Capitán Tom Chandler y la tripulación del USS Nathan James partieron hacia el Ártico con dos virólogos civiles, Dr. Rachel Scott y el Dr. Quincy Tofet, que afirman estar estudiando las aves. Cuando son atacados por un grupo de renegados de las fuerzas rusas, Chandler se entera de estos virólogos están recolectando en realidad muestras de la fuente de un virus mortal que ha acabado con más de la mitad de la población humana, mientras que han estado en el mar. Mientras se dirigen a casa bajo las órdenes del gobierno de Estados Unidos restante, Chandler y su equipo se dan cuenta de que el hogar es una sombra de lo que fueron, y el lugar más seguro para desarrollar una vacuna para esta enfermedad mortal es en el mar en su barco.

Días después de una serie tratando de eventos en Guantánamo, Chandler y su equipo se ponen bajo coacción extrema al sistema de propulsión de la nave sufre un evento catastrófico. Con el Dr. Scott en peligro de perder toda su investigación sobre el virus y una tripulación con exceso de trabajo, muy cansado y desesperadamente bajo sobre el agua potable, el liderazgo y el ingenio de Chandler se ponen a prueba.

Con Rachel cerca de un gran avance en su vacuna, ella, Chandler y XO Slattery llevan un pequeño equipo en las selvas de Nicaragua en una misión para encontrar monos para sus ensayos de vacunas. Una vez allí, se encuentran con mucho más de lo que esperaban cuando se ejecutan a través de un ex capo de la droga que no se detendrá ante nada para mantener su dominio absoluto sobre su sociedad oprimida. Chandler y sus hombres se encuentran en un gran dilema moral sobre si se debe eliminar esta amenaza o toman lo que necesitan y continuar con su misión.

Rachel y Chandler piden seis voluntarios que participan en los ensayos en humanos de la vacuna, pero las pruebas podrían ser un infierno como el virus y la vacuna luchan dentro de sus cuerpos. Mientras tanto, en los Estados, la esposa y el padre de Chandler están haciendo todo lo posible para mantener viva su familia.

Chandler y su equipo finalmente vuelve a casa, donde un ex jugador de alimentación de CC está defendiéndose de un señor de la guerra peligrosa que pone en peligro sus esperanzas de restaurar la ley y el orden en la sociedad. Ahora, con una ubicación y un medio para finalizar su misión, Chandler se dispone a salvar a su familia de morir, sólo para descubrir algo absolutamente aterrador acerca de este nuevo mundo.

Con ayuda de la resistencia, Chandler avanza con su plan de sabotear la planta de suministro de energía e infiltrarse en Avocet. Por su parte, la tripulación lucha por recuperar el control del barco y Granderson se queda sin alternativas.

El Nathan James regresa a Norfolk con la misión de producir y distribuir la cura. Con su familia sana y salva a bordo del buque, Chandler envía a la tripulación en busca de sus seres queridos.