Tras décadas de estancamiento, la Humanidad se dispone a investigar el Universo. La tripulación del Enterprise NX-01, al mando del capitán Jonatahan Archer (Scott Bakula), parte en su viaje espacial, con gran disgusto de la Vulcaniana, que considera que la Humanidad no está preparada. A la tripulación se une la subcomandante T'Pol (Jolene Blalock), una vulcaniana cuya relación con el capitán es en un primer momento algo más que tirante. También conoceremos en este capítulo a la alférez Hoshi Sato (Linda Park) la oficial de comunicaciones, al comandante Charlie 'Trip' Tucker III (Connor Trinneer) el jefe de ingeniería, al oficial médico jefe el doctor Phlox (John Billingsley), al alférez Travis Mayweather (Anthony Montgomery) el timonel y al teniente Malcolm Reed (Dominic Keating) encargado de las armas de la nave. La misión del Enterprise es transportar a un Klingon herido a su planeta, después del primer contacto de éstos con los humanos. Pero los Suliban raptan al Klingon . La tripulación del Enterprise dispuesta a rescatar a su pasajero llega al sistema Rigel, último sistema visitado por su pasajero Klang (Tommy "Tiny" Lister, Jr), para buscar información sobre sus captores, el equipo de descenso es capturado por ex soldados Sulivan, estos eran el contacto de Klang en Rigel, estos explican a Archer la situación del Imperio Klingon y la misión de Klang, son atacados y han de salir por piernas de rigel, esto les sirve para encontrar la base de los Sulivan, donde probablemente se encuentre Klang, intentara rescatarlo, pero ¿a que precio?

Mientras el capitán Archer se ducha comienzan a surgir problemas con los paneles de gravedad de la cubierta E que son subsanados rápidamente. Otros problemas surgen con la comida, con la temperatura, fluctuaciones de energía, etc. El jefe de ingeniería Trip Tucker determina que el flujo del extractor del plasma de la nave está siendo limitado por alguna razón afectando a muchos sistemas de la nave. Salen de velocidad warp y T'Pol localiza una distorsión en la estela de la nave que les hace encontrar una nave camuflada en su estela. Al descubrirlo entran en contacto con ellos contestan distanciándose como les ordenaron y solicitando que no les ataquen. Explican que sus motores están averiados y los utilizaban para poder viajar. Al desconectar el sistema de camuflaje muestran su buena voluntad. Trip debe ayudar a la nave extraterrestre durante tres días en las reparaciones a las que ha de someterse arreglando sus problemas de propulsión. Pero antes de entrar ha de pasar un periodo de decomprensión que le hace pasar bastante mal rato. En la sala de máquinas empieza a encontrarse mal, con falta de concentración y síntomas de fiebre, y Trena'l (Randy Oglesby), el capitán de la otra nave, aconseja que el ingeniero descanse para así poder aclimatarse mejor. Archer le ordena dormir por lo menos una hora y Trip cumple la orden a regañadientes. Cuando despierta se encuentra bastante mejor y charla amigablemente con una de las alienígenas de la otra nave, la ingeniera Ah'len (Julianne Christie), pero al tocarse saltan chispas entre ambos y ella le explica que es algo normal. Su nueva amiga le muestra su planeta Vera mediante un holograma, hasta la tierra del suelo parece real gracias a fotones resecuenciados; la imagen cambia y están en el mar en un bote , allí le invita a jugar con un bol lleno de gránulos donde ambos sumergen las manos (hacen falta 4 manos para jugar) y les permite leerse las mentes. Regresa a la Enterprise encantado con lo que ha

Cuando Archer y Meryweather despiertan, se encuentran rodeados de prisioneros y de Sulibans. Pronto descubren que los Suliban no son más libres que ellos mismos. En este campo de prisioneros, que no es el único que existe, hay retenidos 89 Suliban, que no han hecho nada malo, sólo que eligieron unos padres equivocados. Allí viven niños a los que los padres reparten en dos partes del campo, "por su propia seguridad". Cuando el oficial al mando del campo comienza a hacer preguntas a Archer sobre la Cabal y a presionarle, ambas partes, hombres y Suliban, han de dejar de lado sus prejuicios, y comienza una espectacular operación de salvamento...

El Enterprise se aproxima a una colonia minera de una especie desconocida para reaprovisionar las reservas de deuterium de la nave. Exigiendo un precio desorbitado, los vendedores sólo están dispuestos a suministrarles 100 m de deuterium. Pronto se sabrá la razón, cuando aparece un carguero Klingon. Archer observa la conversación y pronto se da cuenta de que la culpa de este absurdo no es de los nativos, sino de los Klingon. Éstos extorsionan a los colonos desde hace 5 años más de 100.000 m de deuterio al año. En caso de que los colonos no cumplan lo exigido, matan a sus familias y destruyen sus casas. Archer decide ayudar a los colonos a su manera...

La Enterprise acaba de descubrir un planeta con una extraordinaria riqueza de fauna y flora, y un cañón cinco veces más profundo que el Cañón del Colorado. Además, sólo oscurece cuatro veces al mes: sus dos soles obran el milagro. La próxima semana se anuncia pródiga, no sólo en resultados sorprendentes, sino también en posibilidades de hacer rafting por los ríos y otras muchas cosas. Sin embargo, la alegría no durará mucho. En mitad de los preparativos, les interrumpe la llamada de una nave. El único deseo de su tripulación: que los traigan a bordo para huir tan pronto como sea posible a velocidad warp 7. Una tempestad radiactiva se aproxima a esa velocidad . El problema es que la Enterprise sólo alcanza la velocidad warp 5...

Una sonda proveniente de una fuente alien desconocida libera un ataque que devasta la Tierra. La nave es llamada, y camino a casa el Capitán Archer descubre que los perpetradores vienen de una región del espacio conocida como la Expansión de Delphicun lugar donde cosas muy raras pasan, y de que algunas naves que entran nunca retornan. Starfleet debe decidir ahora si arriesgarse enviando los NX-01 a la Expansión de Delphic para prevenir un posible segundo ataque.

Archer se pregunta qué hace un asentamiento humano del siglo 19 en un planeta de la expansión Délfica.

Acher va en una misión suicida para destruir el sitio de construcción de la super arma Xindi, mientras la Enterprise está bajo ataque.

Un grupo peligroso de humanos mejorados genéticamente llamados Augments escapan de un planeta prisión. Buscan crear una guerra entre Klingons y humanos. La enterprise es alistada junto al criminal Dr. Arik Soong, creador de estos superhombres, para cazarlos.