Mientras aún lidian con la pérdida de Daniel Jackson, el SGC es contactado por los Asgard, quienes requieren ayuda para enfrentar a Anubis, quien parece tener nueva tecnología de escudos que puede repeler las armas Asgard.

El ex coronel Harry Maybourne se acerca a Jack con una propuesta: Jack le consigue un indulto presidencial y Harry les muestra el depósito de armas avanzadas al que Simmons intentaba llegar. Llevan a cabo el trato, pero Harry intenta traicionar a SG-1. Logra pasar por el portal que lleva al depósito, pero con un elemento inesperado, Jack. Se encuentran en un campo y el zat de Harry ha desaparecido. Sin embargo, Jack todavía tiene su P-90. Harry revela que no están en un depósito de armas, sino en una utopía. Tenía la intención de vivir el resto de su vida allí y cree que no hay forma de regresar.

The US and Russia reveal Stargate Command and its operations to representatives of the other permanent members of the United Nations Security Council.

SG-1 investigates a planet that is said to be the home of the Warriors of Sodan, a legendary tribe of Jaffa said to have not served the Goa'uld in 5,000 years. In an encounter with the warriors, Mitchell deals a deadly blow to one of the Sodan and is captured and taken to their village. There he awaits a battle to the death as punishment for his crime.

Daniel Jackson, quien fue dejado atrás luchando contra Adria mientras los demás miembros de SG-1 escapaban a través del Stargate, es encontrado trabajando como un Prior: el mejor en el negocio, que no necesita usar amenazas para convencer a las personas de convertirse a Origin. Con la esperanza de que aún quede algo de su personalidad, el equipo (junto con el General Jack O'Neill) lo secuestra. Daniel explica cómo temporalmente tiene la personalidad y el conocimiento de Merlin en sí mismo, y permitió deliberadamente que Adria lo convirtiera en un Prior, mientras se retrasaba para terminar el arma de Merlin que ella quería, esperando conseguir una nave Ori para el lado de la Tierra. Pero el tiempo se acaba, ya que el equipo tardó inesperadamente mucho en capturarlo. Aún así, los generales, Carter y Vala son muy reacios a liberarlo y abrir el agujero de gusano que necesita para traer el arma. Incluso la Casa Blanca quiere matarlo, o en el mejor de los casos, mantenerlo en estasis hasta que sea revertido a su naturaleza humana mediante la manipulación genética de Merlin. Pero luego su plan se desperdicia, a menos que los demás puedan ser entrenados para hacerlo en su lugar (así que solo ellos corren riesgo, no toda la galaxia en caso de que Daniel sea el Caballo de Troya de Adria). Después de darles la información necesaria, Daniel se libera repentinamente mientras Richard Woolsey está con él y toma el control de una nave espacial después de teletransportar también a Jack, justo después de que los demás hayan emprendido su misión hacia el escondite de Adria, donde Daniel, a punto de ser revertido genéticamente, llega justo a tiempo para inclinar la balanza a su favor.