Decidiendo utilizar a los mil prisioneros a bordo de una nave de transporte de prisioneros para extraer hielo en el planeta que han encontrado, los planes de Galactica se ven alterados cuando un prisionero político a bordo lidera un levantamiento, tomando rehenes. Cuestiona la legitimidad del gobierno de Roslin y exige que se realicen elecciones libres en la flota.

La Presidenta Roslin ha reconstruido un nuevo Quórum de Doce, el poder legislativo del gobierno, pero el líder terrorista/disidente político Tom Zarek es elegido como miembro, y de inmediato propone que el Quórum vote para nombrar a un nuevo Vicepresidente, y se postula para el cargo.

Tigh tiene problemas con la responsabilidad de ser líder, la presidenta Roslin pierde el control sin chamalla. El equipo de Kobol descubre una batería Cylon.

La decisión de Tigh de imponer la ley marcial es protestada tanto en la flota como en la Galáctica. En Caprica, Helo y Starbuck se encuentran con otros humanos.

Starbuck se encuentra herida en un hospital en Caprica, donde desconfía de su médico. La presidenta Roslin hace un llamado a la flota para que la sigan a Kobol.

Starbuck, Helo y Boomer traen de vuelta la Flecha de Apolo, pero Boomer no parece ser bienvenida. El Comandante Adama quiere mantener a la flota dividida y nombra a un nuevo CAG.

Mientras el Comandante Adama intenta unirse al equipo de Roslin en Kobol, la Número Seis del Dr. Baltar le dice que está loco.

Apollo investigates the murder of one of the crew and falls for a young prostitute, whom he vows to save from the rogue ship dealing with the Black Market. As well as confronting the bad guys, Apollo has to confront some past mistakes.

Dos de los raptores de Pegasus desaparecen después de una sospechosa llamada de auxilio. La presidenta Roslin debe tomar una decisión sobre el aborto que podría dañar su carrera política.

Mientras el Dr. Baltar va rezagado en las encuestas para la elección y trata desesperadamente de revertir la situación, Starbuck está planeando una misión para rescatar a Anders de Caprica.

El grupo en Caprica está bajo fuego de los Cylons, pero de repente se detienen. Con solo los votos de una nave por contar, Roslin está muy rezagada en las elecciones.

Como resultado de los recientes atentados suicidas, algunos de los Cylons ahora argumentan que necesitan tomar represalias. Laura Roslin, entre otros, está bajo custodia y Gaius Baltar intenta hacer que coopere. Sin embargo, Tigh se niega rotundamente a poner fin a los atentados suicidas. Los arrestos nocturnos también conducen al arresto de Cally, pero dejan a su bebé en paz. Sharon Valerii ve lo que puede hacer al respecto. Mientras tanto, John Cavil le dice a Ellen Tigh que debe proporcionar la fecha y el lugar de la próxima reunión de los comandantes de la resistencia. Leoben Conoy todavía tiene a Starbuck prisionera, pero le presenta a su hija, Kacey, que fue concebida a partir de huevos que recolectaron de ella cuando estaba en la Granja. En Galactica, el almirante Adama comienza a planificar un rescate masivo de todos en New Caprica. Se da cuenta de que tendrán que obtener las llaves de lanzamiento de todas las naves en la superficie del planeta. La mejor manera de infiltrarse entre los Cylons es con otro Cylon, por lo que Adama comisiona a Sharon Agathon como oficial.

La fuente secreta dentro de la administración ha proporcionado a Tyrol una lista de todos los humanos programados para ser exterminados. La esposa de Tyrol, Cally, está en la lista y él se dispone a rescatarla. Sharon Agathon ha llegado a salvo al planeta, pero son emboscados por Cylons que los esperan. Se dan cuenta de que fueron traicionados y Anders encuentra pruebas contundentes que señalan la identidad del traidor. D'Anna Biers ha estado teniendo extraños sueños últimamente y un oráculo le dice que la niña Hera está viva y la sostendrá en sus brazos. Mientras tanto, Roslin asigna un equipo de hombres para proteger a la niña a toda costa. El Almirante envía el Pegasus lejos con los pocos barcos civiles restantes para continuar la búsqueda de la Tierra.

Comienza el ataque para rescatar a todos en New Caprica. La Galactica se encuentra con cuatro Basestars Cylon en lugar de los dos esperados. El final parece estar a la vista, pero reciben ayuda de una fuente bienvenida pero inesperada. En el planeta, Tyrol y Anders lideran el ataque para liberar a todos de la prisión. Anders encuentra a Starbuck, pero ella no se irá sin Kacey. Su exitoso regreso a la Galactica provoca emociones encontradas. El Coronel Tigh debe decidir qué hacer con su esposa Ellen después de que ella confiesa haber dado las coordenadas del encuentro a los Cylon. Hera no logra salir del planeta.

Ahora, de vuelta de manera segura en la flota, aquellos que lograron escapar de Nueva Caprica buscan venganza contra aquellos que creen que colaboraron con los Cylons. Seis de ellos, incluyendo al Jefe Tyrol y al Coronel Tigh, han formado el Círculo y actúan como juez, jurado y verdugo. Aquellos encontrados culpables son lanzados al espacio desde una escotilla de aire. Lee Adama ha notado que en los tres días desde que todos se reunieron, 13 personas han desaparecido sin dejar rastro. El ánimo a bordo de la Galactica no es bueno, con los colaboradores percibidos siendo rechazados por los demás. Entre aquellos en esa situación se encuentra Felix Gaeta, quien como Jefe de Personal de Gaius Baltar, está en lo alto de la lista del Círculo. En cuanto a Baltar, ahora está siendo retenido a bordo de una nave Basestar Cylon y sus captores también están decidiendo su destino.

When a group of refugees board Galactica with a curable illness, it becomes very mysterious when they begin to die after taking the injection they do not believe in.

Las secuelas de un golpe de estado entre los Cylons conducen a más violencia, Lee se encuentra enfrentándose a Roslin durante su primera reunión con el Quórum de los Doce como el nuevo representante de Caprica, y Cally descubre la horrible verdad sobre su esposo Galen Tyrol. Mientras tanto, Starbuck busca sin rumbo la Tierra con Anders y otros oficiales de Galactica.

Una alianza inestable entre la Flota Colonial y los rebeldes Cylon es puesta a prueba cuando los dos grupos unen esfuerzos para eliminar un "Resurrection Hub" Cylon. Mientras tanto, Athena pierde el control cuando Hera se siente extrañamente atraída por Natalie.

El secuestro de la Presidenta Roslin por parte del Híbrido Cylon desencadena una amarga lucha de poder dentro de la Flota Colonial.

Adama considera la sugerencia de Saul y Tyrol de que la Flota debería integrar la tecnología de salto de los Cylon, ya que triplicaría la distancia que podrían cubrir antes de quedarse sin combustible. Pero la condición de los Cylon es que se les permita unirse a la Flota, por seguridad contra Cavil, que todavía está allí fuera. En última instancia, la decisión depende de la Presidenta Roslin, pero Zarek convoca al Quórum y consigue que aprueben la propuesta de que ningún Cylon pueda subir a ninguna nave colonial a menos que sea permitido por el capitán del barco. Tyrol se entera de la Dra. Cottle de que Cally hizo realizar una prueba de paternidad del niño y los resultados indicaron que Tyrol no es el padre, por lo tanto, el niño es completamente humano. Roslin comienza a recuperarse de la desesperación en la que cayó poco después de que la Flota encontrara la Tierra.

La Flota se niega a cooperar con los ingenieros cylon y Adama decide poner fin a esto. Envía un mensaje al Quórum declarando que a menos que deseen unirse a Zarek en la celda, deben poner a su gente en orden. Sin embargo, Gaeta ya ha liberado a Zarek con la ayuda de otros supuestos revolucionarios. Permiten que Zarek abandone Galactica en un raptor. Aterriza en Colonial One y entra en una reunión del Quórum. Mientras tanto, Anders es emboscado y capturado. En el CIC, Gaeta manipula astutamente a todos los demás hasta que llega el momento de que la revolución comience.

Roslin está a bordo de un raptor en camino a la Base Estelar Rebelde de los Cylon, pero Gaeta ha ordenado que lo ataquen y destruyan. Los marines han utilizado una granada aturdidora contra Adama y Tigh. Roslin logra enviar una transmisión inalámbrica para que todos escuchen y se enteren de lo que Gaeta ha hecho. Ella y los demás apenas logran llegar a la Base Estelar, donde convence a Tory y a los demás Cylon de utilizar la Flota como cobertura para evitar que Gaeta la ataque. También cree que Adama podrá salvar al resto de los Cuatro Finales. Temporalmente a salvo, los Cylon Rebeldes comienzan a votar si deben simplemente saltar y aceptar sus pérdidas. Adama es llevado ante Gaeta y Tigh es encarcelado con Caprica Six, Anders, Athena, Helo y su hija Hera. Zarek llega a bordo de Galactica en Colonial One con el Quórum. A instancias de Gaeta, Zarek acepta llevar a Adama a juicio por traición, con Romo Lampkin asignado como su abogado defensor. Solo hay un problema: el Quórum se niega a reconocer la autoridad de Zarek. Sin embargo, Zarek está decidido a seguir su máxima de "La verdad es contada por aquellos que quedan en pie". Solo Tyrol, que está solo, y Lee, que está con Starbuck, son la última esperanza de Galactica.

La Presidenta Roslin ha reconstruido un nuevo Quórum de Doce, el poder legislativo del gobierno, pero el líder terrorista/disidente político Tom Zarek es elegido como miembro, y de inmediato propone que el Quórum vote para nombrar a un nuevo Vicepresidente, y se postula para el cargo.

Decidiendo utilizar a los mil prisioneros a bordo de una nave de transporte de prisioneros para extraer hielo en el planeta que han encontrado, los planes de Galactica se ven alterados cuando un prisionero político a bordo lidera un levantamiento, tomando rehenes. Cuestiona la legitimidad del gobierno de Roslin y exige que se realicen elecciones libres en la flota.

Adama considera la sugerencia de Saul y Tyrol de que la Flota debería integrar la tecnología de salto de los Cylon, ya que triplicaría la distancia que podrían cubrir antes de quedarse sin combustible. Pero la condición de los Cylon es que se les permita unirse a la Flota, por seguridad contra Cavil, que todavía está allí fuera. En última instancia, la decisión depende de la Presidenta Roslin, pero Zarek convoca al Quórum y consigue que aprueben la propuesta de que ningún Cylon pueda subir a ninguna nave colonial a menos que sea permitido por el capitán del barco. Tyrol se entera de la Dra. Cottle de que Cally hizo realizar una prueba de paternidad del niño y los resultados indicaron que Tyrol no es el padre, por lo tanto, el niño es completamente humano. Roslin comienza a recuperarse de la desesperación en la que cayó poco después de que la Flota encontrara la Tierra.

El secuestro de la Presidenta Roslin por parte del Híbrido Cylon desencadena una amarga lucha de poder dentro de la Flota Colonial.

Ahora, de vuelta de manera segura en la flota, aquellos que lograron escapar de Nueva Caprica buscan venganza contra aquellos que creen que colaboraron con los Cylons. Seis de ellos, incluyendo al Jefe Tyrol y al Coronel Tigh, han formado el Círculo y actúan como juez, jurado y verdugo. Aquellos encontrados culpables son lanzados al espacio desde una escotilla de aire. Lee Adama ha notado que en los tres días desde que todos se reunieron, 13 personas han desaparecido sin dejar rastro. El ánimo a bordo de la Galactica no es bueno, con los colaboradores percibidos siendo rechazados por los demás. Entre aquellos en esa situación se encuentra Felix Gaeta, quien como Jefe de Personal de Gaius Baltar, está en lo alto de la lista del Círculo. En cuanto a Baltar, ahora está siendo retenido a bordo de una nave Basestar Cylon y sus captores también están decidiendo su destino.