Seis meses después del final del primer libro, Korra ha dominado Aire Control, Mako trabaja como policía, Bolin va mal en el pro-control con los nuevos Hurones de Fuego, y Asami trata de mantener a flote Industrias Futuro. Junto con Tenzin, los amigos de Korra y la familia de Tenzin van a la Tribu Agua del Sur. Después de que el tío de Korra, el jefe Unalaq, fácilmente repele el ataque de un espíritu enojado, Korra lo elige a él en lugar de Tenzin como su maestro espiritual.

Korra, Mako, Bolin, Tonraq, Unalaq y sus hijos Desna y Eska viajan al Polo sur, donde Korra abre un portal en el mundo de los espíritus para lanzar las luces meridionales.

Las tropas de Unalaq toman el Sur en un intento de equilibrar el mundo de los espíritus con el de los humanos, pero el descontento creciente lleva a que una inevitable guerra civil empiece a formarse. Mientras, Tenzin discute con sus hermanos sobre sus vidas.

Los padres de Korra son arrestados por Unalaq que los acusa de querer asesinarlo, en el juicio la madre de Korra es liberada pero su padre y el resto de los rebeldes son sentenciados a prisión de por vida. Korra descubre que su tío lo planeó todo y que también fue quien causó que su padre fuera desterrado, con la ayuda de sus amigos y Varrick, Korra logra salvar a su padre y a los rebeldes, junto a ellos, deberá volver a Ciudad República para pedir ayuda para vencer a su tío Unalaq.

Korra llega al templo del aire donde se encontraban Tenzin, Kya, Bumi y la familia de Tenzin. Korra le cuenta a Tenzin lo sucedido y también cree que su tío Unalaq planea liberar a Vaatu, el espíritu del caos y la oscuridad que el Avatar Wan encerro en el mundo de los espíritus, como el portal del sur esta custodiado por las tropas de Unalaq, Korra planea entrar en el mundo de los espíritus y cerrar el portal. Mientras tanto, Unalaq y sus hijos, Eska y Desna, van al mundo de los espíritus e intentan abrir el portal del norte, Desna es herido gravemente y Eska lo lleva al mundo físico para curarlo, pero Unalaq se queda intentando abrir el portal sin tener éxito. En el templo del aire, Tenzin intenta ayudar a Korra a entrar en el mundo de los espíritus, pero no logra hacerlo, su conexión con los espíritus no era lo suficientemente fuerte. Jinora demuestra tener una gran conexión con ellos y llegan a un antiguo círculo de meditación de los maestros aire pero son atacados por espíritus oscuros. Korra utiliza las técnicas que aprendió en el polo sur y por primera vez fue capaz de lograr calmaros. Tenzin sigue tratando de entrar en el mundo de los espíritus pero Kya le dice que no puede, sin embargo, Jinora si, y que debe ser ella quien ayude a Korra. Tenzin se niega, pero tras una conversación con su hija, acepta. Korra y Jinora logran entrar al mundo de los espíritus.

Después entrar existosamente en el mundo de los espíritus con Jinora, Korra debe aprender cómo manejar las relaciones conflictivas entre los espíritus, así como lo hizo el Avatar Wan hace 10,000 años. Luego de que las dos se separan, Korra, luego de transformarse en una versión más joven de sí misma, es instruida por Iroh, el tío del Señor del fuego Zuko en la serie anterior, respecto a como mantener la paz. Mientras tanto, Jinora encuentra la biblioteca de Wa Shi Tong, en donde descubre dónde están ubicados los portales y cómo cerrarlos. Después que Korra regresó a su edad original, cuando está a punto de marcharse, es atrapada por Unalaq. En un intento por salvar a Jinora, Korra es engañada por Unalaq para conseguir que abra el portal del norte. Tras una batalla, Korra es rescatada por el gran espíritu fénix y sale del mundo de los espíritus, sin Jinora, quien queda como prisionera de Unalaq en el mundo espiritual.

Korra y sus amigos viajan hacia el Polo Sur. Sin embargo, descubren que la resistencia de los habitantes del Sur ha sido eliminada y Tonraq capturado. La situación se les complicaba, el cuerpo de JInora se debilitaba lentamente sin su espíritu. Con tan solo unas horas para que la Convergencia Armónica inicie, Korra y sus amigos no tienen más opción que atacar directamente en la fortaleza que el ejército del Norte ha construido en el Sur. Desafortunadamente, son incapaces de derrotar a la Tribu del Norte y todos son capturados, a excepción de Bumi, quien se las arregla para infiltrarse en el campamento e inadvertidamente desencadena una serie de eventos que destruyen la fortaleza entera, luego libera a Korra y a sus amigos quienes van en busca de Unalaq, este revela que no solamente planea liberar a Vaatu, sino que también se fusionará con éste para convertirse en un Avatar Oscuro que dominará el mundo. A pesar de sus grandes esfuerzos, Korra no alcanza a detener la Convergencia Armónica, y Vaatu se libera de su prisión.

Con Vaatu libre, Korra intenta encerrarle nuevamente en su prisión mientras Mako y Bolin tratan de impedir que Unalaq se fusione con Vaatu. Sin embargo, con la ayuda de Desna y Eska, Unalaq supera a Mako y a Bolin, lucha con Korra y finalmente se fusiona exitosamente con Vaatu. Korra y Unalaq comienzan a luchar estando cada uno en su respectivo Estado Avatar. Mientras tanto, en el mundo de los espíritus, Tenzin y sus hermanos se encuentran con Iroh, quien les da una pista sobre cómo encontrar a Jinora. Así pues, Tenzin se adentra en la Niebla de las Almas Perdidas, un valle cubierto de niebla que lleva a los humanos atrapados allí a la locura tras sucumbir ante sus propias dudas interiores. Kya y Bumi sucumben rápidamente a la niebla y Tenzin por poco lo hace también, pero se encuentra con el espíritu de Aang, quien le dice que debe dejar de intentar ser el reflejo de Aang y simplemente debe ser él mismo. Tras despejar sus dudas internas, Tenzin logra disipar la niebla temporalmente y rescata a Jinora y a sus hermanos. Sin embargo, Jinora se da cuenta de que Vaatu ha sido liberado y se va con el fin de ayudar a Raava. Mako y Bolin logran convencer a Eska y a Desna para que se vuelvan en contra de Unalaq y los liberen. Desafortunadamente, Korra es superada por Unalaq, quien saca a Raava de su cuerpo y la destruye, rompiendo la conexión de Korra con los avatares pasados. Con Raava destruida, Unalaq se transforma en un monstruoso espíritu oscuro gigante y se teletransporta al mundo material.

Tenzin y sus hermanos llegan al portal y encuentran a Korra y a sus amigos heridos e inconscientes. Tras ser sanados por Kya, Korra cree que ha fallado en su misión, y que con Raava destruida, el ciclo se ha roto y ella es la última Avatar. Unalaq aparece en Ciudad República y ataca, acabando con las defensas de la ciudad así como con la estatua de Aang. Durante el ataque, la celda donde Varrick se encuentra prisionero es afectada, lo cual le permite escapar. En el mundo espiritual, Tenzin guía a Korra hacia el Árbol del Tiempo y le dice que medite dentro de él. Mientras lo hace, Korra libera su energía espiritual más interna y su espíritu se transforma en un gran espíritu de luz azul que se teletransporta a Ciudad República para luchar contra Unalaq. Tras recordar lo que Raava le dijo al Avatar Wan sobre la luz y la oscuridad, que una no puede existir sin la otra, Korra intenta extraer el fragmento de Raava que se encuentra oculto en el interior de Vaatu. En ese momento, el espíritu de Jinora aparece e ilumina el fragmento de la renacida Raava al interior de Vaatu, antes de regresar a su propio cuerpo. Ahora, sabiendo dónde atacar, Korra saca a Raava del interior de Vaatu y lo purifica, destruyendo a Unalaq en el proceso. Tenzin, Kya, Bumi, Mako y Bolin permanecen en el mundo de los espíritus para proteger el cuerpo de Korra de los espíritus oscuros, luego Eska y Desna se les unen. Están a punto de ser superados, cuando el espíritu de Korra y Raava regresan, acabando con todos los espíritus oscuros. Sin embargo, en vez de cerrar los portales espirituales, Korra decide que permanezcan abiertos, pensando que los espíritus y los humanos están destinados a coexistir y que el Avatar Wan cometió un error al cerrar los portales. Más tarde, Korra le revela a Mako que ha recuperado el recuerdo de su rompimiento, y ambos deciden terminar con su relación sentimental para bien. Finalmente, El Avatar Korra declara que el mundo ha cambiado para siempre y

Después de los acontencimientos de la Convergencia Armónica, la Avatar Korra descubre que su decisión de dejar los portales espirituales abiertos tiene consecuencias inesperadas. Salvajes enredaderas espirituales crecen por toda Ciudad República y comienzan a surgir controladores del aire por todas las naciones.

Korra, Tenzin y el equipo del Avatar buscan nuevos controladores del aire en un esfuerzo por reconstruir la Nación del aire. Mientras tanto, una banda de siniestros criminales se organiza para cazar a la Avatar.

El grupo busca controladores del aire durante su travesía hasta Ba Sing Se.

Korra descubre que la Reina de la tierra ha encarcelado a controladores del aire para crear un ejército. Jinora lidera una investigación mediante su proyección espiritual. Lin se une al equipo de la Avatar.

Tenzin, mientras lucha contra la mala actitud de Bumi, trata de entrenar a los nuevos miembros de la Nación del aire.

Ba Sing Se a entrado en caos, mientras tanto Mako y Bolin salen de ella en un dirigible robado junto con su familia en busca del Avatar Korra. En el desierto Si Wong logran encontrar en rastro de Korra que los guían al oasis de las palmeras con neblina, al llegara le dan el ultimátum de Zaheer a Korra el cual es destruir a la nación aire, el grupo intenta llamar al Templo Aire del Norte pero no logran contactarlos y van a Zaofu, allí el grupo logra contactar al templo pero es muy tarde ya que Zaheer ha llegado. En el templo, los maestros aire son arrinconados pero logran liberarse de ellos, en eso inicia un gran lucha entre Zaheer, Ming-Hua y Ghazan contra Bumi, Kya, Kai y Tenzin pero son finalmente derrotados. Kai casi se sacrifica a si mismo para ayudar a los demás maestros aire a llega a los establos de bisontes , P'Li logra acorralar a todos los maestros.

Después de sucumbir al veneno , Korra entra al Estado Avatar y pelea contra Zaheer, mientras Bolin y Mako pelean con Ghazan y Ming-Hua. Los miembros captivos de la nueva Nación del Aire escapan y se juntan para ayudar a Korra terminar con Zaheer, a quien logran recapturar. Pero, el veneno forza dentro del cuerpo de Korra la forzan a estar en una silla de ruedas y el joven Avatar entra a un estado de depresión. Jinora es hecha maestra aire por Tenzin, que también dice que la nueva Nación del Aire regresará a ser nómadas y servirán como representantes de balance y paz.

Korra ha regresado a Ciudad República, aunque se siente decepcionada de no haber podido derrotar a Kuvira. El príncipe Wu es secuestrado pero el viejo equipo Avatar logra rescatarlo al mismo tiempo que aclaran malentendidos del pasado. Varrick y Bolin ahora son traidores del Imperio Tierra y se topan con un grupo de refugiados los cuales resultarán ayudándose unos a otros. Kuvira sigue con su plan de desarrollar la súper arma de raíces espirituales y para ello acude al pantano donde prentende destruir un elemento de gran importancia.

Korra y sus amigos viajan hacia el Polo Sur. Sin embargo, descubren que la resistencia de los habitantes del Sur ha sido eliminada y Tonraq capturado. La situación se les complicaba, el cuerpo de JInora se debilitaba lentamente sin su espíritu. Con tan solo unas horas para que la Convergencia Armónica inicie, Korra y sus amigos no tienen más opción que atacar directamente en la fortaleza que el ejército del Norte ha construido en el Sur. Desafortunadamente, son incapaces de derrotar a la Tribu del Norte y todos son capturados, a excepción de Bumi, quien se las arregla para infiltrarse en el campamento e inadvertidamente desencadena una serie de eventos que destruyen la fortaleza entera, luego libera a Korra y a sus amigos quienes van en busca de Unalaq, este revela que no solamente planea liberar a Vaatu, sino que también se fusionará con éste para convertirse en un Avatar Oscuro que dominará el mundo. A pesar de sus grandes esfuerzos, Korra no alcanza a detener la Convergencia Armónica, y Vaatu se libera de su prisión.

Después de los acontencimientos de la Convergencia Armónica, la Avatar Korra descubre que su decisión de dejar los portales espirituales abiertos tiene consecuencias inesperadas. Salvajes enredaderas espirituales crecen por toda Ciudad República y comienzan a surgir controladores del aire por todas las naciones.

Tenzin, mientras lucha contra la mala actitud de Bumi, trata de entrenar a los nuevos miembros de la Nación del aire.

Las tropas de Unalaq toman el Sur en un intento de equilibrar el mundo de los espíritus con el de los humanos, pero el descontento creciente lleva a que una inevitable guerra civil empiece a formarse. Mientras, Tenzin discute con sus hermanos sobre sus vidas.

Los padres de Korra son arrestados por Unalaq que los acusa de querer asesinarlo, en el juicio la madre de Korra es liberada pero su padre y el resto de los rebeldes son sentenciados a prisión de por vida. Korra descubre que su tío lo planeó todo y que también fue quien causó que su padre fuera desterrado, con la ayuda de sus amigos y Varrick, Korra logra salvar a su padre y a los rebeldes, junto a ellos, deberá volver a Ciudad República para pedir ayuda para vencer a su tío Unalaq.

Seis meses después del final del primer libro, Korra ha dominado Aire Control, Mako trabaja como policía, Bolin va mal en el pro-control con los nuevos Hurones de Fuego, y Asami trata de mantener a flote Industrias Futuro. Junto con Tenzin, los amigos de Korra y la familia de Tenzin van a la Tribu Agua del Sur. Después de que el tío de Korra, el jefe Unalaq, fácilmente repele el ataque de un espíritu enojado, Korra lo elige a él en lugar de Tenzin como su maestro espiritual.

Ba Sing Se a entrado en caos, mientras tanto Mako y Bolin salen de ella en un dirigible robado junto con su familia en busca del Avatar Korra. En el desierto Si Wong logran encontrar en rastro de Korra que los guían al oasis de las palmeras con neblina, al llegara le dan el ultimátum de Zaheer a Korra el cual es destruir a la nación aire, el grupo intenta llamar al Templo Aire del Norte pero no logran contactarlos y van a Zaofu, allí el grupo logra contactar al templo pero es muy tarde ya que Zaheer ha llegado. En el templo, los maestros aire son arrinconados pero logran liberarse de ellos, en eso inicia un gran lucha entre Zaheer, Ming-Hua y Ghazan contra Bumi, Kya, Kai y Tenzin pero son finalmente derrotados. Kai casi se sacrifica a si mismo para ayudar a los demás maestros aire a llega a los establos de bisontes , P'Li logra acorralar a todos los maestros.

Korra descubre que la Reina de la tierra ha encarcelado a controladores del aire para crear un ejército. Jinora lidera una investigación mediante su proyección espiritual. Lin se une al equipo de la Avatar.