Mientras los "Héroes" siguen probando sus recientemente descubiertos superpoderes, Claire trata de mantener una vida social normal cuando un romance con el quarterback del equipo, toma un giro trágico. Por su parte Hiro convence a su amigo Ando de que están destinados a viajar a América para salvar al mundo. Una asustada Niki sigue instrucciones de una misteriosa fuente que le llevan al medio del desierto. Por otro lado, Nathan usa el accidente de Peter para relanzar su carrera política. El escurridizo Sylar es cazado por Matt y el FBI, con la colaboración de Suresh, ya que el diario de su padre contenía pistas valiosas.

Suresh por fin consigue encontrar a uno de los genéticamente avanzados "superhombres" de los que hablaba su padre. En Las Vegas, el plan de Hiro fracasa cuando intenta controlar el tiempo para beneficiarse en las mesas de apuestas. Los mafiosos a los que debe dinero Niki usan su deuda para su propio beneficio en un plan bastante elaborado, mientras que Nathan hace una visita a un rico donante de Las Vegas para conseguir fondos adicionales para la campaña. Siguiendo un trágico desenlace de una hoguera, los poderes de Claire son puestos a prueba de forma definitiva, pero de acuerdo con las pinturas de Isaac, su futuro puede estar cargado de incluso más peligros. Mientras tanto, las habilidades de Matt son puestas a prueba por un par de hombres que parecen saber mucho sobre la gente con dones especiales.

Niki, tras volver de una de sus pérdidas de consciencia y de memoria, encuentra a la policía en la puerta de su casa, buscando a D.L. Hawkins, su marido fugitivo. Claire se confiesa a su padre, y Hiro y su amigo son atacados por unos grandes apostadores de Las Vegas. Peter recibe un mensaje, de una fuente desconocida, que cambiará su vida. Mientras tanto, Matt usa a escondidas su poder de leer las mentes para anticiparse a las necesidades de su mujer. Consternado por los sucesos recientes, Suresh planea volver a la India y dejar descansar la memoria de su padre, así como toda su investigación.

Mientras el hombre de las gafas de pasta intenta proteger a su hija por todos los medios, Claire ve como el baile de bienvenida se convierte en una noche aterradora. Nathan y Simone trabajan juntos para recuperar la pintura de Isaac para Peter, pero esta "llave al futuro" podría provocar una tragedia. En otro lugar, Hiro viaja atrás en el tiempo para corregir un error. Niki se fija una meta, y Micah sigue con su padre. Aún experimentando extraños sueños mientras está en la India, Mohinder se vuelve a interesar en la investigación de su padre gracias a un niño.

La historia de este capítulo tiene lugar seis meses antes de los sucesos actuales. El padre de Mohinder, Chandra Suresh, llega a Nueva York para comenzar su búsqueda de los individuos con habilidades extraordinarias, y conoce a alguien muy deseoso de ser especial. Peter celebra su graduación de la Escuela de Enfermeros, y descubre que Nathan seguirá adelante con un caso que podría significar problemas para toda la familia Petrelli. Una visita sorpresa de su padre saca lo peor en Niki. Hiro intenta ser un héroe y cambiar el futuro para algo importante. Claire se une al equipo de animadoras y hace un curioso descubrimiento. Por su parte, el hombre de las gafas de pasta y el Haitiano se encuentran con alguien especial.

Los trágicos sucesos en Texas han tenido tristes y serias repercusiones para muchos de los "héroes", sus familias y amigos. Se revelan los impactantes detalles sobre la predicción de Isaac sobre la bomba nuclear en Nueva York. El nuevo cuadro de Isaac tiene increíbles implicaciones con el futuro de un héroe en crisis. Suresh ya da sus primeros pasos en su nuevo camino. Matt y la agente del FBI Audrey Hanson investigan una brecha en el caso de Sylar. Aterrorizada por los nuevos hechos de Jessica, Niki toma una difícil decisión para proteger a su familia.

La historia se sitúa cronológicamente dos semanas después de lo ocurrido en el último capítulo, con Nathan determinado por salvar a un Peter comatoso, lo que le lleva a acudir a Simone pidiéndole ayuda. La pintura de Isaac "Hiro contra T-Rex" inspira a Hiro y Ando, que comienzan la búsqueda de la espada Samurai. Jessica sigue sin admitir la decisión de Niki de entregarse a la policía. Con su socia Eden muerta y Matt en los talones, H.R.G. intenta centrar sus órdenes respecto a Sylar. Después de que el Haitiano ofreciera a Claire una segunda oportunidad, Claire lucha con los cambios que ha producido la decisión que ha tomado. Retomando la búsqueda de su padre, Suresh intenta compartir la información que tiene sobre quién está "en la lista" de gente con especiales poderes y las amenazas que pesan sobre sus vidas. Mientras tanto, un nuevo héroe hace un impactante debut.

Mientras le persiguen unos desconocidos, la búsqueda de la espada por parte de Hiro da un giro cuando su padre aparece. Un rehabilitado Isaac se dedica a parar la destrucción de Nueva York... y a parar a Peter también. Claude, un hombre invisible con un misterioso pasado, puede tener mucho que enseñar a un futuro héroe. D.L. se las ve con sus nuevas responsabilidades familiares mientras Matt se sincera con su mujer Janice. H.R.G. se centra en su asesino cautivo, Sylar. Después de buscar al Haitiano, Claire se embarca secretamente en la búsqueda de sus verdaderos padres biológicos. Mientras Mohinder trabaja buscando a la gente de "la lista", recibe una inesperada visita.

Hiro lucha por hacer entender a su padre, un magnate importante, y a su ambiciosa hermana su nuevo destino heroico. Niki tiene una nueva oportunidad de estar con D.L. y Micah de nuevo, ¿pero se quedará con ellos? Claude intenta enseñar a Peter a aprovechar sus poderes, pero el proceso podría echar por tierra la confianza de Peter en sus personas más allegadas. Convencida de querer encontrar a su madre biológica, Claire llega a un camping de caravanas en Texas. Mientras tanto, Sylar da un giro inesperado contra H.R.G. y su familia.

Peter se da cuenta de que él y Claude han podido ser traicionados. Matt se une al hombre radiactivo Ted Sprague y a Hana Gitelman, la mujer con habilidades mentales "wireless". Hiro tiene que tomar una decisión dura en cuanto a su misión. Claire ya no puede aguantar su enfado contra su padre.

Matt Parkman y Ted Sprague vuelan a Texas para su búsqueda de respuestas y toman como rehenes al hombre de las gafas de pasta y a su familia. Se revelan nuevos datos sobre el Sr. Bennet, sobre la agencia para la que trabaja y sobre cómo encontró a Claire.

A causa de las elecciones y de la cercanía de la destrucción de Nueva York, Nathan se reúne con Linderman. Hiro intenta robar la espada, lo que le hace dirigirse por un nuevo camino. Suresh y Sylar hacen progresos con la lista, con un coste muy alto. D.L. comienza a sospechar de problemas en casa. Isaac cada vez pinta más cuadros más terroríficos. Una nueva heroína se dará a conocer, Candice Wilmer.

Después de haber robado la espada y haberse teletransportado cinco años al futuro, Hiro y Ando son testigos del futuro triste y horroroso que les espera a nuestros héroes. Habiendo saltado cinco años al futuro, Hiro y Ando descubren que la gente con habilidades extraordinarias no sólo son conocidas en todo el mundo (después de la destrucción de Nueva York y la muerte de millones de personas), además los "héroes" están siendo registrados, encarcelados, cazados e incluso asesinados como "terroristas". Mientras el Presidente da el primer paso hacia una "solución final", Hiro y Ando se verán involucrados en la que podría ser la batalla final de los "Héroes" y se encontrarán con un nuevo y oscuro grupo de caras familiares. Si sobreviven a esta experiencia, ¿podrán volver al presente y salvar al mundo?

Peter cae en manos de gansters irlandeses que saben acerca de su pasado. Hiro intenta contener el daño causado por su viaje en el pasado. Kensei su poder será revelado. Suresh localiza y cura al Haitiano. Matt investiga el asesinato del Sr Nakamura. West trata de saber de los poderes de Claire. Maya y Alejandro encuentran en Mexico que sus facultades son más un obstáculo que una ayuda.

Mónica comienza a mostrar nuevas habilidades mientras practica con Micah, Nana, y Damon. Nana es la abuela de Micah, Monica, y Damon. Todos ellos residen actualmente en Nueva Orleans. Matt pide a Molly que localice al hombre con el que sueña ella. Él puede ser la nueva amenaza de los Héroes. Maya y Alejandro siguen su marcha a los EE.UU. Tanto Claire como su padre sospechan el uno del otro. Angela revela mucho de sus secretos.

Una mujer llamada Elle, esta buscando a Peter. Ando busca a Hiro en el pasado. Matt busca al hombre de los sueños de Molly. HRG da otro paso en su esperanza por proteger a su familia y a el mismo.

Peter comienza su busqueda. West convence a Claire de que se defienda. Hiro lucha contra sus sentimientos hacia Yaeko. Suresh tiene más problemas con la Compañía. GHR intenta localizar más pinturas de Isaac. Alejandro no confía Sylar.

Peter y Caitlin conocen la ultima fase de los efectos del virus de los Héroes. Muchos de los Héroes trabajan juntos para luchar contra el "Hombre Pesadilla". West está conmocionado al conocer la identidad del padre de Claire. Hiro y Kensei, El viaje llega a su fin.

Los acontecimientos de la "de los cuatro meses que faltan" se exploran. Maya y Alejandro deben darse prisa, se explica cómo Peter acabó en Irlanda y lo que sucedió a Nathan, Nikki, y D.L.

En Texas, Peter se enfrenta a sus examigos debido a la engañosa historia de Adam sobre el virus de Shanti. Micah recluta a su madre para rescatar a Monica. Maya está atónita cuando conoce la verdad acerca de su nuevo amigo Sylar. Elle intenta hacer que su padre este orgulloso.

Después de un vistazo al futuro, se desvela quién disparó a Nathan. Matt lo persigue y acaba en un desierto. Hiro recibe un importante mensaje de su padre. Sylar visita a Claire. Maya le da una idea a Mohinder para su investigación. Nathan se recupera y recibe una visita de Linderman

HRG y su nuevo socio van a atracar un banco con cuatro villanos, incluyendo a Peter atrapado en uno de ellos. Hiro y Ando siguen a Daphne hasta Alemania, y se encuentran con el haitiano. Tracy Strauss va a New Orleans para encontrar más información sobre Niki. Meredith enseña a Claire a pelear. Usutu enseña a Matt varios cuadros sobre él.

Viendo un futuro en el que casi todo el mundo tiene poderes, un mundo destinado a la destrucción, Peter decide intentar evitar el fin de la tierra cueste lo que cueste. Esto le lleva a hacerse con un oscuro e incontrolable poder para conseguir salvar al mundo, arriesgándose a que le destruya a él y a todos los que aprecia primero. Por otro lado y después de permitir que la mitad de “la fórmula” de Angela fuera robada, Hiro y Ando se proponen descubrir la identidad del villano que contrató a Daphne, y para ello deben consultar a la persona que más sabe sobre ellos… Adam Monroe. Por su parte, y después del baño de sangre en el banco, HRG decide librarse de su compañero, mientras que Claire, convencida de ser una heroína, se echa a la carretera para perseguir a uno de los villanos que aparecía en los antiguos ficheros de HRG. Mohinder cede a sus impulsos, mientras que Linderman y Molly vuelven de forma inesperada. Un nuevo romance aparecerá entre dos de nuestros Heroes.

Para preparar el futuro encontronazo, Hiro sigue al respetado hombre de negocios, marido y padre, Arthur Petrelli días antes de que "muriese" - para descubrir lo que le llevó a fundar la compañía rival Pinehearst para acabar con Angela. Más tarde, un hecho se desarrollará dónde Sylar, aterrorizado y llevado por la culpa, podría haber detenido su persecución letal de poderes - esto es, si H.R.G. y Elle influyesen desde sus tremendas misiones. Finalmente, bajo el ala del hombre de la Compañía Thompson, la agente en pruebas Meredith comprueba como su vida pierde sentido, con la llegada de su irascible hermano.

Después de reunir a Sylar y Elle, Arthur les ordena que encuentren a Claire y que se la traigan. Matt, Hiro y Ando se reunen como equipo y siguen a Daphne a su lugar de nacimiento de Atenas, Georgia, para así descubrir lo que ella tanto esconde. Mientras, Nathan y Peter Petrelli viajan juntos a Haiti en busca del único hombre que puede detener a su padre en la destrucción del mundo, el Haitiano.

El eclipse continua impactando en las habilidades de los héroes mientras Elle y Sylar se enfrentan a un vengativo H.R.G. mientras Claire lucha por sobrevivir. En Haiti, Peter y Nathan unen sus fuerzas con el Haitiano para luchar contra el hermano de éste, Baron Samedi, y Nathan llega a tomar una decisión muy chocante. Mientras, Ando, Sam y Frack trabajan duramente para que Hiro recupere su memoría con la ayuda de los cómics de "9th Wonders" en una tienda de cómics local.

Con la esperanza de encontrar una manera de detener a Arthur, Hiro y Claire se alían juntos y viajan 16 años al pasado, cuando Kaito da a Claire a H.R.G. A su vez, Peter y el Haitiano se unen para acabar con Arthur de una vez por todas pero son interrumpidos por Sylar. Mientras, en el laboratorio, Suresh da un gran paso con la fórmula que cambiará todo.

Seis semanas después de que Matt y los otros borrasen la mente de Sylar, los Heroes intentan seguir llevando una vida normal. Se nos presenta a una "familia" de feriantes con habilidades. Angela Petrelli y H.R.G. están trabajando para restablecer La Compañía mientras Claire hace nuevos "amigos" en el colegio. Tracy sigue cazando a todos los del Edificio 26, mientras Hiro y Ando comienzan un negocio de "Heroes de alquiler"

Un choque de trenes en Nueva York provoca numerosas víctimas y Peter se desplaza hasta el lugar para ayudar. El único problema es que, cada vez que cura a alguien, su energía disminuye. Por otro lado, a pesar del caos, Emma finalmente logra utilizar sus conocimientos para salvar la vida de una niña. Además, Gretchen tiene tanto miedo tras lo que pasó con Becky que Claire pide al hombre de las gafas de pasta que las ayude. Esto no alivia a Gretchen, que decide tomar el primer vuelo a casa y dejar la escuela. Claire pronto descubre que no es a ella ni a Gretchen a quien quiere matar Becky. Por otro lado, Samuel se despierta en casa de Lidia como Nathan. Asustado, Nathan se pone la ropa de Sylar y vuela a Nueva York, donde se desmaya en los brazos de Peter. Nathan tiene problemas y necesita ayuda.

Tras perder el control de sus poderes, Tracy se refugia en el apartamento del hombre de las gafas de pasta, donde Claire se la encuentra medio derretida. Cuando Claire trata de ayudarla, Tracy la congela. Afortunadamente, Claire logra regenerarse. Por otro lado, Peter acompaña a Nathan en su primer día de vuelta al trabajo, pero se encuentran con el Haitiano. En vez de lavar sus cerebros por orden de Angela, el Haitiano envía a Peter a un almacén que contiene la respuesta que los hermanos buscan: el cadáver embalsamado de Nathan. Los hermanos deciden ir a buscar a Matt, que está a punto de morir en un hospital de Texas. Peter le cura, sacando a la superficie a Sylar.

Noah descubre que la brújula ha desaparecido y que Claire tiene muchas posibilidades de habérsela llevado. Lauren se ofrece para utilizar la tecnología de la CIA con el objetivo de localizar el teléfono móvil y averiguar así hacia dónde se dirige la joven.

Tras el tiroteo de la feria, Eli se encuentra con Claire en la caravana de Samuel. Éste tiene un plan para poner a la joven de su parte: mostrarle los recuerdos del hombre de las gafas de pasta. Al parecer, su primera esposa estaba embarazada cuando fue asesinada por un 'especial'. El hombre, como venganza, cazó a otro personaje con poderes y lo mató. La Compañía, entonces, lo reclutó y le obligó a casarse con Sandra.

La historia de este capítulo tiene lugar seis meses antes de los sucesos actuales. El padre de Mohinder, Chandra Suresh, llega a Nueva York para comenzar su búsqueda de los individuos con habilidades extraordinarias, y conoce a alguien muy deseoso de ser especial. Peter celebra su graduación de la Escuela de Enfermeros, y descubre que Nathan seguirá adelante con un caso que podría significar problemas para toda la familia Petrelli. Una visita sorpresa de su padre saca lo peor en Niki. Hiro intenta ser un héroe y cambiar el futuro para algo importante. Claire se une al equipo de animadoras y hace un curioso descubrimiento. Por su parte, el hombre de las gafas de pasta y el Haitiano se encuentran con alguien especial.

Los trágicos sucesos en Texas han tenido tristes y serias repercusiones para muchos de los "héroes", sus familias y amigos. Se revelan los impactantes detalles sobre la predicción de Isaac sobre la bomba nuclear en Nueva York. El nuevo cuadro de Isaac tiene increíbles implicaciones con el futuro de un héroe en crisis. Suresh ya da sus primeros pasos en su nuevo camino. Matt y la agente del FBI Audrey Hanson investigan una brecha en el caso de Sylar. Aterrorizada por los nuevos hechos de Jessica, Niki toma una difícil decisión para proteger a su familia.

Noah descubre que la brújula ha desaparecido y que Claire tiene muchas posibilidades de habérsela llevado. Lauren se ofrece para utilizar la tecnología de la CIA con el objetivo de localizar el teléfono móvil y averiguar así hacia dónde se dirige la joven.

Con la esperanza de encontrar una manera de detener a Arthur, Hiro y Claire se alían juntos y viajan 16 años al pasado, cuando Kaito da a Claire a H.R.G. A su vez, Peter y el Haitiano se unen para acabar con Arthur de una vez por todas pero son interrumpidos por Sylar. Mientras, en el laboratorio, Suresh da un gran paso con la fórmula que cambiará todo.

El eclipse continua impactando en las habilidades de los héroes mientras Elle y Sylar se enfrentan a un vengativo H.R.G. mientras Claire lucha por sobrevivir. En Haiti, Peter y Nathan unen sus fuerzas con el Haitiano para luchar contra el hermano de éste, Baron Samedi, y Nathan llega a tomar una decisión muy chocante. Mientras, Ando, Sam y Frack trabajan duramente para que Hiro recupere su memoría con la ayuda de los cómics de "9th Wonders" en una tienda de cómics local.

Después de reunir a Sylar y Elle, Arthur les ordena que encuentren a Claire y que se la traigan. Matt, Hiro y Ando se reunen como equipo y siguen a Daphne a su lugar de nacimiento de Atenas, Georgia, para así descubrir lo que ella tanto esconde. Mientras, Nathan y Peter Petrelli viajan juntos a Haiti en busca del único hombre que puede detener a su padre en la destrucción del mundo, el Haitiano.

Los acontecimientos de la "de los cuatro meses que faltan" se exploran. Maya y Alejandro deben darse prisa, se explica cómo Peter acabó en Irlanda y lo que sucedió a Nathan, Nikki, y D.L.

Tras perder el control de sus poderes, Tracy se refugia en el apartamento del hombre de las gafas de pasta, donde Claire se la encuentra medio derretida. Cuando Claire trata de ayudarla, Tracy la congela. Afortunadamente, Claire logra regenerarse. Por otro lado, Peter acompaña a Nathan en su primer día de vuelta al trabajo, pero se encuentran con el Haitiano. En vez de lavar sus cerebros por orden de Angela, el Haitiano envía a Peter a un almacén que contiene la respuesta que los hermanos buscan: el cadáver embalsamado de Nathan. Los hermanos deciden ir a buscar a Matt, que está a punto de morir en un hospital de Texas. Peter le cura, sacando a la superficie a Sylar.

Un choque de trenes en Nueva York provoca numerosas víctimas y Peter se desplaza hasta el lugar para ayudar. El único problema es que, cada vez que cura a alguien, su energía disminuye. Por otro lado, a pesar del caos, Emma finalmente logra utilizar sus conocimientos para salvar la vida de una niña. Además, Gretchen tiene tanto miedo tras lo que pasó con Becky que Claire pide al hombre de las gafas de pasta que las ayude. Esto no alivia a Gretchen, que decide tomar el primer vuelo a casa y dejar la escuela. Claire pronto descubre que no es a ella ni a Gretchen a quien quiere matar Becky. Por otro lado, Samuel se despierta en casa de Lidia como Nathan. Asustado, Nathan se pone la ropa de Sylar y vuela a Nueva York, donde se desmaya en los brazos de Peter. Nathan tiene problemas y necesita ayuda.