Hay incertidumbre en el aire cuando Pacey y Joey regresan a Capeside tras su viaje que duró todo el verano.

Mientras el nuevo año escolar encuentra a Pacey a punto de reprobar, Henry busca que Jack rompa con Jen; Joey va a trabajar al club de yates local.

Un huracán que amenaza a Pacey y Jen obliga a Dawson y a Joey a intentar salvar sus vidas.

Mientras se intensifica el proceso de solicitud de ingreso a las universidades, Drue organiza un cumpleaños falso para Jen.

Gail drops a bomb on Mitch and Dawson, saying that she might be pregnant, but she is conflicted whether or not to keep her baby. As a result, Dawson seeks solace with his growing hobby of photography and confiding in Gretchen about his troubles. Meanwhile, Joey seeks advice from Jen because she has the feeling sexual intimacy with Pacey is approaching. Jen tells her to go to the clinic as prevention. Bessie finds out and berates Joey about the risks of sex. Also, Jack and Andie are coaching a little league of soccer kids, and he soon lands in an awkward situation when a teammate's older sister starts to flirt with him. He feels pressured to tell her that he's gay, but he soon regrets it when most of the parents turn out to be homophobic.

El esfuerzo de Andie por celebrar su ingreso a Harvard termina poniendo en peligro su vida.

La oportunidad de tomarse un tiempo libre antes de entrar a la universidad impulsa a Andie a intentar reunir a todos antes de irse.

Dawson, Pacey y Jack son sospechosos de una broma estudiantil de último año.

Dawson le pide un consejo al Sr. Brooks sobre dedicarse a la carrera de dirección; Joey lleva a Pacey a una cena organizada por una exclusiva universidad.

Mientras las revelaciones del Sr. Brooks sobre su pasado inspiran a Dawson, Pacey se ve alentado a aprovechar su relación con Joey.

Pacey intenta arruinar los esfuerzos de Dawson de cortejar a su hermana; la travesura de Drue terminará con él y Joey encerrados en un armario.

La fiesta sorpresa de cumpleaños que Joey le hace a Pacey exacerba las asperezas emocionales latentes en la familia Witter.

Dawson se siente incómodo de conocer a los amigos de Gretchen; Joey y Pacey se deciden a ayudar a Drue a salir airoso de una cita importante.

Mientras sus amigos luchan con el sexo durante un viaje de esquí del último año, Dawson descubre que se le otorgó poder sobre la vida del Sr. Brooks.

Mientras Pacey y Joey analizan su primera experiencia sexual, la muerte de Brooks esclarece la relación de Dawson y Gretchen; un psicólogo presiona a Jen sobre su pasado.

Los esfuerzos de Pacey y Joey por pasar la noche juntos crean una oportunidad para Dawson y Gretchen; Jen consigue la ayuda de Jack para que espíe a su terapeuta.

El entusiasmo de Joey por su ingreso a la universidad se empaña cuando se entera cuánto le costará.

El Día del Faltazo a la Escuela envía a Dawson y Gretchen a un viaje a Maine; Jen lleva a Joey a Nueva York para enfrentarse a su padre.

Mientras Gale lucha con un bebé pasado de fecha, a Joey le preocupa poder estar embarazada.

Mientras aviva un par de romances posibles, el baile de graduación de Capeside amenaza el futuro de otros dos.

El regreso de Gretchen a la universidad obliga a Dawson a tomar una importante decisión; Jen se resiste cuando la abuela quiere vender la casa para pagar la universidad.

La graduación de la Clase 2001 reúne a amigos y familiares mientras se prepara para separarlos.

Mientras Dawson se prepara para partir a la universidad, él y Joey se reúnen para despedirse.