Paddington, que se ha establecido con la familia Brown en Windsor Gardens, se ha vuelto popular en su comunidad y ofrece a las personas apoyo emocional de diversas formas. Para comprar un libro emergente único de Londres en la tienda de antigüedades de Samuel Gruber para el cumpleaños número 100 de su tía Lucy, Paddington realiza varios trabajos ocasionales y ahorra su salario, pero el libro es robado. Paddington lo persigue, pero el culpable escapa y Paddington es incriminado y arrestado. Aunque Gruber y los Browns no creen que Paddington haya robado el libro, sin evidencia de que el ladrón existiera, Paddington es condenado y encarcelado por error. El ladrón pronto regresa a casa y se revela que es Phoenix Buchanan, un actor egoísta que vive frente a los Brown.

Como resultado de la Conferencia de Berlín de 1884-1885, la Cuenca del Congo es reclamada por el rey Leopoldo II de Bélgica, quien gobierna el Estado Libre del Congo en unión personal con la Historia de Bélgica#Imperio. El país está al borde de la bancarrota, ya que Leopoldo ha pedido grandes cantidades de dinero para financiar la construcción de transporte ferroviario en la República Democrática del Congo y otros proyectos de infraestructura. Envía a su enviado Léon Rom (Christoph Waltz) para asegurar los legendarios diamantes de Opar (ciudad ficticia). La expedición de Rom es emboscada y masacrada. Un líder tribal, el jefe Mbonga (Djimon Hounsou), le ofrece a Rom los diamantes a cambio de un viejo enemigo: Tarzán.