Teal'c is unhappy with his son's plans to marry. Ishta arrives bringing news that Hak'tyl may be compromised. Complications arise when O'Neill allows Hak'tyl to inhabit SGC until a new homeworld is found for them.

Después de una larga ausencia, Jacob Carter regresa al SGC para decirle a Jack que la galaxia está amenazada de ser tomada por los Replicadores. Los Goa'uld están siendo atacados por los Replicadores y están siendo eliminados rápidamente. Los ejércitos de Ba'al están siendo destruidos y él llega al SGC para sugerir que trabajen juntos para derrotar a su enemigo común. El doble de Carter, RepliCarter, está liderando el ataque y ha secuestrado a Daniel Jackson con la esperanza de descubrir cualquier arma que los Antiguos hayan creado que pueda derrotarlos. Jackson recibe ayuda de una fuente inesperada, la Antigua Oma Desala, o eso cree él.

Sam y Jacob están en el planeta Dakara tratando de configurar el dispositivo de los Antiguos para destruir a los Replicadores de una vez por todas, con la ayuda parcial de Ba'al y Daniel, quien logra congelar a los Replicadores manipulando al duplicado de Carter.

Los Ori desatan una plaga mortal en la Tierra, lo que lleva a un poderoso aliado del pasado de SG-1 a acudir en su ayuda.

La plaga continúa propagándose entre la población de Estados Unidos y el Presidente ha puesto en cuarentena a la nación. Teal'c está suplicando al Alto Consejo Jaffa que rechace el Origen, pero Gerak llega, habiendo sido transformado por los Ori en un Prior. Cameron y Daniel buscan la sangre del Prior que causó la plaga para curarla, pero una vez más han sido capturados por los Sodan.