres más de la misma base aérea naval mueren de manera idéntica poco después. Gibbs y su equipo lo resuelven.

Un coronel de la Marina desaparece durante una emboscada en Iraq, al igual que $2 millones en efectivo; él vuelve a ingresar a los Estados Unidos bajo un nombre falso; el FBI lo busca, al igual que Gibbs, con quien sirvió mientras estaba en servicio activo. Gibbs lo encuentra y lo descubre.

Un agente extranjero ingresa a la sala de autopsias de manera poco convencional; luego toma como rehenes a Ducky, Gerald y, más tarde, a Kate. Exige pruebas relacionadas con un cuerpo en la habitación. Eventualmente pide ver a Gibbs, quien accede; él pierde.

La pandilla lamenta la muerte de Kate; la recuerdan y lidian con su muerte. Ari dispara en el laboratorio de Abby, y el NCIS obtiene un nuevo director, quien comparte una historia con Gibbs. Ducky acepta una invitación a una reunión inusual. [Continuar.]

Ducky conoce a Ari, Tony sigue a Ziva, Ari traiciona en secreto a Israel y al Mossad, Ziva pasa dinero en efectivo y un pasaporte falso a Ari, Gibbs y Jen buscan a Ari pero lo pierden de vista, Ari encuentra a Gibbs, y Ziva los encuentra a ellos. El grupo asiste al funeral de Kate en Indiana.