Tras la misteriosa desaparición de un F-14 durante una tormenta conducen la investigación de Harm a pensar en multitud de posibilidades, desde el suicidio del piloto a un acto terrorista pasando por el mito del triángulo de las Bermudas o incluso la intrusión de un OVNI. Finalmente Mac, Harm y Bud descubren que la desaparición es parte de un complot llevado a cabo por paramilitares cuya intención es la de asesinar a los miembros de la organización PLO (Organización para la Liberación de Palestina). Los paramilitares habían secuestrado a la mujer del piloto y a su hijo obligando al piloto "desaparecido" a atacar al avión diplomático cuando este se aproximase a los Estados Unidos, pero Harm, Mac y Bud rescatarán a la familia del piloto antes de que el plan se lleve a efecto.

Mac debe afrontar un nuevo caso como miembro del JAG a bordo del USS Guadalcanal. Esta vez, los hechos apuntan a un homicidio por negligencia y Mac deberá procesar a un Mayor que ha sido acusado por el capitán del barco. Sin embargo, y para sorpresa de Mac, Harm llega al buque con el objetivo de defender al acusado y, a su vez, aprovechar para reconciliarse y aclarar los puntos de su relación con Mac. Sin embargo, ambos quedan tan inmersos en el nuevo caso que apenas les queda tiempo para tratar cuestiones personales. Por otro lado, la ahijada adolescente del Almirante Chegwidden se escapa de su casa, manteniendo a su padrino totalmente ocupado intentando encontrarla.