El estreno de la décima temporada comienza exactamente donde terminó la novena. Lois encuentra el cuerpo sin vida de Clark y elimina la kryptonita azul que le permite curarse a sí mismo. Lois se escabulle antes de que Clark despierte totalmente, con el fin de proteger su secreto. Chloe está desesperada por encontrar a Oliver, por lo que acude a una fuente poco ortodoxa para las respuestas. Jonathan Kent vuelve a la granja con un mensaje para Clark, y Tess se despierta en un laboratorio de LuthorCorp.

Después de la partida de Lois a Egipto. El DP contrata una nueva reportera llamada Cat Grant para que tome su lugar. El asesino Deadshot apunta hacia Cat, pero Clark se entera de que este hombre tiene una peligrosa agenda, que involucra al Borron. Carter Hall va a Egipto para cuidar de Lois y le cuenta acerca de su esposa Shayera.

Clark esta sorprendido cuando Kara regresa a la tierra y le dice que Jor-El la mando a detener la fuerza oscura que se avecina por que el no cree que Clark pueda manejarlo. Mientras tanto, Lois se enfrenta a Gordon Godfrey, un locutor DJ de radio que ha estado en una cruzada contra los héroes, después de que el amenaza a Green Arrow. Sin embargo, después de que Godfrey es poseído por una fuerza oscura, el toma a Lois de rehén y Clark y Kara tienen que ir a su rescate.

Capitulo numero 200 de la serie. En un intento de animar a Clark, Lois lo convence para asistir a la reunión de quinto aniversario de la escuela. Una visita de regreso a casa de los Crows hace a Clark recordar viejos tiempos con Lana y Chloe, mientras que Lois esta furiosa por que nadie se acuerda de sus 5 días como estudiante. Brainiac 5.0 usa el anillo de la Legion para visitarlos del futuro y lo lleva atraves de su pasado, presente y futuro. Le muestra a Clark lo que realmente sucedió la noche que murió Jonathan, el dolor actual de Oliver y el futuro de Clark en el Daily Planet con Lois y su rol como el superheroe favorito de la tierra en rojo y azul.

Oliver disfruta de su nuevo papel público desde que reveló ser un superhéroe, pero extraña desesperadamente a Chloe y se siente culpable. Su ejemplo inspira aún más a Clark para contar al menos a Lois, pero justo cuando se encuentran para hacerlo, una joya egipcia permite que la diosa faraónica Isis tome posesión de su cuerpo, ansiosa por resucitar a su amado Osiris, todo lo necesario está a mano en una importante exposición en Metrópolis, pero también reviviría su reino, el infierno, en la tierra. Tess, que está ocupada con el clon de Lex, Alexander, se une a Oliver y Clark en la Watchtower, donde demuestra ser capaz de sustituir a Chloe en temas de tecnología. Incluso con esa investigación invaluable, Clark casi muere en su duelo sobrenatural con Isis. Cat queda atrapada en la pelea y cree erróneamente que Lois es el malvado Blur.

Clark examina un caserío rural donde la kryptonita azul en el agua no tiene efectos negativos conocidos. Sin embargo, cuando suena una campana, el subdirector local lamentablemente deja inconsciente al reportero entrometido en el momento y lugar equivocados. Lois tiene un accidente de coche cerca y es cuidada por una familia Amish. Sin embargo, cuando ella quiere irse, descubre su aterradora verdadera intención, ya que la secta extremadamente aberrante hace lo mismo con una mujer cada año. En la mansión Luthor, Alexander insiste en ser llamado Lex y su condición de envejecimiento requiere fiestas de cumpleaños "regulares". El plan de Mercer de darle una cura si la investigación del Lex original lo permite es reconsiderado cuando se da cuenta de que este clon puede ser demasiado perfecto.

Clark no está impresionado de que Lois apenas se atreva a reprender a su hermana menor por sus travesuras maliciosas hacia ambos, mientras se retuerce por cada capricho, incluso ofensivo, de su padre, el general Sam Lane, quien es su invitado de Acción de Gracias. Clark acoge firmemente pero cortésmente a los Lane, mientras argumenta en contra del apoyo del general a un proyecto de ley que haría obligatorio el "registro" para los superhéroes, una trampa obvia dada la trayectoria de los seguidores en el Congreso. Mientras Oliver los investiga, Clark salva a todos de un intento maquiavélico de asesinato del general por parte del promotor Rick Flag. Solo cuando Lois finalmente se pone de parte de Clark contra su padre, él revela su verdadera intención detrás de su rudeza exagerada.

Clark acompaña a Tess, quien tiene pesadillas de la infancia desencadenadas por una caja de música entregada misteriosamente, al orfanato donde fue abandonada por sus padres. Descubren de la peor manera que 'Granny', quien lo dirige, está lejos de su imagen filantrópica, de hecho, gobierna despiadadamente un anillo de chicas con poder lavado de cerebro. Finalmente, el general envía a Lois el video hecho por su difunta madre cuando moría de cáncer. Lidiando con recuerdos dolorosos y dulces, ella termina investigando los antecedentes parentales kryptonianos de Clark en la fortaleza.

Oliver pone a prueba la Ley de Registro de Vigilantes al revelar su identidad en una conferencia de prensa, siendo elogiado por el general a cargo. Como se temía, es torturado en una prisión secreta para que traicione a sus amigos superhéroes. Tess ayuda a descifrar los planes de Luthor para construir una instalación de máxima seguridad submarina, construida en seis partes. Aquaman, Arthur Curry, y su nueva esposa Mera descubren y penetran en la prisión donde está Oliver, pero el general decide activar la autodestrucción. Clark se mantiene cauteloso y acude al rescate, pero tiene que lidiar con una contramedida específica.

Tess adquiere una caja kryptoniana que una vez perteneció a Lionel Luthor. Cuando Clark accidentalmente activa la caja, es transportado a un universo paralelo donde Lionel encontró a Clark en los campos de maíz en lugar de los Kent. En este universo, Clark Luthor es un asesino y Lois está comprometida con Oliver y ambos odian a Clark. Clark debe tener cuidado de no revelarle a Lionel que no es su hijo mientras intenta descubrir cómo regresar a la Tierra donde el monstruo Clark Luthor fue transportado en su lugar.

A medida que la amenaza de la VRA se intensifica, Clark toma la iniciativa al cerrar la torre de vigilancia y declarar que la Liga se sumerge oficialmente en la clandestinidad, pero ¿será suficiente para detener al Teniente Trotter y a Slade Wilson alias Deathstroke de exponerlos? Las tensiones aumentan en este final de mitad de temporada.

Clark, Oliver, Lois y Dinah están de vuelta en casa después de una larga cautividad bajo la VRA, con recuerdos confusos y privados de todos sus poderes de superhéroes. Ellos creen que han sido torturados en un laboratorio experimental por nada menos que Chloe, por lo que temen que haya cambiado de bando. Entonces ella, o más bien su avatar, aparece en sueños a cada uno de ellos, afirmando que solo han perdido sus poderes en una ilusión virtual, que sin embargo puede matarlos de verdad. Ella les pide que confíen en ella, rompan el hechizo virtual creyendo que es falso y así escapen de vuelta a la realidad, con el equipo de Rick Flag. Oliver lo hace rápidamente y se reencuentra con su verdadero amor. Clark quiere hacerlo, pero le resulta extremadamente difícil, hasta que Lois se une a él.

Clark está sorprendido al ver a Martha en las noticias hablando en un mitin a favor de los vigilantes. Sin embargo, la sorpresa rápidamente se convierte en horror cuando él y Lois ven cómo Martha resulta herida en un ataque en la televisión nacional. Mientras tanto, Lionel se revela al mundo y recupera LuthorCorp de Tess y Oliver. Lois y Chloe deciden animar a Clark mostrándole videos de miles de seguidores de los vigilantes que profesan su apoyo a The Blur.

Chloe y Oliver son confundidos con agentes del FBI que investigan la reciente ola de asesinatos de Desaad, y la pareja es secuestrada por los secuaces de Desaad. Desaad intenta infectar a Chloe con la oscuridad. Mientras tanto, Lois le dice a Clark que necesita tener más cuidado con su identidad y sugiere un disfraz.

Después de que Zatanna envía una botella de champán mágicamente adulterada a Clark y Lois para sus despedidas de soltero/a, el grupo pierde el conocimiento después del brindis, solo para despertar a la mañana siguiente y darse cuenta de que no pueden recordar nada de la noche anterior. Mientras intentan reconstruir lo sucedido, Lois se da cuenta de que perdió su anillo de compromiso y arrastra a Oliver de vuelta al Casino Fortune donde cree haberlo perdido. Los dos se encuentran con Fortune, el excéntrico dueño del casino, quien los acusa de robarle dinero. Mientras tanto, Clark le cuenta a Chloe que tiene un recuerdo de haber robado un camión blindado la noche anterior.

Lionel y Tess se enfrentan en una batalla por el apellido Luthor. Clark y Lois están sorprendidos por el último regalo de Tess para ellos.

Clark Kent está en un estado de nostalgia después de que Martha le cede la escritura de la granja como regalo de bodas, preguntándose si eso sugiere que él y Lois deberían vender y mudarse. Clark Luthor lo sorprende, usando la caja de espejo y rompiéndola después de haber enviado a Kent a su mundo, luego engaña a todos por un tiempo, en busca de una venganza sangrienta contra al menos un Luthor. Kent se encuentra a sí mismo como el enemigo público número uno, contra quien todos llevan kryptonita verde, en el funeral de Oliver, donde un amargo Jonathan reprende al "Scrooge". Reconocido y ayudado por la otra Lois, él busca apaciguar el odio y encontrar una manera de regresar. El Dr. Emil Hamilton intenta frenéticamente reparar la caja de espejo, justo a tiempo.

Clark recibe un cambio de imagen inverso de Lois, para convertirse en un ratón gris cuando el Blur se hace público. Justo en ese momento, emerge un nuevo superhéroe llamativo y ávido de medios: Booster Gold, que roba sistemáticamente el espectáculo. Clark descubre que Booster viene del futuro con un anillo de Legionario, probablemente robado. Jaime Reyes, un tímido y acosado estudiante, es infectado accidentalmente por el escarabajo alienígena que Booster fue contratado para recuperar para el industrialista Ted Kord, y se transforma en el Blue Beetle, un monstruo incontrolable. Clark podría simplemente exponer a Booster como un cobarde falso, pero elige educarlo en la ética de los superhéroes.

Después de que el General desterrado Slade es encontrado en la Tierra, Clark se da cuenta de que el portal de la Zona Fantasma debe estar abierto y decide ir a cerrarlo, a pesar del peligro ya que sus superpoderes no funcionan allí. Oliver es negado a acompañarlo pero logra sorprenderlo. Los héroes encuentran la zona bajo el dominio del General Zod, quien espera vengarse de ambos mundos en Clark y fue prometido un dominio completo por parte de Darkseid si elimina al gran adversario Kryptoniano. Así que Clark se ve obligado a entrar en el mortal combate de gladiadores del arena de Zod, mientras que Oliver se le ofrece una alternativa y se le recuerda que ya está marcado con el Omega, algo que aún ningún terrícola sabe. En la Torre de Vigilancia, Lois descubre la "salvaguardia" de destrucción del portal de tres horas que Clark le ordenó a Tess activar y lucha contra ello.

Buscando el Arco de Orión, el único medio conocido para detener la Oscuridad, Oliver y Kara llegaron independientemente al mismo santuario subterráneo lleno de trampas. Kara quedó atrapada, pero Oliver la rescata al estilo de Indiana Jones. Juntos descifran y siguen las pistas hasta el arco, solo para llevarse una amarga sorpresa. Mientras tanto, en lugar de dar su bendición en la fortaleza, Jor-El transfiere temporalmente los superpoderes de Clark a su novia, quien ya es demasiado engreída.

La historia de Clark Kent culmina en este final de dos horas de la serie mientras Clark da el último paso para convertirse en el Hombre de Acero.