En un vecindario suburbano feliz, se encuentra una casa negra con un césped muerto y, escondido debajo de esta casa, hay un gran escondite secreto. Rodeados por un pequeño ejército de secuaces, descubrimos a Gru, planeando el mayor atraco en la historia del mundo. Él va a robar la Luna. Gru se deleita en todas las cosas malas. Armado con su arsenal de rayos retráctiles, rayos congelados y vehículos listos para la batalla por tierra y aire, vence a todos los que se interponen en su camino. Hasta el día en que se encuentra con la inmensa voluntad de tres niñas huérfanas que lo miran y ven algo que nadie más ha visto nunca: un papá en potencia. El villano más grande del mundo acaba de enfrentar su mayor desafío: tres niñas llamadas Margo, Edith y Agnes.

Mucho antes de convertirse en un genio del mal, Gru no era más que un chaval de 12 años en plenos años 70 tratando de conquistar el mundo desde el sótano de su casa de un barrio residencial cualquiera. Y no le iba demasiado bien. Pero cuando Gru se cruza en su camino con Kevin, Stuart, Bob, y Otto —un nuevo Minion con aparato en los dientes y desesperado por sentirse aceptado—, esta inesperada familia unirá fuerzas para construir su primera guarida, diseñar sus primeras armas y llevar a cabo sus primeras misiones.

Gru conoce a su hermano gemelo perdido, encantador, alegre y más exitoso, Dru, que quiere unirse a él para un último atraco criminal.

Cuando la reina del mundo submarino de Atlantis se enamora de un humilde farero, su hijo, Arthur Curry, que posee genes mitad humano y mitad Atlantea, descubre que él es el heredero de la Atlántida y que un verdadero héroe se encuentra en lo más profundo.

Shrek y Fiona viajan al Reino de Far Far Away, donde los padres de Fiona son el rey y la reina, para celebrar su matrimonio. Cuando llegan, descubren que no son tan bienvenidos como pensaban que serían.

Instalado en su vida matrimonial y totalmente domesticado, Shrek empieza a extrañar los días en los que él se sentía como un verdadero ogro. Engañado para firmar un contrato con el tortuoso Rumpelstiltskin, él se encuentra a sí mismo en una versión alterna de Muy Muy Lejano, donde los ogros son cazados, Rumpelstiltskin manda, y él y Fiona nunca se conocieron. Shrek debe hallar la forma de cancelar el contrato para restaurar su mundo y reclamar su amor verdadero.

Cuando el Rey Harold enferma, Shrek y la Princesa Fiona descubren que tendrán que dirigir la Tierra Muy Muy Lejana a menos que puedan encontrar al Príncipe Artie, el verdadero heredero, y llevarlo a casa. Desafortunadamente, no tiene interés en ser rey; no obstante, Shrek, Burro y el Gato con Botas planean recuperarlo. Mientras tanto, la Princesa Fiona le pide ayuda a sus compañeras heroínas para alejar del trono al Príncipe Encantador.