Merlín habría sido asesinado por un monstruo gigante (mitad águila, mitad león), si no hubiera sido por el valiente Lancelot, que se expuso para salvarlo. El sueño de Lancelot es convertirse en caballero, y Merlín, como agradecimiento, le lleva a la corte para que le nombren noble. Lancelot pasa las novatadas propias de su condición y combate contra Arturo como prueba, pero le encuentran como a un plebeyo y es encarcelado. Cuando el monstruo ataca Camelot, desde el castillo real las armas de los caballeros consiguen que no entre en el pueblo. Melín libera a Lancelot por arte de magia y lo ayuda a triunfar donde todos los demás caballeros no lo hacen. Pero ¿el rey Uther escuchará las súplicas de Arturo para permitir a la mejor espada servir con caballerosidad contra su ley?

En la sala real, Morgana cae enferma con una enfermedad cerebral a la que Gaius no encuentra cura con los lirios recolectados por Gwen. El misterioso curandero Edwin aparece en ayuda con su remido para curar todos los males, que en realidad elimina la maldición del escarabajo negro que había en los lirios. Agradecido, el rey Uther permitirá que Edwin se instale junto a Gaius en el tribunal médico. Gaius consigue que el bibliotecario real le deje acceder ilegalmente a los archivos secretos del rey Uther, probando que los padres de Edwin fueron ejecutados como hechiceros de magia negra. Después de consultar al dragón, que dice que debe elegir si el momento de Arturo y Merlín ha llegado, Gaius le dice a Merlín, el hijo que nunca tuvo, que su hora ha llegado. Edwin utilizará ahora otro escarabajo negro para condenar a Uther a una muerte lenta y agonizante como la de sus padres, pero se enfrenta a un gran riesgo: un duelo de magia con el principiante como Merlín.

El Caballero Negro irrumpe en las celebraciones de Arturo retando a todo el que quiera luchar contra él. Gaius descubre que el cuñado muerto de Uther, que ha aparecido de nuevo tras ser convocado por la bruja Nimueh, está buscando venganza por la muerte de su hermana, que murió dando a luz a Arturo.

Lady Catrina y su extraño criado Jonas llegan a Camelot, donde son bienvenidos a quedarse por un encantador rey Uter, quien se ve cautivado por su último huesped. Arthur, por el contrario, lejos de compartir el entusiasmo de su padre y en vista de los coqueteos, está muy consternado por la situación. Merlin y Gaius tiene la sensación de que no es lo que parece y sus sospechas han demostrado ser ciertas cuando Merlín descubre que Lady Catrina es un troll y que, por desgracia, sus intenciones van mucho más allá del premio del corazón de un rey. Horrorizado, le revela la verdad a Arturo, que no le cree. Merlin se embarca en la tarea de probar la naturaleza real de la mujer, mientras que al mismo tiempo salvar a Uther de la ruina y de la caída de Camelot. ¿Será capaz el joven brujo de superar la poderosa magia de los trolls, antes de que sea demasiado tarde?

Merlín espía al troll y roba la poción que ella usa para parecerse a Catrina, reemplazándola por una falsa hecha por Gaius. En consecuencia, ella vuelve a convertirse en un troll, a la vista de todos, pero Uther, aún hechizado por ella, no se da cuenta de esto. Merlín descubre que la única forma de romper el hechizo sobre él es hacerlo llorar lágrimas reales. Así que Gaius prepara otra poción, que Arthur bebe, y parece estar muerto. Esto funciona y el rey finalmente recupera el sentido. Arthur mata al troll y a Jonas y agradece a Merlín por sus esfuerzos.

Cuando un misterioso guerrero desafía a Arturo a un duelo, nadie podría prever la devastadora cadena de eventos que desencadena, especialmente el joven príncipe mismo. Arturo y Merlín pronto se encuentran en una extraña búsqueda por orden de la hermosa Morgause. A través de ella, Arturo descubre un oscuro secreto que amenaza con provocar la caída del reino.

Husmeando en la biblioteca real Merlín tropieza con una cámara secreta y accidentalmente libera un Goblin. La criatura entra en el cuerpo de Gaius, una vez dentro del cuerpo de Gaius empieza a hacer de las suyas extorsionando al pueblo vendiendo medicina para raras enfermedades a cambio de oro, desarrollando el gusto por el oro, la cerveza y las bromas mágicas, dejando calvo al rey y poniéndole orejas de burro a Arthur, Merlín se ve amenazado por este ya que asegura que si lo mata a el matara a Gaius tambien.

Arthur is pressured into an arranged marriage with a visiting princess, but there's more to her than mere gracelessness and a taste for frogs.

A healer is in Camelot using magic to heal the sick, and Gaius quickly realizes it is Alice, a woman whom he was about to marry many years earlier until she had to flee from Uther's persecution of sorcerers. Now Gaius is happy to work with Alice again in preparing potions, but he is unaware that Alice is being controlled by a mythical monster, a manticore, which urges her to poison the cold-hearted king. To break the manticore's hold over Alice and ultimately save her from execution, Gaius has to perform the magic that he possessed but had forsaken long ago.

Sir Leon es cuidado hasta recuperar la salud por los druidas usando la Copa de la Vida después de ser el único superviviente de un ataque de los hombres de Cenred. Supuestamente otorga inmortalidad a aquellos que beben de ella, y Arthur y Merlin la recuperan de los druidas para evitar que caiga en manos de Cenred. Sin embargo, ellos, junto con Gwaine, son emboscados y la copa es robada. Después de matar a Cenred, Morgause hace que sus soldados beban de ella y, bajo sus órdenes, atacan con éxito a Camelot. Para cuando los tres jóvenes regresan a la corte, Uther está encadenado y Camelot tiene un nuevo gobernante.

El reino está al borde del colapso, con Morgana lista para atacar. Mientras Lancelot regresa a Camelot con el moribundo Merlin, Arthur debe continuar su misión de derrotar a los Dorocha sin ellos. Aunque los caballeros saben que su viaje a la Isla de las Bendiciones está lleno de peligro, ninguno anticipa el sacrificio que Arthur tiene la intención de hacer allí. La amistad y lealtad son puestas a prueba al límite, pero al final, es el poder del amor el que cambia para siempre todas sus vidas.

La poderosa ciudadela está zumbando de anticipación por las celebraciones de cumpleaños del príncipe, pero el antiguo adversario de Arthur, Odin, promete asegurarse de que esta sea una fiesta que Camelot nunca olvidará, ya que entre los invitados que se congregan se esconde un asesino mortal, listo para atacar. A medida que el polvo se asienta, Camelot queda devastada, pero ¿hasta dónde está dispuesto a llegar Merlin para enmendar las cosas? ¿Realmente arriesgaría todo y revelaría su secreto?