El Coronel Jack O'Neill es sacado de su retiro para liderar una nueva expedición de regreso a Abydos, solo para encontrarse con un viejo amigo, un nuevo enemigo y un uso mucho más amplio del Stargate.

El equipo, ahora designado como SG-1, está planeando su próxima incursión a través de la puerta mientras intentan mapear la variedad de sitios disponibles y localizar a sus amigos desaparecidos. O'Neill pide que Teal'c se le permita unirse a su equipo, pero el Gral. Hammond piensa que eso será poco probable dado que él es el huésped de un Goa'uld. Sin que nadie lo sepa, sin embargo, el amigo cercano de O'Neill, el Mayor Charles Kawalsky, líder del SG-2, ha sido infectado por un Goa'uld, una versión inmadura que aún no ha tomado el control completo del huésped. Kawalsky tiene apagones regulares durante los cuales el Goa'uld intenta regresar a la puerta. Una resonancia magnética revela cuál es el problema, pero es poco probable que la criatura que se ha fusionado a la columna de Kawalsky pueda ser removida quirúrgicamente. Mientras tanto, el Coronel Kennedy llega para interrogar a Teal'c, quien ha prometido lealtad a su nuevo mundo.

The Stargate base is put in deadly peril when it is contaminated with a dangerous infection which causes its victims to become mindlessly animalistic brutes.

Cuando Jack resulta herido accidentalmente por un alienígena de cristal, el alienígena duplica la forma de Jack y, por temor a ser castigado, intenta curarlo. Regresa a la Tierra en lugar de Jack, mientras Jack sigue inconsciente en el planeta, para encontrar la única cosa que cree que logrará esto; la única cosa que no se puede encontrar de nuevo. Mientras tanto, el "verdadero" Jack ha regresado y está tratando de convencer al SGC de que él es quien dice ser.

Con el programa Stargate en peligro de ser terminado, el equipo está bajo presión para encontrar tecnología. Visitando un planeta donde creen que hay una criatura que posee el secreto de la invisibilidad, se encuentran con Apophis y sus guardias. Ambos lados sufren heridas mortales, pero son ayudados por los habitantes del planeta, los Nox, un pueblo amable con un secreto muy grande.

On the planet Argos, Kynthia seduces Colonel O'Neill, which gives him an Argosian lifespan of only a 100 days. As he begins to age rapidly, will the SG-1 team succeed in finding a cure?

SG-1 va al planeta Cimmeria en busca de aliados contra los Goa'uld. Al llegar, Jack y Teal'c quedan atrapados en un laberinto, donde la única salida es a través del Martillo de Thor, un dispositivo para destruir a los Goa'uld pero preservar al anfitrión. Daniel Jackson debe destruir el dispositivo que podría haber salvado a su esposa en el futuro para liberar a sus amigos.

Daniel Jackson descubre que el Stargate fue activado en 1945 y un joven profesor pasó a través de él, sin volver nunca más. Junto con su prometida aún viva, el equipo SG1 descubre al profesor, ahora anciano, desnudo y atrapado en una fortaleza en decadencia, que contiene los secretos de una alianza antigua. ¿Podrán rescatarlo y escapar a la Tierra a tiempo?

O'Neill, Carter and Teal'c return through the Stargate shell-shocked and distressed to announce that Daniel Jackson was killed. But Jackson was captured by the last survivor of an aquatic race, who planted false memories in the other members of SG1. Can the team remember and return to rescue Daniel?

En una misión de observación astronómica de agujeros negros, SG-1 encuentra una epidemia masiva y mortal de bacterias en un planeta donde los nativos les dijeron a Daniel, incrédulo en ese momento, hace meses que el próximo eclipse solar traería desastres. También llevan de vuelta a la Base de la Montaña Cheyenne a una joven huérfana llamada Cassandra, que ha sobrevivido y está relativamente sana, despertando el instinto maternal de Sam. Los rastros de Naquadah encontrados en su sangre resultan haberla hecho inmune, pero después de tener una convulsión, se diagnostica que constituyen una enorme bomba, de alguna manera activada al rescatarla; todo esto debe ser planeado como un "Caballo de Troya" por los Goa'uld. Sam toma la perspectiva de sacrificar a Cassie de manera personal y está dispuesta a correr riesgos personales.

En su primera visita a un nuevo planeta, SG-1 descubre que está sujeto a una actividad volcánica totalmente destructiva y salva a diez nativos, los Tollan, una sociedad mucho más avanzada tecnológicamente. Su líder, Omoc, no está agradecido ni interesado en una raza tan primitiva como los terrícolas o cualquiera de los planetas "aún más primitivos" que están dispuestos a acogerlos. Solo un Tollan, Narim, muestra un interés activo en la vida en la Tierra, especialmente en la capitana Samantha Carter y el gato Schrodinger que ella le regala, explicando que su planeta fue destruido después de que los Tollan suministraran una fuente de energía ilimitada a un planeta vecino primitivo que la utilizó para crear un arma catastrófica. Mientras tanto, la Casa Blanca autoriza al coronel Maybourne del NID a hacerse cargo de los Tollan con fines militares, exactamente como temía Omoc.

Después de un defecto técnico en la Puerta Estelar, O'Neill y Carter quedan atrapados junto a una Puerta Estelar en una cueva en un páramo helado. O'Neill está gravemente herido y ambos se están congelando. ¿Encontrará y rescatará el SGC a tiempo?

Mientras recolecta artefactos en un planeta distante, Daniel Jackson queda inconsciente después de tocar un objeto similar a un espejo. Despierta en la misma habitación pero no puede encontrar a los demás miembros de SG-1. Suponiendo que se fueron sin él, marca el regreso a casa pero llega a encontrar que está en una realidad diferente. En este mundo, el General Jack O'Neill y Catherine Langford están a cargo del programa Stargate; Hammond es un Coronel que informa a O'Neill; y Sam Carter es una científica civil que trabaja en el proyecto (y también está comprometida con O'Neill). Más importante aún, la Tierra está siendo atacada por los Goa'uld, quienes ya han matado a más de mil millones de personas. Carter cree que de alguna manera, Jackson es de una dimensión paralela. Cuando Jackson descubre el punto de origen del ataque de los Goa'uld, quiere regresar a su propio universo, creyendo que su Tierra será atacada de manera similar.

The Stargate team must justify the project's continuation when a doubtful senator, Head of the Congressional Military Appropriations Committee, comes to review the project's performance.

El General Hammond ha intentado de todo para revertir la decisión del Senado de cerrar su programa Stargate, pero el Presidente se niega personalmente a "cometer suicidio político": el Stargate será enterrado. La insistencia de Daniel -de que el peligro para la Tierra en su conjunto es más importante- convence a sus colegas de ignorar el mandato de Hammond y marcar la dirección desde la cual comenzó la invasión de los Goa'uld en la realidad alternativa que él visitó. Llegan no a un planeta, sino a una nueva nave espacial de tipo superior, ya lanzada por hiperimpulsión. Un "video" prueba que pertenece a Apophis, quien le da el mando a su hijo Klorel, cuyo huésped no es otro que el joven amigo abydónico del equipo, Skaara. Dominar a Skaara parece ser su mejor movimiento, mientras Sam instala explosivos en la cubierta de los planeadores de la muerte con un temporizador de 24 horas por si acaso, pero los Jaffa logran liberar a Klorel. Jack descubre que la nave va mucho más rápido de lo esperado.

A medida que la flota de ataque de los Goa'uld se acerca a la Tierra, los cuatro miembros del equipo SG-1 son tomados prisioneros. Reciben ayuda de una fuente inesperada cuando Bra'tac, el mentor de Teal'c, revela que está a bordo. Apophis ha retrasado el ataque hasta que su hijo Klorel sea revivido, dándoles algo de tiempo para prepararse. SG-1 ha utilizado todo el C4 en una de las dos naves, pero deben encontrar una manera de deshacerse de la segunda. De regreso en el Comando Stargate, el Teniente Coronel Bert Samuels llega como oficial de enlace del Pentágono, pero también revela un nuevo arma que han desarrollado. El General Hammond está escéptico. Comienzan a transportar humanos a un sitio Alpha para asegurar la continuación de la humanidad.

While walking through a forest on another planet, Jackson saves the life of a beautiful princess who is about to kill herself. SG1 is taken prisoner, but Daniel is freed by the ruler when he finds out that he saved his daughter. The rest of SG1 is sent to work in the mines for the rest of their lives. Jackson falls in love with the princess, but also becomes intoxicated by frequent use of a Sarcophagus. Will he come to his senses before the rest of SG1 are worked to death?

SG-1 discovers an ancient artifact and brings it back to the SGC. Ariving at the SGC, it becomes active, pins O'Neill to the gate room wall, and unleashes a virus into him.

O'Neill, Carter y Jackson están atrapados en el planeta de Hathor. Teal'c y Hammond van a Chulak para forjar un plan de rescate y recuperar al equipo.

Después de un catastrófico bombardeo de meteoritos, el Coronel Jack O'Neill se encuentra varado en un planeta primitivo con su Stargate aparentemente permanentemente inaccesible.

Listo para ir de vacaciones, O'Neill es transportado por los Asgard. Thor le dice que la Tierra se enfrenta a un enemigo aún peor que los Goa'uld.

SG-1 tiene que lidiar con una infestación de Replicadores en un submarino ruso en la Tierra, mientras la Mayor Carter asesora a los Asgard sobre cómo combatir la amenaza en su galaxia.

El SGC es contactado por una civilización humana alienígena avanzada y en guerra que busca ayuda militar, pero sus razones exactas para ello se vuelven cada vez más sospechosas.

An old love of Teal'c approaches the SGC and the Tok'ra claiming that her Goa'uld symbiote has been convinced to defect with their help.

El SGC se entera de que los rusos tienen su propio Stargate y necesitan la ayuda de los estadounidenses con los problemas que están afectándolos a ambos.

Mientras está en una excavación arqueológica en el planeta natal original de los Goa'uld, Daniel es capturado por un joven Unas. Intenta comunicarse con él y poco a poco establece una relación. Mientras tanto, el SG-1 llega al planeta para encontrar a Daniel y pronto se dan cuenta de que algunos miembros del equipo SG allí pueden haber sido poseídos por los Goa'uld. ¿Podrán descubrir quiénes a tiempo para rescatar a Daniel?

The SG-1 team awake to find they have lost their memories. They believe they are workers in an underground power station. They are told that they are helping to preserve life during an ice age. In truth, they are slave labor to a huge domed city above. When Teal'c starts to recover his memory and is given another amnesia treatment, he forgets his Kelno'reem and starts to die. Will the others recover their memories in time to save him?

El general Hammond se retira misteriosamente del SGC y se trae a un nuevo general, quien separa al SG-1: Daniel y Sam son científicos, Teal'c está con el SG-3 y O'Neill comanda un nuevo SG-1. O'Neill intenta convencer al general Hammond de que regrese, pero descubre que alguien ordenó a Hammond que se fuera o lastimarían a sus nietos. Mientras los demás mantienen ocupado al nuevo general, O'Neill intenta descubrir quién es ese "alguien". Para ello, debe confiar en la persona que más odia: Maybourne.

En 2010, Robert Kinsey es presidente de un valiente nuevo mundo desde que concluyó la alianza con los Aschen, una raza descubierta por SG-1 que permite a la humanidad disfrutar de su ciencia y tecnología avanzada, incluida una vacuna contra el envejecimiento. Sam, ahora una científica civil, está casada con el embajador Joe Faxon, cuya única preocupación es no poder quedar embarazada. Cuando ella y la Dra. Fraser revisan la computadora del doctor Aschen Mollem, quien se sentía superfluo debido a la medicina superior, descubren que la fertilidad humana ha disminuido en un 90% en todo el mundo en tres años. Sam, Daniel y Teal'c acuden al general retirado Jack, quien siempre advirtió sobre entregar el control tecnológico, para un plan audaz de retroceder en el tiempo como lo hizo el general Hammond una vez, enviando un mensaje a su pasado con la hora exacta de una llamarada solar, que Sam puede calcular usando la computadora Aschen. Solo les falta un ingrediente: el dispositivo GDO para controlar el iris del Stargate, que está en la Casa Blanca. Sam le implora a su esposo Joe que lo robe, pero él tiene un secreto además de objeciones sinceras.

Cuando un niño "elegido" encontrado en el planeta Abydos es llevado al SGC, envía un mensaje telepático, causando que la personalidad de Daniel Jackson experimente cambios perturbadores. ¿Podrá el resto de SG-1 resolver el misterio del origen del niño antes de que se convierta en un ambicioso belicista?

SG-5's Lieutenant Barber commits suicide by jumping into the Stargate shortly after a mission on a planet where a palace abandoned by the Goa'uld about 200 years ago is being studied by Daniel. Soon after, Daniel develops violent mood swings and is committed to a hospital with a neurotransmitter brain condition, presumed fatal after all the other SG-5 members die. Meanwhile, SG-3 has visited the planet, finding only the light installation Daniel reported as particularly fascinating and a human teenage boy, Loran, who hid from Daniel's expedition, but now tells Jack he was left there by his parents, scientific researchers. Back in SGC, Jack also develops symptoms. Sam and Dr. Fraiser conclude that it must be some addiction linked to the light, so when Daniel is nearly terminal Jack, who might not have been exposed too long himself, must bring him back. Jack insists they try turning off the light, and leans on Loran, who is looking for a father-figure; he even gives Teal'c an early "birthday present," but has a dark secret.

Carter decides to inspire a brilliant but difficult Air Force cadet by introducing her to the SGC program.

When the SGC probes a new planet, an alien energy entity there responds by invading the SGC's computer systems, and then Major Carter herself.

Atrapados en otra galaxia mientras huyen del ataque a la flota de Apophis, resulta ser solo el comienzo de los problemas de SG-1, ya que aparecen múltiples enemigos.

Cuando SG-1 huye de una expedición con el Coronel O'Neill y un miembro misterioso del equipo llamado Tyler, del que nadie más sabe, quedan varados y se cuestiona la aptitud del equipo.

Con la muerte de Omoc, la posterior reconsideración repentina de Tollan sobre su embargo tecnológico lleva a SG-1 a sospechar de una conspiración gubernamental.

SG-1 establece contacto con los Aschen, sin saber que su mundo natal es uno del que previamente se les advirtió en el futuro que se considerara fuera de límites.

Cuando Teal'c queda atrapado en el búfer del Stargate, el equipo debe enfrentar desafíos técnicos mientras lidian con rivalidades personales, interdepartamentales y diplomáticas para rescatarlo a tiempo.

En un plan de los Tok'ra para eliminar a los Goa'uld, Daniel se infiltra como sirviente de Yu para liberar un veneno en una reunión de los señores del sistema. Mientras tanto, un ataque de los Goa'uld a la base de los Tok'ra deja al resto del equipo SG-1 ocupado.

Mientras continúa la cumbre de los Goa'uld, Daniel se encuentra cara a cara con Osiris. Lo engaña de la misma manera que lo hizo con Yu, pero no puede causar la muerte de Sarah, la huésped de Osiris. Permanece para descubrir información sobre el maestro desconocido de Osiris. Lantash, habiendo tomado al teniente Elliot como huésped, guía al resto del SG-1 para escapar de la base caída de los Tok'ra.

Se descubre un gran asteroide en rumbo de colisión con la Tierra.

En un planeta alienígena, SG-1 descubre que un androide inactivo es el único sobreviviente de la destrucción de su civilización. Lo llevan de vuelta al SGC para estudiarlo y logran reactivarlo. Las cosas toman un giro para peor cuando ella "crea" un insecto replicador para Daniel.

To fix a mistake caused by the fake SG team, the real SG-1 must enlist the help of two convicts. The threat of an approaching Goa'uld mothership stresses the repair of the Sentinel.

A medida que Jackson sufre de una dosis fatal de radiación, lucha con el valor de su vida mientras sus amigos lidian con las repercusiones emocionales y diplomáticas.

Mientras aún lidian con la pérdida de Daniel Jackson, el SGC es contactado por los Asgard, quienes requieren ayuda para enfrentar a Anubis, quien parece tener nueva tecnología de escudos que puede repeler las armas Asgard.

El Maestro Bra'tac llega con malas noticias: la esposa de Teal'c está gravemente enferma, y Teal'c se va para estar con ella. Poco después, se abre el portal pero no pasa nada. Entonces Carter descubre una señal de muy baja potencia que está aumentando lentamente hasta alcanzar una sobrecarga lo suficientemente poderosa como para destruir la Tierra.

El arma de Anubis continúa amenazando a la Tierra. Se intentan varios planes hasta que Jonas Quinn sugiere algo simple que podría funcionar. Mientras tanto, el Maestro Bra'tac ha descubierto el planeta desde el cual Anubis está lanzando el ataque. Él, Teal'c y Rya'c viajan allí para detenerlo.

Cuando el SGC detecta una nave Goa'uld en órbita, el SG-1 es enviado con Jacob Carter para investigar. Descubren que la nave está abandonada sin signos de vida discernibles y Sam determina que es la misma que se utilizó para secuestrar a Thor. Una vez a bordo de la nave Goa'uld, descubren que la tripulación había iniciado una secuencia de autodestrucción. O'Neill desea recuperar la nave a pesar de las advertencias de Jacob de que podría ser un caballo de Troya. Un examen del núcleo de la computadora revela que Thor pudo haber introducido un virus, pero Jacob tenía razón: es una emboscada y la nave pronto se sumerge en el océano. El SGC y la Armada llevan a cabo una operación de rescate.

El equipo SG-1 viaja a la estación científica en la Antártida cuando los científicos descubren un cuerpo antiguo en el hielo. La edad de las muestras del núcleo de hielo indica que el cuerpo es anterior a la humanidad. A medida que descongelan el cuerpo, cobra vida. Es una joven a la que llaman Ayiana. A medida que Ayiana gana fuerza, todos los que la rodean enferman al contraer un virus desconocido que creen que Ayiana portaba. La recién llegada también muestra poderes de curación y aparentemente puede curar cualquier enfermedad con solo tocar. Sin embargo, al hacerlo, se debilita hasta el punto de la muerte. Al final, solo el Coronel O'Neill queda sin tratar y el SGC busca la ayuda de los Tok'ra, quienes ofrecen una solución inesperada.

El simbionte de O'Neill, Kanan, lo arrastra a un planeta gobernado por el Goa'uld Ba'al, donde Kanan estaba encubierto. Ba'al captura y tortura a O'Neill, cuya única esperanza puede estar en - ¿Daniel Jackson?!?

Stargate Command is approached by representatives of Jonas Quinn's home planet seeking military hardware. Their world is divided into three territories and there is a long history of war among them. Jonas' country fears that the other two territories are about to sign a non-aggression pact thus making them vulnerable to attack. In return for arms, they are offering an abundance of Naquadria. SGC isn't about to get involved in what amounts to a civil war but there's another possible outcome when Jonas' one-time professor, Doctor Kieran, tells them of an underground movement ready to overthrow the government and seek out a lasting peace. SG-1 travels to Jonas Quinn's home planet to obtain information on the situation there but not all is as it seems.

SG-1 está proporcionando seguridad a tres científicos que están realizando investigaciones en un planeta lejano. El warlord Goa'uld Khonsu organiza capturar al equipo SG-1 y O'Neill le dice a Jay Felger, nominalmente el líder del grupo, que use la puerta y regrese a la base. Felger está bastante enamorado del equipo SG-1, admirando sus hazañas y audacia. En lugar de seguir las órdenes de O'Neill, Felger y otro científico, Simon Coombs, se transportan a la nave Goa'uld. Lo que los científicos no saben es que la captura de SG-1 es una estratagema para permitir que Khonsu, que en realidad es un Tok'ra, transmita información. O'Neill está bastante molesto con los dos científicos, pero su presencia resulta útil al final.

Después de haber recuperado el control del X-303, el equipo SG-1 se encuentra en una parte desconocida del espacio. El rescate llega en forma de los Asgard, específicamente Thor, quien necesita su ayuda. El mundo natal de los Asgard ha sido invadido por los Replicadores y también necesitan la ayuda de SG-1, así como del X-303, que es una tecnología relativamente baja. Los Asgard habían preparado una trampa para los Replicadores y esperaban usar un dispositivo de dilatación temporal que les daría el tiempo necesario para encontrar una forma de derrotarlos. El problema es que los Replicadores han desactivado el dispositivo y los Asgard quieren que SG-1 entre y lo active. Aceptan la misión, pero para cumplir con su objetivo, O'Neill enfrentará un dilema moral.

SG-1 brings back an Ancient device, the purpose of which is unknown. When Jonas touched it the device activated. Upon reaching the SGC Jonas sees a large red insect fly into a wall, but no one else can confirm his sighting. The SGC is put into lockdown, but nothing is found. Jonas suspects that the Ancient device is causing his hallucinations, but to his dismay it is set to be shipped to Area 51. When Teal'c and Jack see the bugs as well, General Hammond decides to let Jonas take a crack at deciphering the Ancient text on the device.

El ex coronel Harry Maybourne se acerca a Jack con una propuesta: Jack le consigue un indulto presidencial y Harry les muestra el depósito de armas avanzadas al que Simmons intentaba llegar. Llevan a cabo el trato, pero Harry intenta traicionar a SG-1. Logra pasar por el portal que lleva al depósito, pero con un elemento inesperado, Jack. Se encuentran en un campo y el zat de Harry ha desaparecido. Sin embargo, Jack todavía tiene su P-90. Harry revela que no están en un depósito de armas, sino en una utopía. Tenía la intención de vivir el resto de su vida allí y cree que no hay forma de regresar.

The Russian SG team brings back a man who claims that his people are being experimented on by Nirrti. SG-1 investigate where the experiments are conducted, with the Russian SG team as backup. The inhabitants worship Nirrti as their god and savior from a terrible plague. SG-1 attempts to use the same device Nirrti used on the people to reverse the mutations, but the people turn on them at the arrival of Nirrti.

The US and Russia reveal Stargate Command and its operations to representatives of the other permanent members of the United Nations Security Council.

Teal'c está teniendo extrañas pesadillas en las que Apophis aparece y él es humano, un bombero junto con su equipo.

En una misión de rutina, el SG-1 se encuentra con una civilización desesperada por ser liberada de las garras de un Goa'uld. Mientras están en el planeta, Jonas se enferma y es suspendido de sus funciones. Su misteriosa enfermedad es diagnosticada como un tumor cerebral, pero le otorga la increíble habilidad de vislumbrar el futuro, ¡un futuro en el que O'Neill y el SG-1 están cayendo en una trampa!

Montando en el ascensor en el SGC, O'Neill es visitado por Daniel Jackson, quien necesita su ayuda. Daniel le dice que Anubis se dirige hacia Abydos para buscar algo llamado el Ojo de Ra, una reliquia que haría a Anubis todopoderoso. Es esencial que el SG-1 vaya a Abydos y asegure el Ojo, pero nadie lo ha visto, incluyendo a Daniel, y nadie ha podido encontrarlo. En el planeta, ven a su viejo amigo Skaara y, con la ayuda de Daniel, localizan el Ojo. También encuentran una tableta que habla de una ciudad perdida de los antiguos. Cuando Anubis y sus tropas aterrizan en masa, hay poco que alguien pueda hacer para detenerlos. Al final, queda en manos de Daniel decidir si intentará detener a Anubis, rompiendo así una regla cardinal de los Antiguos.

Un grupo de nómadas en un planeta alienígena encuentran a Daniel Jackson desnudo en medio de ruinas y lo acogen. Jonas traduce la tableta que Daniel dijo que era importante y descubre que describe la última ciudad que los Antiguos estaban construyendo antes de la plaga. Supone que la lista de direcciones que Jack introdujo en la computadora al guardar los datos de los Antiguos eran puestos avanzados Antiguos en orden temporal. Por lo tanto, la última de las direcciones debería ser la "Ciudad Perdida". SG-1 visita el planeta y se encuentra con el pueblo nómada, que ahora habita las ruinas de la ciudad Antigua. Allí encuentran a Daniel, pero descubren que ha perdido la memoria. Deben recuperar sus recuerdos para descubrir el secreto para derrotar a Anubis.

El arma superpoderosa de Anubis ha sido desactivada, pero la flota de Yu ha sido desviada al otro lado de la galaxia por el propio Yu, lo que permite que Anubis escape al hiperespacio. Jonas ha sido capturado por Anubis y Daniel todavía está a bordo de la nave de Anubis, evitando ser capturado. Anubis utiliza la sonda mental en Jonas, descubre el Naquadria y comienza su ataque a Kelowna. Los kelownianos buscan ayuda en el SGC. Jack y Sam llegan a Langara para descubrir que los kelownianos le han dado a Anubis Naquadria para asegurar su seguridad. Se comunican con Daniel, quien está tratando de liberar a Jonas. Teal'c ha convencido al primer primer ministro de Yu de buscar un nuevo líder de los Señores del Sistema, Ba'al.

In a firefight with Jaffa, Teal'c takes a staff blast to the gut. Without his symbiote, he cannot regenerate as he once did. Daniel feels that he cannot remember something important, so he goes searching through the logs for any sign of his lost knowledge. Teal'c expresses his feelings that the Tritonin has made him weak.

SG-1 investiga una colonia humana aparentemente idílica y sutilmente avanzada, resguardada dentro de una cúpula de energía en un planeta por lo demás inhóspito.

Mientras exploraba una nave alienígena estrellada llena de pasajeros en criostasis, una fuerza alienígena ha descargado un número de sus conciencias en Daniel.

Cuando una misión de exploración geológica de SG se encuentra en conflicto mortal con un clan indígena de Unas, Daniel convence a Chaka para que lo ayude a buscar un acuerdo con ellos.

To save his job, Dr. Felger tests a new virus on the Stargate Network to help control it and it ends up disabling it instead.

En el nuevo sitio Alpha, Sam Carter y Selmak (el simbionte que lleva Jacob Carter, su padre) están trabajando en un nuevo arma para derrotar a los superdrones de Anubis cuando el planeta es atacado por una flota de naves Goa'uld. Carter escapa con el prototipo del arma antes de que se active la autodestrucción de la base, pero se encuentra siendo perseguida por un superdrone.

El presidente ha pedido que un documentalista vaya a SGC para crear una película sobre sus operaciones. Su llegada es poco deseada para la mayoría y comienza a chocar con el personal de la base. Sin embargo, realiza sus entrevistas con SG-1 y los científicos empleados por SGC. Mientras tanto, un equipo SG en otro mundo encuentra los restos de una ciudad Antigua.

El documentalista sigue siendo un dolor de cabeza para ellos, el SGC se enfrenta a un dilema inesperado. Con la mitad del equipo SG-13 en otro planeta luchando contra los Jaffa enemigos, los equipos SG 1, 5 y 7 entran como refuerzo. En medio de un intenso fuego, O'Neill recibe un disparo de un bastón en el pecho. Las numerosas muertes en el enfrentamiento afectan duramente al SGC y el Senador Kinsey ordena una investigación completa sobre el asunto.

The newly inaugurated President of the United States is briefed by the Head of the Joint Chiefs of Staff on the Stargate program. Former Senator, now Vice President, Kinsey attempts to get his running mate to back his policies for the program, but the president decides to look into the situation himself. Kinsey gets Richard Woolsey to convince the president of his agenda.

El vicepresidente Kinsey informa al Dr. Weir sobre el programa Stargate antes de su reunión con el presidente. Los equipos SG 1, 3 y 5 se van a otro mundo para intentar extraer un dispositivo de almacenamiento de los Antiguos recién descubierto. Al llegar al lugar del dispositivo, el SG-1 es atacado por naves Goa'uld. Sin otra forma de evitar que Anubis se apodere del conocimiento, Jack se somete al peligroso dispositivo.

Con Jack teniendo de nuevo el conocimiento del antiguo repositorio en su mente, él y Daniel intentan desenterrar la ubicación de la Ciudad Perdida de los Antiguos. Bra'tac, trayendo consigo la noticia de un inminente ataque a los Tau'ri por parte de Anubis, lleva a Teal'c para ayudarlo a adquirir naves y guerreros para la defensa de la Tierra. La Dra. Weir intenta lidiar con la abrumadora naturaleza de su nuevo trabajo, mientras también lidia con el implacable ego del Vicepresidente Kinsey.

En un último intento desesperado, O'Neill activó un arma antigua en la Antártida para derrotar a Anubis. Con Jack aún en estasis en el puesto avanzado de los Antiguos enterrado en la Antártida, el SG-1 intenta contactar a los Asgard. Mientras tanto, su nueva líder, la Dra. Elizabeth Weir, intenta decidir qué hacer con una solicitud de conversaciones de paz de los Señores del Sistema Goa'uld.

La flota Asgard logra destruir la nave Replicadora, con Carter a bordo, pero no puede contener los escombros. Las negociaciones se rompen con los Señores del Sistema, terminando en el envío de un Ha'tak para probar las nuevas capacidades defensivas de la Tierra. El Prometeo espera para enfrentar al enemigo entrante, pero Thor llega en la Daniel Jackson, con Teal'c a bordo. Solicitan la ayuda de Daniel y Jack, todavía en estasis, para eliminar la amenaza de los replicadores en el nuevo hogar Asgard.

Como el nuevo jefe del SGC, el General O'Neill empieza a sentir el peso de su responsabilidad y comienza a tener dudas sobre toda la idea, cuestionando su propia competencia.

The discovery of the Stargate creates a war between two nations on the planet Tegalus with Daniel in the middle of it.

El Dr. Lee está adaptando una silla de realidad virtual para utilizarla como dispositivo de entrenamiento. Teal'c piensa que el escenario actual es demasiado fácil y acepta trabajar con ellos para hacerlo más realista. Él entra en el escenario del juego y es rápidamente "asesinado", momento en el cual la silla lo electrocuta. Lee dice que debe ser parte de su construcción básica. A medida que el escenario se reinicia -es una invasión del SGC por los Goa'uld- Teal'c es repetidamente asesinado y electrocutado, poniéndolo en peligro. El programa de computadora está configurado para aprender después de cada escenario y el desafío para Teal'c aumenta en cada turno. Daniel se ofrece como voluntario para ingresar al juego también, para ver si juntos pueden encontrar una forma de escapar.

Having obtained permission to live off the base, Teal'c rents an apartment, telling neighbors that he has recently arrived from Mozambique. He's under orders to keep a low profile but can't seem to help himself when it comes to helping his neighbors. He helps one who is about to be assaulted by three thugs, but it's his next-door neighbor who seems to need assistance. Krista is having problems with her boyfriend, Doug. Teal'c soon realizes that Doug is beating her and warns him that should he hurt her, Teal'c will kill him. It all becomes very difficult when Doug is found dead in Krista's apartment. Daniel Jackson soon after receives an offer - translate a Goa'uld text, and he will get ironclad evidence that Teal'c is innocent. Meanwhile, Carter is shocked when her boyfriend Pete Shanahan tells he asked for a transfer to the local police department and asks her to marry him.

Teal'c is unhappy with his son's plans to marry. Ishta arrives bringing news that Hak'tyl may be compromised. Complications arise when O'Neill allows Hak'tyl to inhabit SGC until a new homeworld is found for them.

Cuando el Stargate es teletransportado fuera de la SGC en medio de la noche, Teal'c queda atrapado en otro mundo. El Dr. Jackson y la Coronel Carter intentan recuperar la puerta.

The replicator Carter and the real Carter work together with the disruptor signal. The replicator has a different plan.

El General Hammond regresa al SGC para llevar al Dr. Jackson con él en un viaje a Atlantis a bordo del Prometheus. En medio de su viaje, el Prometheus recibe una señal de socorro y Hammond decide investigar. Las cosas se complican cuando un Guerrero Kull toma el control del Prometheus, dejando a Hammond y a su tripulación, excepto Daniel Jackson, atrás en un Alkesh dañado.

El ex vicepresidente Kinsey va a ver a Jack para informarle de las actividades del Trust, incluyendo lo que parece ser un plan para que los rusos reclamen la Puerta Estelar que prestaron a Estados Unidos. Jack decide utilizar a Kinsey como su hombre infiltrado en el Trust. Kinsey lleva un micrófono oculto en su reunión con el Trust para organizar un encuentro con un general ruso de alto rango. El plan se complica cuando las señales son bloqueadas justo cuando el Trust revela algo sorprendente a Kinsey y desaparecen.

Después de una larga ausencia, Jacob Carter regresa al SGC para decirle a Jack que la galaxia está amenazada de ser tomada por los Replicadores. Los Goa'uld están siendo atacados por los Replicadores y están siendo eliminados rápidamente. Los ejércitos de Ba'al están siendo destruidos y él llega al SGC para sugerir que trabajen juntos para derrotar a su enemigo común. El doble de Carter, RepliCarter, está liderando el ataque y ha secuestrado a Daniel Jackson con la esperanza de descubrir cualquier arma que los Antiguos hayan creado que pueda derrotarlos. Jackson recibe ayuda de una fuente inesperada, la Antigua Oma Desala, o eso cree él.

Sam y Jacob están en el planeta Dakara tratando de configurar el dispositivo de los Antiguos para destruir a los Replicadores de una vez por todas, con la ayuda parcial de Ba'al y Daniel, quien logra congelar a los Replicadores manipulando al duplicado de Carter.

Daniel se encuentra en un tiempo y lugar extraños: un restaurante donde Oma trabaja como camarera. Ella le ofrece una elección clara: puede elegir morir o ascender, pero si elige lo segundo, no podrá ayudar a sus amigos a luchar contra Anubis, quien aún no ha sido eliminado. Entabla una conversación con otro cliente, Jim, quien tiene su propia opinión sobre la situación. Mientras tanto, Sam decide que ha llegado el momento de que su prometido conozca a su padre, Jacob. Sin embargo, Jacob no está bien, algo que ha ocultado a Sam durante varias semanas. Después de que Pete la sorprende -él cree haber encontrado la casa perfecta para ambos- Sam se da cuenta de que debe enfrentar sus sentimientos hacia otra persona. Teal'c y el Maestro Bra'tac tienen información de que Anubis podría estar reuniendo lo que queda de sus fuerzas para atacar Dakara.

Con un nuevo comandante del SGC llega un nuevo líder de SG-1, el Teniente Coronel Cameron Mitchell, un ex piloto de combate que voló un F-302 en la batalla sobre la Antártida. Sin embargo, se desanima por el hecho de que todos los demás miembros de SG-1 se van a otras empresas: Teal'c para gestionar la Nación Jaffa, Carter a la Área 51 para investigación y desarrollo alienígena, y el Dr. Jackson a Atlantis como experto en los Antiguos. Mitchell se esfuerza por retener a los miembros de SG-1 para sí mismo, pero cada vez es más difícil convencerlos.

Daniel y Vala han utilizado el dispositivo antiguo para habitar los cuerpos de personas en la galaxia de origen de los Alterans. Han sido llevados por un Prior de los Ori para encontrarse con el Doci, aquel que habla con los Ori, sus dioses. Daniel deduce que los Ori son lo que los Alterans que se convirtieron en los Antiguos dejaron atrás y han ascendido de manera similar, pero sin restricciones.

Vala returns to the SGC upon having been separated from Daniel for a little under an hour. The effects of the bracelets have not diminished even though they have been removed. In order to get the effects reversed, Mitchell, Jackson, and Vala must deal with many people that Vala has used over the years to gain favors.

Vala leads SG-1 to a planet which the Priors have visited with a plan to keep them from worshiping the Ori. Once there she reveals that the symbiote that once held her ruled over this planet. She feels that keeping them in allegiance to her will hinder the spread of Origin to this world.

Un Prior de los Ori ha establecido un campo de fuerza en constante crecimiento en un planeta controlado por los Jaffa llamado Kalana. Un Goa'uld menor llamado Nerus, quien diseñó las múltiples conexiones de la Puerta necesarias para derrotar a los Replicantes, llega al SGC con información sobre el evento y ofrece su ayuda.

Following the death of a Jaffa on Earth and the disappearance of a prominent businessman, SG-1 starts an investigation into what remains of the Trust and into the actions of the Jaffa Nation. They discover that Ba'al is hiding on Earth after losing his forces to the Jaffa and that the Jaffa are secretly attempting his capture.

SG-1 investigates a planet that is said to be the home of the Warriors of Sodan, a legendary tribe of Jaffa said to have not served the Goa'uld in 5,000 years. In an encounter with the warriors, Mitchell deals a deadly blow to one of the Sodan and is captured and taken to their village. There he awaits a battle to the death as punishment for his crime.

SG-1 encuentra un híbrido Goa'uld-Humano en estasis en un laboratorio abandonado de los Goa'uld y lo llevan de vuelta a la Tierra para estudiarlo, donde descubren que fue creado utilizando el ADN de Anubis.

Los Ori desatan una plaga mortal en la Tierra, lo que lleva a un poderoso aliado del pasado de SG-1 a acudir en su ayuda.

La plaga continúa propagándose entre la población de Estados Unidos y el Presidente ha puesto en cuarentena a la nación. Teal'c está suplicando al Alto Consejo Jaffa que rechace el Origen, pero Gerak llega, habiendo sido transformado por los Ori en un Prior. Cameron y Daniel buscan la sangre del Prior que causó la plaga para curarla, pero una vez más han sido capturados por los Sodan.

On another planet, Mitchell is placed under arrest for the murder of a scientist.

SG-1 regresa temprano de una misión solo para darse cuenta de que ellos y el Gral. Landry no están en la misma página en lo que respecta a la misión que acaban de completar. La confusión se resuelve rápidamente cuando el "verdadero" SG-1 regresa en el momento correcto. La Dra. Lam los examina a todos y concluye que son idénticos y piensa que podrían ser clones. Sin embargo, Sam cree que podrían haber venido de un universo paralelo como resultado del agujero negro que crearon cuando destruyeron el punto de apoyo de los Ori. A medida que llegan más equipos de SG-1 de otros universos alternativos, uno de ellos incluye al Dr. Fraiser y otro incluye al Tok'ra Martouf. Queda en manos de Sam y Martouf encontrar una manera de enviarlos a todos a casa.

Un contacto dentro del Protectorado Rand llega a la Tierra con noticias de que los Ori le han entregado a su pueblo un superarma para usar contra la Federación Caledoniana a cambio de su conversión a Origin. SG-1 planea alejar a la gente de su nueva religión y destruir la superarma.

While investigating the source of an addictive corn-like crop, SG-1 becomes involved in a firefight. They are forced to fall back to the gate, but as Daniel is dialing both the Stargate and the DHD are beamed away.

SG-1 is tasked to accompany members of the International Oversight Advisory, including Richard Woolsey, on a tour of the Gamma site. The visitors are suitably impressed but everyone is put in danger when a carnivorous insect escapes from the lab. The base is locked down and no one is allowed to travel through the gate. The bug is linked to the Ori - it's appeared on several planets that they've visited - and Daniel thinks it may be their follow-up to the virus. SG-1 and the IOA visitors take refuge in a cave, but Gen. Landrey is left with little choice but to flood the planet with a deadly neurotoxin to destroy the bugs. SG-1 looks for away out before that happens.

Sam logra activar un dispositivo antiguo que encontraron en el sitio de Glastonbury y ella y Mitchell son trasladados a una fase que los hace invisibles para todos. Daniel pronto descubre qué está sucediendo, pero la solución propuesta por el Dr. Lee envía a Daniel al mismo plano que Sam y Mitchell. Allí, él es capaz de traducir información que explica que Merlín había creado un arma contra los Ori y proporciona una dirección de la puerta donde se puede encontrar. Mientras tanto, Teal'c viaja a un planeta Jaffa que ha enviado una llamada de socorro. Los dos eventos están relacionados.

Utilizando la tecnología de comunicación de los Antiguos, Vala, que se encuentra en la galaxia Ori, se pone en contacto con el SGC. Les cuenta que después de ser absorbida por el agujero de gusano, despertó en una cama en un pueblo muy parecido al que ella y Daniel habían visitado cuando usaron las piedras de comunicación. Los lugareños creen que ella cayó del cielo, un regalo de los dioses, y entabla amistad con el amable Tomin, un devoto seguidor de los Ori que tiene una pierna lesionada. Vala tiene dos informaciones para el SGC: en primer lugar, está embarazada aunque insiste en que no ha tenido relaciones sexuales con nadie; y en segundo lugar, los Ori han estado construyendo una flota de naves y fortaleciendo su ejército. Mientras tanto, el Coronel Chekov aconseja al General Landry que los rusos no renovarán su acuerdo de trabajo con los Estados Unidos y se llevarán su Stargate.

A medida que la invasión Ori continúa, Vala y Daniel deben lidiar con su líder, la joven hija de Vala, quien es envejecida rápidamente por los Ori para servir a sus propósitos.

Mientras Daniel y Vala buscan el arma anti-Ori de Merlín en la biblioteca de Atlantis, Mitchell, McKay y Carter intentan marcar la Supergate Ori en la Vía Láctea.

The SGC is approached by an Al'kesh bomber which lets itself be taken down, so they can capture Ba'al, who offers to exchange the necessary information to find Merlin's weapon for human help to eliminate his clones, which want to kill him. They mistrust his story, as does NID Agent Malcolm Barrett, who, however, fails to take over the investigation. Since the captive might actually be a clone, several missions to different planets retrieve and capture all clones, but which is the real Ba'al, and what are his true intentions?

Martin Lloyd busca la ayuda de SG-1 cuando su programa de televisión fallido basado en el programa real de Stargate se convierte en una película.

SG-1 queda atrapado en medio de una guerra después de que los Jaffa utilizan un arma poderosa para matar a 10.000 seguidores de Ori.

Vala es secuestrada por agentes de la Confianza que intentan encontrar un antiguo tesoro cuando un accidente hace que Vala olvide quién es.

Cameron Mitchell must go undercover inside the Lucian Alliance to find the location of the hijacked Odyssey.

SG-1 destruye tres naves de transporte seguidas; Netan pone precio a sus cabezas. El General Landry otorga tiempo libre a los miembros del equipo en la Tierra. Daniel lo aprovecha para investigar en una biblioteca, donde conoce a una cazadora de recompensas que intenta seducirlo, luego saca su arma... pero es atropellada por un autobús. Sam da una conferencia sobre el progreso tecnológico de la Fuerza Aérea junto al Dr. Bill Lee; un francotirador casi falla, pero es eliminado con un arma experimental que habían llevado para demostrar. Teal'c resulta herido por sorpresa en un campamento Jaffa y logra atrapar al asesino para intentarlo de nuevo. Cam va a su reunión de secundaria en Kansas y Vala logra convencerlo de llevarla, haciéndose pasar por su contadora y socia. Su antigua llama, todavía atractiva, Amy Vandenberg, a quien creía fuera de su alcance, al principio es asustada por Vala, pero, divorciada e interesada, explica que todavía tiene un secreto enamoramiento por él. El cazador de recompensas alienígena Odai Ventrell asume la apariencia de numerosos compañeros de clase para matarlo. El intento de rescate de Vala fracasa y ambos son capturados públicamente, por lo que él amenaza con matar a los invitados de la reunión a menos que los demás miembros de SG-1 ocupen su lugar, pero lo engañan usando tecnología Chimera; esperan que el fracaso de Netan en eliminarlos reavive la lucha de poder y Odai reacciona de manera sorprendente.

Teal'c and Bra'tac are among the numerous victims -though only wounded- of several bomb attacks killing 32 men at a summit in the Jaffa settlement Dar Eshkalon. As soon as physically able, Teal'c swears to avenge them personally, suspecting the honor-less, ambitious warrior Arkad; General Landry refuses to sanction a killing mission without solid proof, but cannot stop Teal'c from going it alone. Bra'tac explains Arkad's sinister past to Daniel, including the possibility of murdering Teal'c's mother. Information from the resistance on another planet indicates Arkad is in league with the Ori and plans to attack Earth. Arkad comes to meet General Landry, offering to help defend Earth against the Ori, denying any part in the bombings, while defending Origin, incriminating a Jaffa sect. SG-1 is now ordered to find and stop at all cost Teal'c, who is using torture. But Teal'c, committed to killing Arkad, reaches his place, but is wounded, captured, and made to duel Arkad after it is confirmed he had killed Teal'c's parents.

Stargate Command gets a video message from Vala's extremely unreliable father, Jacek, on the planet Robak; he claims to know about the late Arkad's plans to attack and blow up Earth, even about the several cloaked, Naquadah-laden cargo ships in orbit, and offers details in exchange for sanctuary. General Landry asks Dr. Lam to help him resume contact with her mother, Kim, his ex-wife. Even after the cargoes are found and blown up, Vala abhors her dad's entry. The general asks her to go easy on him, realizing that he, too, neglected his daughter because of his career, even if Jacek's neglect was just criminal. When Cam and Daniel go tell Jacek he shouldn't scam people, he tricks them into talking to Vala for him. Vala goes over just for catharsis, telling him she's through picking up the pieces of his tricks, and he certainly keeps scamming - as Daniel also finds - even with Terak, a Jaffa from an escaped cargo ship, who hopes to sell the Naquadah. When they are apprehended, Jacek promises to help track it and override the rigging of the cargo ship. The Jaffa wait for Jacek and Vala, intending to eliminate them now that Terak is gone, but SG-1 saves them. Since there never was an override, Jacek cheerfully flies away alone in the cargo ship, ignoring that his treachery was anticipated: it's a decoy.

El general Landry acompaña a SG-1 en una misión para recopilar el conocimiento de los Asgard. Sin embargo, cuando aparecen los Ori, Sam se ve obligada a evacuar a la tripulación. Landry y SG-1 se quedan a bordo, pero quedan atrapados e indefensos en un campo de dilatación temporal durante décadas.

Cuando el Stargate es teletransportado fuera de la SGC en medio de la noche, Teal'c queda atrapado en otro mundo. El Dr. Jackson y la Coronel Carter intentan recuperar la puerta.

Como el nuevo jefe del SGC, el General O'Neill empieza a sentir el peso de su responsabilidad y comienza a tener dudas sobre toda la idea, cuestionando su propia competencia.

El presidente ha pedido que un documentalista vaya a SGC para crear una película sobre sus operaciones. Su llegada es poco deseada para la mayoría y comienza a chocar con el personal de la base. Sin embargo, realiza sus entrevistas con SG-1 y los científicos empleados por SGC. Mientras tanto, un equipo SG en otro mundo encuentra los restos de una ciudad Antigua.

A medida que la flota de ataque de los Goa'uld se acerca a la Tierra, los cuatro miembros del equipo SG-1 son tomados prisioneros. Reciben ayuda de una fuente inesperada cuando Bra'tac, el mentor de Teal'c, revela que está a bordo. Apophis ha retrasado el ataque hasta que su hijo Klorel sea revivido, dándoles algo de tiempo para prepararse. SG-1 ha utilizado todo el C4 en una de las dos naves, pero deben encontrar una manera de deshacerse de la segunda. De regreso en el Comando Stargate, el Teniente Coronel Bert Samuels llega como oficial de enlace del Pentágono, pero también revela un nuevo arma que han desarrollado. El General Hammond está escéptico. Comienzan a transportar humanos a un sitio Alpha para asegurar la continuación de la humanidad.

SG-1 encuentra un híbrido Goa'uld-Humano en estasis en un laboratorio abandonado de los Goa'uld y lo llevan de vuelta a la Tierra para estudiarlo, donde descubren que fue creado utilizando el ADN de Anubis.

El SGC es contactado por una civilización humana alienígena avanzada y en guerra que busca ayuda militar, pero sus razones exactas para ello se vuelven cada vez más sospechosas.

En un planeta alienígena, SG-1 descubre que un androide inactivo es el único sobreviviente de la destrucción de su civilización. Lo llevan de vuelta al SGC para estudiarlo y logran reactivarlo. Las cosas toman un giro para peor cuando ella "crea" un insecto replicador para Daniel.