Clark le dice a Jor-El que está preparado para empezar con su entrenamiento, pero Jor-El lo envía de vuelta a Metrópolis para cortar los vínculos con Lois antes de que pueda empezar. Chloe se queda conmocionada cuando Lois de repente aparece después de haber estado desaparecida durante semanas, pero Lois no recuerda haberse desvanecido en el aire con el anillo de la Legión. Mientras investiga el descarrilamiento de un monoraíl, Lois se encuentra con John Corben, un nuevo reportero del Daily Planet, con una actitud negativa hacia el Borrón-Rojo-Azul. Chloe le suplica a Clark que use el anillo de la Legión para volver atrás en el tiempo y salvar a Jimmy, pero él se niega, provocando una fisura en su amistad. Mientras tanto, Oliver continúa avanzando en un oscuro camino, y Zod llega a la mansión de los Luthor...

Después de ser atropellado por un camión, John Corben se levanta solo en un apartamento abandonado como un hombre-máquina con un corazón de Kriptonita. Corben se da cuenta de que ahora tiene una fuerza sobrehumana y se propone vengarse en el Borrón Rojo-Azul, quien piensa que es un vigilante irresponsable. Contra los deseos de Clark, Lois se involucra a sí misma en la investigación del Borrón Rojo-Azul, y termina siendo raptada por Corben.

Zod y sus soldados liberan un virus en el aire que convierte a los humanos en zombies. La única manera de pararlo es fabricar un antídoto con la sangre de otro kriptoniano. Después de que Lois es infectada, Chloe le suplica a Clark que done su sangre para parar la epidemia, aunque eso pone en riesgo el que se revele ante Zod.

Tess obliga a Oliver a ir a la gala de las Industrias Queen para hacer descansar al Consejo, pero las cosas se tuercen cuando Toyman aparece con una bomba y planea cobrarse venganza contra Oliver. Toyman le dice a Oliver que debe confesar el haber asesinado a Lex o volará el lugar. Mientras tanto, como parte de su entrenamiento, Jor-El le da a Clark la habilidad de escuchar los pensamientos de la gente.

Oliver es drogado y secuestrado por una mujer llamada Victoria Roulette, quien le dice a Oliver que está involucrado en un juego peligroso y que debe de luchar por su vida. Después de que Victoria aparezca muerta y Oliver sea arrestado por la policía, él regresa a Chloe para pedirle ayuda. Mientras tanto, Lois le recrimina a Clark el no haberle contado el intento de suicidio de Oliver.

Oliver intenta ayudar a una joven chica de la calle, Mia Speedy, a que salga de su peligrosa vida ofreciéndole entrenarla, pero Mia lo engaña. Lois le pide a Clark que la ayude a hacerse con un trabajo como presentadora de un programa que se emite para la televisión, pero los dos se quedan en shock cuando la cadena quiere contratarlos como equipo.

Jor-El misteriosamente llega a la granja de los Kent buscando a su hijo, Kal-El, pero se encuentra con Chloe en su lugar. Convencido de que el Borrón es Jor-El, Zod alista a Tess para que le ayude a encontrarle y forzarle a que le revele el secreto de sus poderes. Clark se da cuenta de que Jor-El está vivo y en la Tierra y corre a encontrarle antes de que Zod lo haga.

Los gemelos superhéroes Zan y Jayna aparecen en Metrópolis para ayudar al Borrón a luchar contra el crimen pero terminan estropeando varios rescates, lo que termina con Clark metido en líos con la oficina del Fiscal del Distrito. Clark decide ofrecerse como el Borrón para limpiar su nombre.

Tess secuestra a Lois para descubrir dónde fue Lois tras haber desaparecido durante semanas. Los recuerdos de Lois del futuro representan a una Metrópolis bajo las reglas de Zod y a Clark sin poderes bajo el sol rojo, mientras que Chloe forma un grupo de resistencia con Oliver. Después de conocer estos eventos futuros, Clark toma una importante decisión sobre Zod.

El pasado de Oliver regresa para perseguirlo en la forma de The Dark Archer, el antiguo maestro de Oliver, quien busca venganza de su estudiante apuntando a Lois y a Chloe.

Un misterioso hombre aparece ante Chloe para hacerle una terrible revelación , que desencadena una serie de descubrimientos sobre un grupo de justicieros aparentemente olvidados.

Clark se encuentra con Zatanna en una convención de cómics, donde le dice que su padré hechizó una copia del libro de cómic “Warrior Angel” y que tiene poderes mágicos. Un joven llamado Stephen roba el cómic y desarrolla súper poderes, transformándose él mismo en Warrior Angel y salvando a Chloe de un horrible accidente.

Es el Día de San Valentín y mientras que Clark está en una cita con Lois, sin saberlo se ve infectado por una gema de kriptonita, que tiene propiedades mágicas para satisfacer deseos. Clark le menciona a Lois que él desearía que tuvieran una relación más tradicional, así es que Lois deja el Daily Planet, se muda con Clark y empieza a planear su boda. Aún ajeno a su nuevo poder, Clark también le dice de forma casual a Chloe que desearía que pasara más tiempo vigilándole, así es que una infectada Chloe se toma a pecho su deseo y pone la vista sobre un nuevo objetivo – Lois.

Bernard Chisholm, un doctor que murió y fue devuelto a la vida por los Kandorianos para que pudieran experimentar con él, se escapa y rapta a algunos Kandorianos para probar que los aliens han invadido la Tierra. Bernard intenta que Lois escriba una historia que respalde su afirmación, pero cuando Lois se niega, la rapta también. En un esfuerzo por salvar a su gente, Zod posa como resportero del Daily Planet y descubre el laboratorio secreto de Bernard. Clark llega al laboratorio justo a tiempo para ver que Zod es disparado.

Clark y Lois se van de la ciudad para una romántica y tranquila escapada, pero sus planes se frustran cuando se topan con Chloe y Oliver en su Hotel. El incómodo momento de las parejas es interrumpido por Silver Banshee, que pone su vista en Clark y Oliver. Mientras tanto, Tess se enfrenta a Zod con un sorprendente resultado.

Tess crea un elaborado engaño para secuestrar a Green Arrow y se lo entrega a Amanda Waller, quien le dice que el gobierno lo está reclutando para servir a su país. Después de que Oliver ponga a Clark y a Chloe al corriente, los tres investigan y Clark se sorprende al encontrar a John Jones investigando el secuestro de Oliver también. Clark siente que John le está escondiendo información. Oliver y Clark se quedan estupefactos cuando Tess les revela que Amanda está tras algo llamado “Watchtower.” Waller amenaza con matar a Chloe a menos que Clark le de los nombres y las localizaciones del resto de la Liga de la Justicia.

Mientras investiga un misterioso laboratorio Lois es rescatada de una explosión por John Corben.

Durante una investigacion de un fugado, Lois acaba encontrandose con un agente de Checkmate.

Cuando Tess intenta entrar ilícitamente en la Watchtower, esta y Chloe son atrapadas por su parte Oliver se enfrenta a Zod.

Clark está desesperado por encontrar el Libro de Rao antes de que Zod pueda encontrarlo. Si cae en manos de Zod, él tomará el control de la Tierra. Le pide ayuda a Chloe. Ella está obstaculizada por los destrozos de Tess en su equipo de la Torre de Vigilancia. Lois le dice a Clark que tiene una forma infalible de recuperar sus trabajos, pero él está demasiado preocupado para escuchar. Sus sentimientos se hieren. Ella dice que necesita una misión en la vida. En medio de todo esto, la mamá de Clark regresa inesperadamente con Perry White, con quien ha estado saliendo. Lois se siente atraída por Perry y le muestra su pista caliente: una foto del Red/Blue Blur y cuentos de una raza alienígena que está buscando el Libro de Rao. Ella muestra una imagen de él. Perry se queda boquiabierto. Mete la mano en su maletín y saca una copia del mismo símbolo. Le dice que tienen una historia en común. Está investigando una explosión en un complejo gubernamental secreto en las Montañas Rocosas, pero alguien con el nombre en clave Red Queen lo ha bloqueado. Mientras tanto, Maxwell Lord ha encarcelado a Tess y exige que le entregue el Libro de Rao. Mientras Chloe intenta ayudar a Clark a buscar el libro, Red Queen bloquea sus computadoras. En una incómoda cena "familiar", Lois le informa a Clark que está rompiendo con él. Tess despierta de la manipulación mental que Lord ha estado usando en ella para obtener el Libro de Rao. Agarra su pistola y escapa. Va a casa para obtener a Rao de su escondite en la bodega de vinos. Pero la verdadera Red Queen, Martha Kent, la apunta con un arma, sabiendo que iría por Rao cuando huyó de Lord. Tess se ve obligada a entregárselo. La historia de Perry y Lois se derrumba, pero su buena palabra al editor del Daily Planet hace que Lois y Clark recuperen sus escritorios. En la granja Kent, Clark le dice a su mamá que ahora sabe que ella es la Reina Ro

Zod desata su ejército en el mundo, obligando a Chloe a pedir refuerzos a viejos amigos. Zod le dice a Lois que él es The Blur y le pide que robe el Libro de Rao a Clark. Atrapada entre Clark y The Blur, Lois le pide a Clark que le revele todo, pero él se niega. Chloe y Oliver intentan reconectar el sistema de satélite de Watchtower para luchar contra los kandorianos, pero para horror de Chloe, Oliver es capturado en el lugar y desaparece. Tess intenta detener a Zod, pero él la deja al borde de la muerte. Clark y Zod luchan por el control de la Tierra.