El deseo de Michaela de reducir su trabajo en la clínica, debido a que se avecina el nacimiento de su bebé, se deja a la espera cuando ella debe ocuparse de Danza de Nubes, quien ha sido apuñalado en una pelea en la reservación, y eella determina que Emma necesita ser operada luego de tratarla por lesiones que ella recibió en una pelea de bar en la taberna. Luego de que Michaela le diagnostica un tumor, ella le revela a Emma que no podrá tener hijos, una vez que la cirugía se haya completado, por lo que Emma se niega a ser operada. Ella sabe que los niños son muy importantes para Matthew, aun cuando tienen que hacer un serio compromiso en su relación. Finalmente, Matthew llega a consolarla, diciéndole que él prefiere que ella viva a que ella muera por el tumor. Mientras, Sully tiene que lidiar con la llegada de su supervisor, Hazen, quien está menos que complacido al ver que Sully ha ignorado muchas de sus órdenes directas por "ayudar" a los Indios. También, Colleen busca universidades, preocupada por el dinero que se requiere para asistir y preguntándose si sería mejor aspirar a algo más.

Un joven indio hiere por accidente gravemente a un soldado con un revólver cuando este último trataba de retenerlo, pero luego de huir, Danza de Nubes se echa la culpa, diciendo que fue él quien le disparó al soldado. Michaela, por su parte, trata en lo posible de salvar la vida del joven soldado, pero lamentablemente éste muere. O'Connor entonces lo declara un homicidio y arresta a Sully, quien había asumido como el defensor de Danza de Nubes. Sully está seguro de que Danza de Nubes está mintiendo y trata de convencerlo de decir la verdad, pero Danza de Nubes se niega u mantiene su posición. Cuando Dorothy quiere imprimir una editorial que es justa para ambas partes, Preston quiere evitarlo, pero ella lo amenaza con dejarle a él la Gaceta y comenzar su propio periódico. Sin embargo, Preston se suaviza y Dorothy mantiene un interés controlador en su periódico. En el juicio, aunque O'Connor insiste en sentenciar a Danza de Nubes por el crimen, Sully se las arregla para poner en contra de O'Connor uno de sus propios comentarios, apuntando que la armada está en estado de guerra. Si ése es el caso, cualquier muerte en cualquier lado es una baja de guerra, no un homicidio. Como resultado del argumento, el Juez declara inocente a Danza de Nubes, y los ancianos de la tribu aceptan unirse, impresionados por la postura de Danza de Nubes. O'Connor le advierte a Sully que nada ha terminado aún entre ellos.

La familia de Michaela llega para el pronto nacimiento del bebé de Michaela y Sully, trayendo consigo a un joven doctor, Andrew Cook, para que ayude a traer al mundo al bebé. Michaela, como siempre quiere ser la que lleve el control, cuestiona las habilidades de este nuevo doctor, preocupada porque él pueda ser incapaz de hacer lo posible en el evento de una emergencia. El Dr. Cook trata de asegurarles a todos que él es muy capaz, pero aún hay dudas. En un baby shower, Elizabeth declara su certeza de que el bebé es una niña, notando la forma en que Michaela está portando al niño. Los problemas de Sully con el ejército continúan. O'Connor llega a anunciar que él está promoviendo a varias de las tribus hacia otra reservación, incluyendo a Danza de Nubes. Sully quiere detenerlo, gracias a un telegram de su superior aceptando aplazar el proceso.

Ya que los hombres del pueblo no han regresado de buscar a Sully, no hay gente en el pueblo para que busque a Michaela, quien ha dejado una nota diciendo que irá en busca de Sully, por lo que las mujeres se anotan para hacer el trabajo. Rebecca, Marjorie, Grace, Dorothy y Myra deciden ir, a pesar de las desaprobaciones. Horace le prohíbe a Myra ir, pero ella lo desafía, queriendo ayudar a su amiga y se ofende por sus intentos de prohibirle a ella hacer lo que ella quiere, añadiendom ás tensión a su ya fallido matrimonio. Elizabeth quiere prohibir a sus hijas que vayan, pero Rebecca declara que es su hermana quien está perdida y no se van a quedar sentadas esperando a que algo pase. Mientras, Michaela encuentra a Sully y atiende sus heridas.

Michaela tiene inciertos sentimientos al volver a trabajar, ya que las exigencias de Katie están en conflicto con las necesidades de sus pacientes, y además que Loren prefiere entrar más en confianza con Andrew que con ella, ya que él tiene problemas con la próstata. Los aldeanos también tratan de ayudar a Horace a lidiar con la partida de Myra. Sully va a Denver para negociar con el General Wooden y le promete no inmiscuirse más en los asuntos Indios a cambio de que Wooden permita que Danza de Nubes vuelva a Palmer Creek. En el tren de regreso a Colorado Springs, Sully intenta detener a una banda de asaltantes de trenes que han desviado el tren a un ramal. Sully no puede detener el descontrolado tren y se sale de la vía. Cuando la noticia llega al pueblo, Michaela se mueve enseguida hacia la acción. El pueblo inmediatamente la apoya y se apresuran a la escena del accidente. Michaela frenéticamente atiende al grupo de heridos, buscando alguna señal de su esposo. Cuando lo ve, corre hacia él en alivio. Con ese miedo ya desvanecido, ella pone toda su atención a la gente que necesita ayuda. Andrew, desacostumbrado a trabajar en estas condiciones, es obligado a doblegarse ante la experiencia y conocimiento de Michaela. Al final, tanto la confianza de Michaela en sí misma como la confianza del pueblo en ella se renueva.

Michaela recuerda la fragilidad de la vida y está ansiosa por encontrar padrinos para Katie cuando Guillermo Morales, un nuevo vecino, es asesinado por un león montañés. Ella persuade al consejo del pueblo para contratar a la viuda de Guillermo, Teresa, como la nueva maestra de la escuela y trata de hacerse amiga de ella, para que así el Reverendo pueda volver a las necesidades del pueblo. Grace quiere adoptar a Anthony, legalmente, pero Robert E. tiene miedo de que la adopción pueda revelar cosas sobre su pasado que él prefiere mantener ocultas.

Se empiezan a reunir nubes de tormenta cuando Michaela intenta hacer una cena para Acción de Gracias, a pesar de sus pocas habilidades en la cocina. Sin embargo, la celebración se ve amenazada por el mal tiempo, no sólo en cuanto al clima, sino también por el hecho de que Andrew estará en la clínica de Preston. Además, ni Colleen ni Matthew podrán estar para el Día de Acción de Gracias. Mientras, Preston está tratando sin mucho éxito de impresionar a su padre, el afamado Preston Lodge II, quien llegó al pueblo para la inauguración del hotel que inaugura Preston. Con el mal clima haciendo que Michaela trate de salvarse a sí misma y a su bebé, todos en el pueblo recuerdan el verdadero significado de Acción de Gracias.

Ahora con un precio sobre su cabeza, Sully convence a Michaela que es más seguro para la familia que él desaparezca por un tiempo, y así ellos se dan una despedida muy dolorosa. Sully y Danza de Nubes buscan refugio en los cañones para esconderse del Ejército, mientras los actos de los renegados soldados perros cobran un precio sobre el pueblo. Pero cuando Sully y Danza de Nubes ven soldados cerca de ellos, Sully insiste en distraer a los jinetes, dándole a Danza de Nubes la oportunidad de escapar. Al mismo tiempo en que Sully distrae a los soldados para ayudar a escapar a Danza de Nubes, también se encuentra a sí mismo rodeado en el acantilado por el Sargento O'Connor, quien ha querido matar a Sully desde la última vez que pelearon, justo antes de que Katie naciera. Mientras ellos comienzan una feroz batalla de mano a mano, Michaela y el Sargento McKay, quienes han tratado de encontrar a Sully antes que O'Connor, llegan al acantlidado, Michaela descubre que llegaron demasiado tarde. Michaela entonces se queda impactada, preguntándose si acaso su esposo está vivo o muerto.