Después de haber robado la espada y haberse teletransportado cinco años al futuro, Hiro y Ando son testigos del futuro triste y horroroso que les espera a nuestros héroes. Habiendo saltado cinco años al futuro, Hiro y Ando descubren que la gente con habilidades extraordinarias no sólo son conocidas en todo el mundo (después de la destrucción de Nueva York y la muerte de millones de personas), además los "héroes" están siendo registrados, encarcelados, cazados e incluso asesinados como "terroristas". Mientras el Presidente da el primer paso hacia una "solución final", Hiro y Ando se verán involucrados en la que podría ser la batalla final de los "Héroes" y se encontrarán con un nuevo y oscuro grupo de caras familiares. Si sobreviven a esta experiencia, ¿podrán volver al presente y salvar al mundo?

Mientras Danko encabeza la operación del gobierno, alguien cercano a él le pondrá en la linea de fuego. HRG continua en su espiral fuera de control y su matrimonio se acerca a un punto de ruptura. Mientras, Hiro y Ando continuan su viaje de carretera con una entrega especial para Matt Parkman. Por otro lado, Angela Petrelli desenterrará los demonios de su pasado.

Sylar continúa su extraña cooperación y comienza una inesperada crisis de identidad. Hiro y Ando comienzan con su plan de acabar con el Building 26. Mientras, Matt cambiará sus prioridades al enterarse de su paternidad. Por otro lado, Nathan da comienzo un plan para corregir el daño ocasionado por sus operaciones.

Nathan se enfrenta a Sylar para evitar que este se reuna con el presidente. Sylar tiene sus propios planes para su nuevo compañero. Mientras, Hiro comprueba como el recuperar sus poderes conlleva sus repercusiones. Por otra parte, Matt debe realizar un gran esfuerzo para proteger el futuro con su familia.