Para complicar el ya abrumador trabajo de criar a dos niños, Clark y Lois también deben preocuparse por si sus hijos Jonathan y Jordan podrían heredar o no los superpoderes kryptonianos de su padre a medida que crezcan. Al regresar a Smallville para manejar el negocio familiar de los Kent, Clark y Lois se reencuentran con Lana Lang, una oficial de préstamos local que también es el primer amor de Clark, y su marido, el Jefe de Bomberos, Kyle Cushing. Mientras tanto, el regreso de Superman y Lois al idílico Smallville se verá alterado cuando un misterioso extraño y un apasionado magnate hecho a sí mismo, Morgan Edge, entran en sus vidas.

Mientras Smallville celebra su primer Festival de la Cosecha desde la muerte de Martha, Clark recuerda lo que significaba su madre para él y aprende una lección que le enseñará a superar su muerte.

Lois está preocupada por Jordan, y cada vez su relación con Sarah es más estrecha. Clark visita a Lana. Jonathan pasa mucho tiempo con John Henry.

La peor pesadilla de Superman se cumple y Lois se enfrenta a Leslie Larr. Mientras, Lana, Kyle y Sarah aceptan quedarse para ayudar al general Lane.

Lois y Clark luchan como pareja mientras Chrissy se adapta a dirigir The Smallville Gazette con Lois. Jonathan enfrenta nuevos desafíos en el campo de fútbol y los secretos amenazan con destruir la creciente relación de Jordan y Sarah. Mientras tanto, Kyle se preocupa cada vez más por la participación de Lana con un nuevo candidato a alcalde. Por último, John Henry Irons y su hija Natalie intentan hacer de esta nueva Tierra su hogar.

Clark le habla a Lois de sus visiones y reconoce que solo hay una persona que puede ayudarle. Lana recibe una noticia inesperada y la tensión crece entre Lois y Chrissy.

Lois se pone en contacto con su padre, el General Lane, mientras las visiones de Clark empeoran durante unas discusiones con Jonathan y Jordan. Lana comparte sus frustraciones con Kyle.

Superman le ruega al teniente Anderson que investigue a Ally Allston y Lois recibe una noticia muy preocupante. Mientras, Lois ayuda a Lana a prepararse para la batalla. Por último, Jordan sigue enfadado con Jonathan por haberle mentido.

Lois le da las gracias a Lana por defender a Jonathan cuando la madre de uno de los jugadores de fútbol le acosa tras la cancelación de los partidos. Sarah está preocupada cuando Jordan se va de manera inesperada el día de las elecciones.

Lois cuida de Superman. Jonathan y Jordan siguen preocupados por su padre, que parece más humano que nunca. John Henry y Natalie intentan descubrir cuál es la mejor manera de defenderse de los poderes de Ally Allston.

Chrissy Beppo, con la autorización del Departamento de Defensa, tiene un mensaje para la gente de Smallville: la fusión de planetas no solo es real, sino que está ocurriendo.

Una misión encubierta revela un enemigo mortal que promete cambiar a la familia Kent para siempre; John Henry está obsesionado por el pasado de su doppelgänger; Sarah explora lo que depara el futuro para ella y Jordan; El general Samuel Lane recupera su puesto.

Lois interrumpe una intensa conversación entre Clark y John Henry. Mientras tanto, Kyle intenta interponerse entre Sarah y Lana. Por último, Jonathan tiene una acalorada discusión con el padre de Candice.

Superman y John Henry tienen opiniones diferentes sobre cómo lidiar con Bruno Mannheim. Lois está preocupada por su tratamiento.