Cuando Mark Mardon alias El Mago del Tiempo regresa para liberar a Leonard Snart alias Capitán Frío y James Jesse alias Trickster de Iron Heights, Barry debe detener a estos villanos para que no tomen el control de Central City durante Navidad. Mientras tanto, Joe e Iris conocen a Wally West.

Ahora que se han vuelto más cercanos, Barry empieza a considerar contarle a Patty que él es Flash. Mientras tanto, Joe e Iris intentan conocer a Wally, y el equipo da caza a un meta-humano que puede ralentizar el tiempo en sí mismo.

Cuando Cisco tiene una vibración de Eobard Thawne, Barry y el equipo no se lo creen. Pero tras un ataque a Laboratorios Mercury, Christina McGee confirma que el Reverso de Flash ha vuelto. Mientras tanto, Iris y Francine comparten un momento agradable que acerca un poco más a Iris y a su hermano, Wally.

Barry forma equipo con Wells para encontrar una forma de cerrar las brechas, pero son distraídos por un meta-humano llamado Pozo de Brea que puede transformase en asfalto líquido. Iris está preocupada por la seguridad de Wally después de descubrir su afición a las carreras urbanas de coches. Cuando se niega a parar, ella hace un movimiento atrevido que la pone en peligro.

Barry, Wells y Cisco viajan a Tierra-2 para rescatar a la hija de Wells, Jesse de Zoom. Barry se sorprende cuando se topa con la versión Tierra-2 de Iris y Joe, pero nada lo prepara para conocer a Killer Frost y Deathstorm. Mientras tanto, de vuelta a Tierra-1, Jay tiene que hacerse cargo de las responsabilidades de Flash cuando un meta-humano llamado Geomancer ataca Central City.

En Tierra-2, el equipo se apresura para encontrar la guarida de Zoom y pide ayuda a la fuente más inesperada. Mientras tanto, de vuelta en Tierra-1, Caitlin se apresura para perfeccionar Velocidad-9 para que así Jay pueda detener a Geomancer.

Cuando Rey Tiburón escapa de un tanque de contención de A.R.G.U.S., Lila y Diggle viajan a Central City para advertir a Flash. Rey Tiburón aparece en la casa de los West y ataca a Joe, Iris, Wally y Barry.

Trayectoria llega a la ciudad con la intención de crear el máximo caos. Sus travesuras son malinterpretadas, como si hubieran sido perpetradas por el propio Flash. Barry debe descubrir rápidamente el misterio de quién es la chica bajo la máscara -, así como que está impulsando su loco deseo de velocidad y destrucción.

Después de la sorprendente revelación de la verdadera identidad de Zoom, Barry está más que motivado para volver a Tierra-2 y detenerlo para siempre. Desesperado por encontrar una manera de aumentar su velocidad, Barry decide viajar atrás en el tiempo y fingir ser su antiguo yo para que su archienemigo, el Dr. Harrison Wells / Eobard Thawne, le enseñe como correr más rápido. Sin embargo, las cosas no salen como estaban previstas y Barry se sorprende cuando aparecen un enemigo conocido, Hartley Rathaway, así como el viejo amigo Eddie Thawne. Iris hace las paces con su pasado para poder abrazar su futuro.

Equipado con el dispositivo de taquiones, Barry cree que es suficientemente rápido como para detener a Zoom y quiere abrir las brechas para atraparlo. Harry le advierte de lo peligroso que es ese plan pero después de que Barry lo convenza, Harry revela que Cisco tiene el poder de reabrir la brecha. Mientras tanto, la dolorosa historia de Hunter Zolomon se revela en Tierra-2.

Un meta-humano con super fuerza llamado Griffin Grey confunde a Harry con el Harrison Wells de Tierra-1 y lo secuestra, exigiendo que Wells lo cure de su condición actual. Dándose cuenta de que otra Wells podría ayudarle a encontrar a Griffin, Barry le pide a Jesse que le ayude. Mientras tanto, Wally arrincona a Joe sobre Flash.

Zoom llega de nuevo a Tierra-1 intentando hacerse con Central City. Barry y Wells trazan un plan para detener a Zoom de una vez por todas pero es extremadamente peligroso. Sin estar seguros de si deberían arriesgarse, Barry pide a sus dos padres consejo. Henry se opone rotundamente a que Barry arriesgue su vida otra vez pero Joe cree que puede lidiar con ello, lo que pone a los dos hombres en una situación complicada entre ellos. Mientras tanto, Cisco se sorprende cuando siente al villano de Tierra-2 Rupture, que resulta ser el doble de su hermano Dante. Rupture llega a esta Tierra buscando justicia por la muerte de Reverb. Iris decide que finalmente está lista para abrirse a Barry sobre sus sentimientos hacia él.

Con Barry fuera, el equipo debe encontrar una forma de lidiar con el regreso de un viejo enemigo, Girder. Dándose cuenta de que Girder está rehaciendo los pasos de su último ataque, Iris se ofrece voluntaria como cebo para atraparlo en Laboratorios S.T.A.R. Mientras tanto, Barry pelea para regresar a su antigua vida.

Después de que Zoom desate un ejército de metahumanos de Tierra-2 en Central City, Barry se queda impactado cuando ve que su líder es la doble de Tierra-2 de Black Canary, Black Siren. Mientras tanto, Wally sale a las calles para ayudar a Flash a detener a los metahumanos, lo cual preocupa a Joe. Iris y Henry están preocupados por Barry enfrentándose a Zoom.

Con el verdadero plan de Zoom revelado, el Equipo Flash teme la determinación de Barry de hacer lo que sea necesario para detenerlo.

El Reverse-Flash se burla de The Flash y advierte de las repercusiones si Barry continúa olvidando su vida anterior. Cuando ocurre un desastre, Barry debe decidir si vivir como Barry Allen o regresar a su universo como The Flash.

Barry descubre que los efectos del Flashpoint son mucho mayores de lo que pensó. Cuando conoce a su nuevo compañero de trabajo, Julian, queda sorprendido por el desdén inmediato de Julian.

A Wells le preocupa la seguridad de Jesse, y habla con Barry y Catlin para que le digan que no utilice sus poderes de súper velocidad. Además, Magenta utiliza su poder de control mental para aterrorizar a la ciudad.

El Maestro de los Espejos quiere, con la ayuda de Top, ajustar cuentas con Snart. Jesse se une a la cacería, pero la decisión de desobedecer las órdenes de Barry traerá terribles consecuencias.

Caitlin visita a su madre con la intención de que ella la ayude a comprender sus superpoderes, los cuales son cada vez más intensos. Mientras, Barry trata de convencer a Julian de que le deje investigar a un metahumano que está atacando Central City.

Wally tiene visiones en las que se ve como Kid Flash. Barry debe contarle lo que ocurrió en Flashpoint a fin de mantenerlo a salvo.

Caitlin usa sus poderes para salvar a Barry pero tal y como su madre predijo, el esfuerzo desata a su Killer Frost interior. Killer Frost va a la carga buscando al Dr. Alchemy, secuestrando a Julian y peleando contra Flash y Vibe. Mientras tanto, Joe y H.R. mantienen una conversación a corazón abierto.

Cuando los alienígenas llamados "Los Dominadores" atacan Central City, Barry va Star City para pedir ayuda a Flecha Verde para detenerlos. Al darse cuenta de que la batalla contra los dominadores es más grande de lo que pensaban, rastrean las leyendas del mañana y Barry y Cisco crean una brecha para traer de vuelta un arma secreta: Supergirl. Una vez que todos los súper amigos están reunidos, se presentan con un plan para atacar, pero un secreto impactante relacionado con Flashpoint se revela y de repente nadie está seguro en quien pueden confiar. Mientras tanto, Wally quiere unirse a la batalla contra los alienígenas, pero Iris le dice que no está listo.

Con Alquimia y Savitar todavía como amenazas crecientes, Barry es incapaz de centrarse en las vacaciones de Navidad y, especialmente, en su relación con Iris. Decidido a detener a Savitar, Barry viaja a Tierra-3 para obtener consejo de Jay Garrick. Wally quiere ayudar a Barry en la lucha contra Savitar y revela que ha estado entrenando con H.R., algo que no le gusta nada a Barry. Mientras Cisco enfrenta su primera Navidad sin su hermano Dante, viejas heridas se vuelven a abrir.

Barry sigue atormentado por su visión del futuro en el que Iris es asesinada por Savitar. Cuando un criminal llamado Plunder aparece en Central City, Barry recuerda la presencia del villano en su visión del futuro y teme que si captura a Plunder, eso cimentará el destino de Iris. Confundido sobre sus dudas por detener a Plunder, Wally decide dar un paso adelante como Kid Flash. Caitlin ofrece a Julian un trabajo.

El pasado de H.R. se encuentra con él cuando una cazarrecompensas con poderes vibratorios llamada Gypsy llega a Central City para llevarlo de vuelta a Tierra-19 para enfrentarse al juicio por su crimen. Resulta que los viajes interdimensionales son ilegales en Tierra-19. H.R. se rinde pero cuando Barry y Cisco descubren que la única esperanza para H.R. sería retar a Gypsy en una batalla a muerte, ellos interceden y Cisco se ofrece a pelear contra Gypsy.

Barry y el equipo de Laboratorios S.T.A.R. trabajan juntos para acabar con Clive Yorkin, un meta-humano criminal que está asesinando gente de forma metódica causando que se descompongan a ritmo acelerado. Joe se convierte en su próximo objetivo pero es Iris la que se ve en medio del fuego cruzado. Flash hace de mentor para Kid Flash y empieza a elevar el entrenamiento de velocista hasta otro nivel.

Cuando Jesse Quick informa al equipo de que su padre ha sido secuestrado, Barry, Caitlin, Cisco y Julian viajan a Tierra-2 en una misión de rescate para salvar a Harry de Gorilla City. Mientras se adentran en el bosque, Barry y el equipo son capturados inmediatamente y llevados ante Grodd. Grodd les cuenta que necesita su ayuda para detener a Solovar, el líder de Gorilla City, ya que Solovar quiere invadir Tierra-1. Mientras tanto, de vuelta en Tierra-1, Jesse y Kid Flash van a las calles a detener a un metahumano que puede controlar la gravedad, con H.R. y Joe guiándoles desde Laboratorios S.T.A.R.

Grodd y su ejército traen la batalla a la Tierra-1, algo que el equipo The Flash debe evitar a toda costa.

Mientras está entrenando con Barry , Wally empieza a tener visiones de Savitar, algo que esconde del equipo. Un peligroso secreto amenaza la felicidad de Barry e Iris.

Desesperado para detener a Savitar y salvar a sus amigos, Barry va a la Fuerza Veloz en busca de respuestas. H.R. le da a Jesse algunos consejos.

Music Meister envía a Supergirl y a Flash a un mundo en el que la vida es un musical. La única forma de escapar de él es cantando y bailando.

Flash pelea contra Abra Kadabra, un villano de Tierra-19 que le hace una oferta tentadora – si lo deja marchar Abra Kadabra le revelará la verdadera identidad de Savitar. Desesperado para salvar a Iris, Barry considera aceptar el acuerdo pero Gypsy aparece para capturar al villano por sus propias razones y durante la pelea Abra Kadabra consigue escapar. Barry está furioso con la interferencia de Gypsy pero ella se niega a dar un paso atrás, forzando a que Cisco elija un bando. Mientras tanto, Julian todavía se mantiene algo frío con Caitlin pero cuando ella queda herida de gravedad en la batalla contra Gypsy, se apresura a su lado.

Barry viaja en el tiempo hasta el año 2024 para tratar de descubrir la identidad de Savitar y salvarle la vida a Iris.

Barry y el equipo conocen a Tracy Brand, una científica que podría ser la clave para detener a Savitar. Desafortunadamente, Killer Frost también va tras Tracy, así que el Team Flash deberá pelear contra su vieja amiga, lo que demuestra ser particularmente difícil para Cisco. La relación de Joe y Cecile da un gran giro.

Barry toma medidas drásticas para detener a Savitar. Mientras tanto, H.R. continúa presionando a Tracy Brand para diseñar la trampa para Savitar y Killer Frost regresa con una interesante propuesta.

A tan solo 24 horas de que Savitar asesine a Iris, Barry pelea para poder salvar la mujer a la que ama y decide hacer todo lo necesario para conseguirlo. Dándose cuenta de que tiene una opción para salvarla, Flash va en busca de la ayuda de Capitán Frío.

Sin nada que perder, Barry se enfrenta a Savitar en una conclusión épica de la tercera temporada.

Con Barry en la fuerza de velocidad, Kid Flash, Joe y Vibe deben proteger a Ciudad Central; un villano poderoso amenaza el nivel de la ciudad si Flash no aparece.

Barry se encarga de un metahumano peligroso que puede controlar la tecnología; Gypsy no asiste a una cita con Cisco; se enoja cuando su trabajo los separa.

Barry y el equipo experimentan una serie de hechos de mala suerte y descubren que son causados por un nuevo mutante; Harry Wells regresa a la Tierra-1 para darle a Wally un mensaje de Jesse.

Barry se encuentra cara a cara con DeVoe, cuyo pasado es revelado a través de 'flashbacks'.

El equipo Flash recibe ayuda de un aliado sorprendente en su batalla contra DeVoe.

Después de que una invitada inesperada del futuro, Nora West-Allen, aparece en su casa, Barry e Iris deben descubrir cómo hacer que vuelva al futuro sin interrumpir la línea de tiempo ... incluso más de lo que ya está. El Equipo Flash debe trabajar en conjunto para devolver a Nora, mientras que al mismo tiempo lucha contra otro meta villano.

Kid Flash regresa a Central City con una actitud zen y nuevos trucos bajo la manga. Mientras está emocionado de ver a su familia nuevamente, Wally le confiesa a Barry que regresó porque piensa que hay algo mal con la fuerza de la velocidad. Cisco regresa de su misión de investigación en Tierra-Prima.

El equipo Flash organiza una fiesta sorpresa para Barry, pero las cosas se tuercen cuando aparece Ramsey Rosso.

Kid Flash regresa a Central City con una actitud zen y nuevos trucos bajo la manga. Mientras está emocionado de ver a su familia nuevamente, Wally le confiesa a Barry que regresó porque piensa que hay algo mal con la fuerza de la velocidad. Cisco regresa de su misión de investigación en Tierra-Prima.

Mientras está entrenando con Barry , Wally empieza a tener visiones de Savitar, algo que esconde del equipo. Un peligroso secreto amenaza la felicidad de Barry e Iris.

Barry y el equipo de Laboratorios S.T.A.R. trabajan juntos para acabar con Clive Yorkin, un meta-humano criminal que está asesinando gente de forma metódica causando que se descompongan a ritmo acelerado. Joe se convierte en su próximo objetivo pero es Iris la que se ve en medio del fuego cruzado. Flash hace de mentor para Kid Flash y empieza a elevar el entrenamiento de velocista hasta otro nivel.

El equipo Flash organiza una fiesta sorpresa para Barry, pero las cosas se tuercen cuando aparece Ramsey Rosso.

Barry sigue atormentado por su visión del futuro en el que Iris es asesinada por Savitar. Cuando un criminal llamado Plunder aparece en Central City, Barry recuerda la presencia del villano en su visión del futuro y teme que si captura a Plunder, eso cimentará el destino de Iris. Confundido sobre sus dudas por detener a Plunder, Wally decide dar un paso adelante como Kid Flash. Caitlin ofrece a Julian un trabajo.

Wally tiene visiones en las que se ve como Kid Flash. Barry debe contarle lo que ocurrió en Flashpoint a fin de mantenerlo a salvo.

Cuando los alienígenas llamados "Los Dominadores" atacan Central City, Barry va Star City para pedir ayuda a Flecha Verde para detenerlos. Al darse cuenta de que la batalla contra los dominadores es más grande de lo que pensaban, rastrean las leyendas del mañana y Barry y Cisco crean una brecha para traer de vuelta un arma secreta: Supergirl. Una vez que todos los súper amigos están reunidos, se presentan con un plan para atacar, pero un secreto impactante relacionado con Flashpoint se revela y de repente nadie está seguro en quien pueden confiar. Mientras tanto, Wally quiere unirse a la batalla contra los alienígenas, pero Iris le dice que no está listo.

Después de que Zoom desate un ejército de metahumanos de Tierra-2 en Central City, Barry se queda impactado cuando ve que su líder es la doble de Tierra-2 de Black Canary, Black Siren. Mientras tanto, Wally sale a las calles para ayudar a Flash a detener a los metahumanos, lo cual preocupa a Joe. Iris y Henry están preocupados por Barry enfrentándose a Zoom.

A Wells le preocupa la seguridad de Jesse, y habla con Barry y Catlin para que le digan que no utilice sus poderes de súper velocidad. Además, Magenta utiliza su poder de control mental para aterrorizar a la ciudad.

El Reverse-Flash se burla de The Flash y advierte de las repercusiones si Barry continúa olvidando su vida anterior. Cuando ocurre un desastre, Barry debe decidir si vivir como Barry Allen o regresar a su universo como The Flash.