Una alianza inestable entre la Flota Colonial y los rebeldes Cylon es puesta a prueba cuando los dos grupos unen esfuerzos para eliminar un "Resurrection Hub" Cylon. Mientras tanto, Athena pierde el control cuando Hera se siente extrañamente atraída por Natalie.

El secuestro de la Presidenta Roslin por parte del Híbrido Cylon desencadena una amarga lucha de poder dentro de la Flota Colonial.

D'Anna exige que los cuatro Cylons de la flota sean enviados a la nave basestar. Solo Tory va, mientras que los otros tres son atraídos repentinamente hacia la Viper de Kara por la música. Finalmente se encuentra la ruta hacia la Tierra.

Explorando el planeta se descubre que no hay vida excepto plantas. La destrucción ocurrió aproximadamente 2.000 años antes. Entre las ruinas se encuentran esqueletos y restos de Centuriones de un tipo diferente. Pero un examen más detallado de los esqueletos revela que ¡son Cylon! ¿Podría ser que la 13ª Tribu realmente haya sido solo Cylon? El Jefe Tyrol, el Coronel Tigh, Sam Anders y Tory recuerdan haber vivido en el planeta y morir allí. ¿Cómo llegaron a las colonias? Starbuck encuentra un trozo de su Viper y, a pesar de las advertencias de Leoben, comienza a buscar la cabina... Roslin pierde la fe en los Rollos de Pithia. Apollo y Dualla parecen reconciliarse, pero él necesita descubrir qué decirle a la gente de la Flota... Una tragedia lleva a Adama a confrontar a Saul.

La Flota se niega a cooperar con los ingenieros cylon y Adama decide poner fin a esto. Envía un mensaje al Quórum declarando que a menos que deseen unirse a Zarek en la celda, deben poner a su gente en orden. Sin embargo, Gaeta ya ha liberado a Zarek con la ayuda de otros supuestos revolucionarios. Permiten que Zarek abandone Galactica en un raptor. Aterriza en Colonial One y entra en una reunión del Quórum. Mientras tanto, Anders es emboscado y capturado. En el CIC, Gaeta manipula astutamente a todos los demás hasta que llega el momento de que la revolución comience.

Roslin está a bordo de un raptor en camino a la Base Estelar Rebelde de los Cylon, pero Gaeta ha ordenado que lo ataquen y destruyan. Los marines han utilizado una granada aturdidora contra Adama y Tigh. Roslin logra enviar una transmisión inalámbrica para que todos escuchen y se enteren de lo que Gaeta ha hecho. Ella y los demás apenas logran llegar a la Base Estelar, donde convence a Tory y a los demás Cylon de utilizar la Flota como cobertura para evitar que Gaeta la ataque. También cree que Adama podrá salvar al resto de los Cuatro Finales. Temporalmente a salvo, los Cylon Rebeldes comienzan a votar si deben simplemente saltar y aceptar sus pérdidas. Adama es llevado ante Gaeta y Tigh es encarcelado con Caprica Six, Anders, Athena, Helo y su hija Hera. Zarek llega a bordo de Galactica en Colonial One con el Quórum. A instancias de Gaeta, Zarek acepta llevar a Adama a juicio por traición, con Romo Lampkin asignado como su abogado defensor. Solo hay un problema: el Quórum se niega a reconocer la autoridad de Zarek. Sin embargo, Zarek está decidido a seguir su máxima de "La verdad es contada por aquellos que quedan en pie". Solo Tyrol, que está solo, y Lee, que está con Starbuck, son la última esperanza de Galactica.