Ahora con un precio sobre su cabeza, Sully convence a Michaela que es más seguro para la familia que él desaparezca por un tiempo, y así ellos se dan una despedida muy dolorosa. Sully y Danza de Nubes buscan refugio en los cañones para esconderse del Ejército, mientras los actos de los renegados soldados perros cobran un precio sobre el pueblo. Pero cuando Sully y Danza de Nubes ven soldados cerca de ellos, Sully insiste en distraer a los jinetes, dándole a Danza de Nubes la oportunidad de escapar. Al mismo tiempo en que Sully distrae a los soldados para ayudar a escapar a Danza de Nubes, también se encuentra a sí mismo rodeado en el acantilado por el Sargento O'Connor, quien ha querido matar a Sully desde la última vez que pelearon, justo antes de que Katie naciera. Mientras ellos comienzan una feroz batalla de mano a mano, Michaela y el Sargento McKay, quienes han tratado de encontrar a Sully antes que O'Connor, llegan al acantlidado, Michaela descubre que llegaron demasiado tarde. Michaela entonces se queda impactada, preguntándose si acaso su esposo está vivo o muerto.

Michaela busca desesperadamente a Sully, quien yace en la naturaleza por muchas lesiones que sufrió mientras huía del Ejército. El amigo de Sully, Daniel Simon, llega rápido para ayudar Michaela en su búsqueda. Mientras, la editora del periódico, Dorothy Jennings, se va en búsqueda de Danza de Nubes, de quien se ha enamorado, para decirle que Sully está perdido. Y el Sargento McKay, quien tiene la intención de arrestar a Sully por el asesinato de O'Connor, el soldado que trató de matarlo, envía a exploradores para seguir a Michaela sólo por si acaso ella lo encuentra con vida.

Los aldeanos de Colorado Springs piensan que Sully está muerto, y Michaela lo mantiene escondido por semanas mientras trata de curar sus heridas para protegerlo del Ejército. Daniel se queda al lado de Sully al mismo tiempo en que Michaela y su familia estoicamente trata de mantener su paradero en secreto. Sólo es el Sargento McKay, quien ha sido declarado jefe de policía debido a los últimos altercados provocados por los Indios, cree que Sully sigue con vida, y continúa su implacable búsqueda para arrestarlo. Preston Lodge, entretanto, planea comprar la reservación de los Indios para el gobierno e instalar ahí una serrería ahí. Sully y Danza de Nubes alcanzan un movimiento que obligaría a la tribu a un mayor peligro, haciendo que su situación se vuelva más desesperada.

Hank, creyendo que Sully y Danza de Nubes son los instigadores de los ataques de los indios americanos, se autoproclama comisario y dirige un grupo para capturarlos. Al confirmar que Sully está vivo y no muerto como todo el mundo creía, públicamente acusa a Michaela de mentir sobre la supuesta muerte de su marido, como comisario quiere llevar a Sully ante la justicia. El ejército envía al General Wooden, un connotado luchador contra los indios, para finalizar los disturbios, pero es herido gravemente en un ataque liderado por el guerrero renegado Luna Negra. Daniel persuade al Sargento McKay para permitir que los prisioneros Indios procedan pacíficamente a la reservación, lo cual enfurece a Hank. Sin embargo, Dorothy se las arregla para que se elija a un comisario local, resultando ser Daniel el ganador. Michaela persuade al General Wooden para que absuelva a Sully, pero sólo logra un castigo de 7 años de prisión. Sin embargo, aunque él es la clave para lograr esto, finalmente muere por un ataque al corazón, debido a que él bebió whisky a pesar de que se le prohibiera.

Mientras desarrolla una ansiedad por saber de Sully, quien sigue siendo buscado por cargos de asesinato, Michaela empieza a experimentar síntomas de embarazo. Ella sólo quiere mantenerlo en secreto del pueblo hasta contárselo a Sully, pero pronto la noticia se corre por el pueblo. Sin embargo, luego de ello, comienza a presentar síntomas de pérdida. Tras este dolor, ella recibe el consuelo de sus amigas, Dorothy y Grace. Mientras, los aldeanos se preparan para el Día de los Fundadores, con el propósito de hacer una cápsula del tiempo y los aldeanos están discutiendo sobre qué poner en la cápsula.

Michaela se alarma cuando llega al pueblo la Princesa Nizamoff, miembro de la realeza rusa. Ella llega de vacaciones para quedarse en la Pepita de Oro, el Hotel de Preston, quien le ofrece un negocio cuando ella dice ser una vidente y que tiene conexión con el mundo de los muertos. Asombra a todos, incluso a la escéptica Michaela, cuando expone vidas privadas y pasadas de cada uno de los aldeanos. Sin embargo, ella le dice a Grace que Anthony ya no sufrirá más ataques por su desconocida enfermedad. Luego de esto, la Princesa huye con todo el dinero y Anthony sufre un nuevo ataque.

Michaela lucha con el hecho de si decirle o no a Grace y Robert E. que Anthony puede no sobrevivir a ningún ataque más por su desconocida enfermedad. Sin embargo, cuando Michaela decide por fin decirles, ahora es Grace quien no quiere decírselo a Anthony para aprovechar sus últimos días. Mientras, Sully está decidido a decirles a los indios renegados que vuelvan a la reservación para que no haya más caos cuando Michaela está dispuesta a decirle, por mucho que le cuente, que sufrió de un aborto espontáneo. Cuando se lo cuenta, él queda muy destruido, luego de lo cual Anthony sufre un ataque que obliga a que Grace y Robert E. le revelen a su hijo que él se irá al cielo. Anthony, finalmente, lee una composición sobre lo que más le gusta del pueblo.

Marjorie regresa a Colorado Springs como miembro de la Liga de Abstinencia de Mujeres, donde se busca proscribir el alcohol. Su llegada lleva a una renovación en su amistad con Loren. Mientras, Jake inunda sus inseguridades sobre Teresa Morales, las cuales se acrecientan cuando Teresa se reúne en privado con Hank. También, Grace abusa del "tónico" inadvertidamente que la ayuda a dormir, lo cual no puede hacer bien desde que Anthony murió. Este es debido a que el "tónico" tiene alcohol y entonces, Grace comienza a beber demasiado. También, Sully y Danza de nubes tratan de razonar con Luna Negra, líder de los indios rebeldes, quien tiene "visiones de victoria" sobre el ejército.

Mientras todo crece entre Loren y Marjorie, en vísperas del Día de Acción de Gracias, un niño empieza a desarrollar síntomas de difteria, la cual es altamente contagiosa, siendo los niños los más propensos a contraerla. Debido a esto, Michaela envía a Brian y Katie con Sully hasta que la epidemia haya pasado. A pesar de la epidemia, Rebecca y Elizabeth Quinn llegan y se niegan a irse. La tensión crece aún más entre Marjorie y Elizabeth cuando ella se entera de que Marjorie está con Loren. Esto en un mal momento, cuando el niño enfermo y Becky, la mejor amiga de Colleen, mueren de difteria, luego de lo cual Marjorie se contagia también. Mientras todo esto pasa, Michaela y Andrew tienen diferencias de opiniones sobre la intubación, un método que según Michaela ha funcionado, pero que, según Andrew, también trae riesgo de infección y muerte.

El Día de Acción de Gracias está cada vez más cerca y Michaela sigue lejos de Brian y Katie, quienes son cuidados y protegidos por Sully para evitar el contagio. Elizabeth tiene la intención de llevárselos a Boston con ella para que estén más seguros. Marjorie parece haberse recuperado totalmente, pero pronto sufre neumonía. Al no poder ser recuperada, Marjorie finalmente muere, de lo cual Michaela es culpada por su madre. Daniel resulta contagiado por difteria y Michaela duda sobre si usar la intubación para curar a Daniel debido a que el haberla usado o no provocó las muertes de Becky y Marjorie. Sin embargo, Rebecca la convence de que es una buena médico, por lo que Michaela finalmente decide usarla. La epidemia pronto frena y a pesar de todo lo sucedido y de que el ejército vigila la casa de Michaela, Sully logra pasar Acción de Gracias junto a su familia. Mientras, Hank es encarcelado debido a que trata de quemar la aldea de los ocupantes ilegales, que es donde él cree que se originó la epidemia y, a regañadientes, Matthew acepta ser su abogado. Jake y Teresa se acercan aún más cuando usan la escuela como morgue temporal.

Renuentemente, Michaela acepta el rol de jueza temporal cuando Horace demanda a Hank por romperle la nariz por accidente. Con ello, Michaela debe atender una ráfaga de demandas y contrademandas entre los aldeanos. Matthew, quien ha estado estudiando las leyes, avisa que Horace tiene el derecho de que Hank le pague sus cuentas médicas. Michaela se ve en medio de ese caso y en otro de disputa territorial entre Dorothy y Grace, además de una declaración de Loren a punto de estar quebrado por negligencia en el hotel de Preston.

Michaela trata de razonar con un infame hombre que odia a los indios, el Comandante Samuel Morrison, cuando trata de hacer un tratado de paz entre los guerreros indios de Nube Negra y el ejército, lo que incluiría absolución para Sully y le permitiría volver a casa. Muriendo de tuberculosis, Nube Negra acepta rendirse si a sus guerreros se les permite salvoconducto hacia la reservación. Wellend Smith, un emisario enviado por el Presidente Grant, apoya a los indios, pero el Comandante Morrison está decidido a boicotear el acuerdo y ponerlos en prisión. Michaela y Sully deben acudir al Sargento McKay para apoyarlos a ratificar la ley.

Luego de llevar a los guerreros indios de Cuervo Negro a la reservación, Michaela y Sully regresan a casa para Navidad, pero se detienen en el camino para ayudar a una desafortunada joven pareja de casados que deambula en la naturaleza. El joven matrimonio, Chester y Hallie, son antiguos moradores ciudadanos que tratan de encontrar un nuevo asentamiento establecido por sus parientes, pero están irremediablemente perdidos. Mientras, Daniel, quien ha estado deambulando toda su vida, es tentado para renunciar como comisario y aceptar una oferta para hacer una operación minera lejos de Colorado Springs.

Mientras se encontraba en su clínica, Michaela recibe la visita de un misterioso hombre que le dispara a quemarropa, debido a que el hombre enloqueció debido a que su esposa murió mientras era operada por un doctor y lo mató, junto con otros tres médicos. Michaela se recupera, pero enfrenta un trastorno de estrés post traumático, con lo cual tiene pesadillas reviviendo el trauma e incluso desarrolla miedo a salir de su casa y volver a su trabajo, lo cual ella niega constantemente.

Colleen tiene un nuevo pretendiente, Patrick Collins, que al principio es halagado por las atenciones de su nueva pretendiente. Michaela, sin embargo, sospecha de sus intenciones. Rechazando el consejo de su madre de no confiarse mucho con este nuevo forastero, Colleen continúa viendo a su pretendiente, deslumbrada por los regalos que él le da y la atención que él le presta. Pero mientras Patrick se vuelve rápidamente más posesivo y exigente, asustando a Colleen lo suficiente como para terminar con él, se da cuenta de que aquello le queda grande cuando él se niega a ser rechazado y se vuelve físicamente amenazante. Mientras, Sully y Brian escoltan en un viaje en la montaña a un senador y su hijo, Oliver.

Dr. Mike trata de evitar que Loren deje Colorado Springs cuando él planea en secreto vender su almacén y mudarse, debido al dolor por la muerte Marjorie. Sully es obligado a recurrir a sus dolorosas experiencias y recuerdos cuando trata de consolar a Michaela. Mientras, el pueblo se prepara para su "Baile de los Corazones" anual, pero la melancolía parece reinar ahí. Jake se ve indeciso sobre si pedirle matrimonio a Teresa o no, y Sully ofrece apoyo y consejo a Robert E., quien está preocupado porque Grace continúa bebiendo.

Michaela se halla a sí misma combinar sus habilidades medicinales contra un anciano herborista cantonés cuando muchos miembros de un gran grupo de chinos que cruza Colorado Springs buscando trabajo, caen víctimas de fiebre. Ella hace buenas migas con la joven asistente del herborista, quien se presenta como su nieto, pero en realidad resulta ser su nieta. Ambas, y el resto de la comunidad china, están en peligro por las acciones de Hank, quien trata de expulsarlos del pueblo porque él teme que ellos puedan causar una epidemia, luego de lo cual es culpado por quemar el campamento chino, obligando a Daniel a arrestarlo, aún cuando la evidencia no fuera 100% clara.

Mientras Jake y Teresa esperan el día de su boda, Michaela y Sully se las arreglan para liberar a Danza de Nubes, quien fue capturado y puesto en prisión por abandonar la reservación. Dorothy considera ayudarlo a escapar y escapar con él hacia la naturaleza. Teresa presenta a Jake a su tía quien viene de visita al pueblo, Doña Verano, y su primo, Carlos, un sacerdote. La visita se vuelve agria cuando la anciana adquiere un inmediato desagrado por Jake y trata de evitar el matrimonio.

Michaela desarrolla miedo y preocupación por Brian, quien se ha hecho amigo de un de un hombre aparentemente inofensivo, pero muy excéntrico, quien cree que es un ave y se cubre con plumas para intentar volar. Martin Von Hoffman, el hombre pájaro, no sólo trata de volar, sino que también duerme en un nido y literalmente picotea su comida cuando Michaela lo invita a casa a cenar. Para sorpresa de Michaela, Martin resulta ser un fugitivo de un asilo de dementes de Nueva York. Ella está en un dilema entre regresarlo al asilo o permitirle proseguir en paz con su autodecepción. Mientras, Michaela recibe malas noticias de Oliver Wendell Holmes, el famoso abogado al que le pidió ayuda con la defensa de Sully.

Daniel es obligado a arrestar al alguacil Elias Burch por matar a Exner, un ex convicto que había sido perseguido. En vez de aceptar la defensa de un abogado con problemas con el alcohol, Burch le pide a Matthew que lo defienda, declarando que le tendieron una trampa. Pero un novelista que había estado viajando con Exner declara ser un testigo visual que vio a Burch dispararle al hombre a sangre fría. Con la vida de Burch pendiendo de un hilo y poca evidencia que apoye su declaración de que Exner lo apuntó con un arma, el principiante abogado Matthew, con ayuda de Michaela, se las arregla para descubrir lo que en verdad había pasado entre los dos enemigos jurados.

Por más que lo intentan, Michaela y Sully no logran hacer que Grace y Robert E. se reconcilien tras su separación, originada por la depresión de Grace tras la muerte de Anthony. Mientras, al pueblo llega un ring de boxeo, junto a un campeón de boxeo, "Barracuda" Jim Barnes. Tras el éxito inicial, Robert E. decide descargar su ira peleando en el ring. Debido a los golpes que le da Robert E. a "Barracuda Jim", Michaela, tras un examen, le dice que está por perder la vista de su ojo izquierdo si continúa peleando y le implora que se retire, a lo cual el Sr. Barnes se niega. Finalmente, Grace decide detener la última pelea, luego de lo cual Robert E. y Grace se reconcilian.

Luego de que Colleen se gradúa de la escuela en Denver, recibe la noticia de que fue aceptada en la Facultad de Medicina femenil en Filadelfia, donde ella debe estar en tres semanas para completar la inscripción. Colleen se preocupa un poco al ver que ella no tendrá tiempo suficiente para visitar a su familia. Andrew, también preocupado por esto, decide proponerle matrimonio a Colleen. Michaela, sin embargo, se preocupa porque es una decisión muy apresurada. Ella convence a Andrew de que es algo muy apresurado, debido a lo cual él decide cancelar el compromiso. Michaela pronto descubre lo infeliz que es Colleen y se da cuenta de que lo mismo hizo su madre al desaprobar su relación con Sully, por lo que el compromiso se reanuda. Finalmente, Colleen logra casarse con Andrew, terminando todo en felicidad. Mientras, ocurre una crisis económica en Colorado Springs, originada por las deudas que tiene Preston, debido a lo cual Dorothy está por perder su Gaceta y Brian no puede comprarle un buen regalo de bodas a su hermana.