Michael, Mahone, Sucre y Lincoln intentan ingresar a la casa donde se encuentra guardada Scylla. T-Bag y Sancho se dirigen a San Diego en el desierto.

La pandilla tiene que infiltrarse en la casa bien protegida del hombre de negocios Stuart Tuxhorn. Mientras tanto, T-Bag debe llegar a extremos para sobrevivir.

Michael y el equipo tienen un día para localizar al próximo poseedor de la tarjeta o corren el riesgo de volver a la prisión. Mientras tanto, Mahone busca venganza contra Wyatt.

Para obtener la siguiente tarjeta de datos, Michael, Lincoln y Sucre deben arruinar un evento benéfico de la policía. Mientras tanto, T-Bag levanta sospechas en su primer día de trabajo nuevo.

La pandilla, con la ayuda de Don, debe entrar en una caja fuerte en el Departamento del Tesoro para obtener la siguiente tarjeta de Scylla. Mientras tanto, Gretchen logra escapar.

Mahone es arrestado, poniendo en peligro a todo el grupo y dejando a Mahone directamente en la mira de Wyatt. Mientras tanto, se descubre el engaño de T-Bag.

Lincoln, Sucre, Sara y Roland siguen a un poseedor de tarjeta Scylla a Las Vegas, donde Roland tiene su dispositivo confiscado después de ser atrapado apostando.

Se trama un audaz plan para obtener la última carta de Pad Man, y se forma una alianza incómoda con Gretchen, pero hay un traidor entre las filas.

El equipo necesita abrirse paso a través de una tubería de agua de 30,000 galones para llegar a Scylla. Mientras tanto, T-Bag se defiende de una investigación.

Michael se desploma y debe ir al hospital. En otro lugar, Sucre pisa una mina terrestre y se descubre el sorprendente secreto de Trishanne.

A pesar de la condición de Michael, el equipo continúa con sus planes de robar Scylla. Gretchen y T-Bag trabajan juntos para conseguir la sexta tarjeta del General pero sin éxito. Michael, Lincoln, Sucre y Mahone rompen la pared.

Michael y la pandilla logran llevar a cabo el robo de Scylla desde lo más profundo de la sede de la Compañía, pero una terrible sorpresa les espera.

Mientras la pandilla lidia con la traición de Don, Lincoln es capturado. Mientras tanto, Don obliga a Gretchen a ayudarlo al tener como rehenes a su hija y hermana.

Don y Gretchen, Michael y La Compañía están todos tras Scylla. En otro lugar, T-Bag tiene que tomar una decisión difícil mientras mantiene como rehenes a la familia de Gretchen.

Cuando Michael se somete a una cirugía, tiene visiones de Westmoreland. Mientras tanto, Lincoln y Sucre intentan recuperar Scylla antes de que Don y Gretchen la vendan.

Lincoln llama a Sara desde Miami para preguntar por noticias sobre Michael y le cuenta que está intentando recuperar Scylla para La Compañía con Gretchen, T-Bag y Self. Encuentran una pista en el Club Grafton, y Lincoln va al lugar donde secuestra a Tia Hayden intentando encontrar al representante del dueño de Scylla. Mientras tanto, Michael despierta encerrado en una casa en el bosque bajo la vigilancia de los guardaespaldas de La Compañía. El psiquiatra, Dr. Roger Knowlton, le dice que su madre está viva y trabaja para "La Compañía" en la selva tropical de Madagascar. Quiere preparar a Michael para unirse a "La Compañía" y usar sus habilidades a nivel global trabajando con su madre. Tia engaña a Lincoln y logra escapar, pero él se queda con su cartera y encuentra su dirección. Sara le dice al General Krantz que quiere quedarse con Michael, pero él se lo niega. T-Bag y Self van a la casa de Tia y Self conspira contra el liderazgo de Lincoln. Traen fotos y un disco duro que encontraron en la casa. Self discute con Lincoln y Mahone llega para equilibrar la situación. Michael ve fotos de su infancia y recuerda la reunión familiar mientras el Dr. Knowlton lo evalúa para el General Krantz y se ve presionado para usar un proceso rápido y desagradable para forzar a Michael a unirse a La Compañía. Lincoln y Mahone van al puerto deportivo para investigar al representante del dueño de Scylla. Sara recibe un misterioso mensaje en su teléfono celular para una reunión y es secuestrada cerca de un teléfono público por hombres de Lisa, y Lisa le dice que Michael está a 60 millas al noreste del centro. Gretchen encuentra a Scott, el representante del dueño de Scylla, mientras investiga en una base de datos, pero engaña al resto del grupo y se encuentra con Scott, quien le promete diez millones de dólares. T-Bag escucha la conversación entre Sara y Lincoln y llama al General Krantz. Él,

Lincoln y su equipo (Self, T-Bag, Mahone) están tratando de encontrar Scylla. Intentan encontrar una pista para la llave del comprador falso que mató a Gretchen. Encuentran una iglesia y una mansión que coinciden con la llave. Cuando Lincoln y Mahone investigan la mansión, Lincoln encuentra una foto de él con su madre. Mahone descubre que la foto fue editada y contiene una pista sobre el lugar de encuentro. Lincoln va al encuentro y encuentra a su madre. Christina quiere dos días de Lincoln para eliminar a Krantz. Mientras tanto, los hombres de la Compañía encuentran a Michael y Sara, pero ellos escapan en un camión. Finalmente, Lincoln regresa al lugar de encuentro y comienza el fin.

Michael and Lincoln square off over Scylla as Christina sets her plan in motion. Meanwhile, T-Bag causes a scene at the Indian embassy.

Michael tiene un reencuentro incómodo con Christina, quien revela una noticia impactante sobre Lincoln. Mientras tanto, Lincoln corre para detener el plan mortal de Christina.

El pandemonio estalla en el Hotel Panda Bay después de un asesinato en la conferencia global de energía.

Mientras rostros familiares regresan para ayudar a Michael en su misión de derribar "The Company", Lincoln hace un descubrimiento sobre su relación con Michael.

Después de que el general atrapa a los hermanos y aumenta las apuestas secuestrando a más de sus familiares, Michael escapa con Scylla.

Michael y la pandilla logran llevar a cabo el robo de Scylla desde lo más profundo de la sede de la Compañía, pero una terrible sorpresa les espera.

Mientras la pandilla lidia con la traición de Don, Lincoln es capturado. Mientras tanto, Don obliga a Gretchen a ayudarlo al tener como rehenes a su hija y hermana.

El pandemonio estalla en el Hotel Panda Bay después de un asesinato en la conferencia global de energía.

Lincoln y su equipo (Self, T-Bag, Mahone) están tratando de encontrar Scylla. Intentan encontrar una pista para la llave del comprador falso que mató a Gretchen. Encuentran una iglesia y una mansión que coinciden con la llave. Cuando Lincoln y Mahone investigan la mansión, Lincoln encuentra una foto de él con su madre. Mahone descubre que la foto fue editada y contiene una pista sobre el lugar de encuentro. Lincoln va al encuentro y encuentra a su madre. Christina quiere dos días de Lincoln para eliminar a Krantz. Mientras tanto, los hombres de la Compañía encuentran a Michael y Sara, pero ellos escapan en un camión. Finalmente, Lincoln regresa al lugar de encuentro y comienza el fin.

Lincoln llama a Sara desde Miami para preguntar por noticias sobre Michael y le cuenta que está intentando recuperar Scylla para La Compañía con Gretchen, T-Bag y Self. Encuentran una pista en el Club Grafton, y Lincoln va al lugar donde secuestra a Tia Hayden intentando encontrar al representante del dueño de Scylla. Mientras tanto, Michael despierta encerrado en una casa en el bosque bajo la vigilancia de los guardaespaldas de La Compañía. El psiquiatra, Dr. Roger Knowlton, le dice que su madre está viva y trabaja para "La Compañía" en la selva tropical de Madagascar. Quiere preparar a Michael para unirse a "La Compañía" y usar sus habilidades a nivel global trabajando con su madre. Tia engaña a Lincoln y logra escapar, pero él se queda con su cartera y encuentra su dirección. Sara le dice al General Krantz que quiere quedarse con Michael, pero él se lo niega. T-Bag y Self van a la casa de Tia y Self conspira contra el liderazgo de Lincoln. Traen fotos y un disco duro que encontraron en la casa. Self discute con Lincoln y Mahone llega para equilibrar la situación. Michael ve fotos de su infancia y recuerda la reunión familiar mientras el Dr. Knowlton lo evalúa para el General Krantz y se ve presionado para usar un proceso rápido y desagradable para forzar a Michael a unirse a La Compañía. Lincoln y Mahone van al puerto deportivo para investigar al representante del dueño de Scylla. Sara recibe un misterioso mensaje en su teléfono celular para una reunión y es secuestrada cerca de un teléfono público por hombres de Lisa, y Lisa le dice que Michael está a 60 millas al noreste del centro. Gretchen encuentra a Scott, el representante del dueño de Scylla, mientras investiga en una base de datos, pero engaña al resto del grupo y se encuentra con Scott, quien le promete diez millones de dólares. T-Bag escucha la conversación entre Sara y Lincoln y llama al General Krantz. Él,