Jack (Matthew Fox) logra abrir los ojos, después de muchos esfuerzos. Se levanta poco a poco y la imagen que percibe es la de la arena de una playa. Su mirada se va adaptando a la situación y percibe que está cerca de la selva. Su mente trata recordar lo que le ha sucedido, cuando oye gritos desesperados y explosiones. De repente recuerda que viajaba en un avión. El vuelo no tenía problemas hasta que unas turbulencias hicieron que los pasajeros fuesen sacudidos de forma violenta. Y a continuación.una fuerte explosión. Luego.el vacío. Jack descubre que el avión se ha partido, por lo que intenta buscar la otra parte para saber si hay más supervivientes. Pero, sobre todo, para averiguar si hay algún equipo de radio que permita informar de la localización del accidente. El silencio de la noche, que envuelve al resto del avión y a los supervivientes que tratan de asimilar lo sucedido, se rompe con un terrible estruendo. Parece que la isla esconde un misterio aún por descubrir.

Jack (Matthew Fox) y Kate (Evangeline Lilly) deciden buscar el receptor que puede encontrarse en la otra parte del avión siniestrado. Los supervivientes han construido un campamento en la playa. Cuando tratan de curar a los heridos y de reponerse de lo ocurrido son atacados por una extraña criatura. Entre tanto, piensan en sus vidas antes del accidente, en las que hay más de algún secreto que no quieren que sea desvelado. Después de encontrar el receptor descubren que está dañado. Sayid (Naveen Andrews), un ex guardia de la dictadura iraquí conseguirá arreglarlo. Pero para poder enviar una señal deberán hacerlo desde más altura. Se forma un grupo expedicionario que intentará subir a lo más elevado de la isla para enviar una señal de socorro. La expedición resulta atacada por un oso blanco, que es abatido por Sawyer (Josh Holoway). El receptor recibe una señal de socorro que fue enviada hace 16 años. Charlie (Dominic Monaghan) se pregunta en qué lugar se encuentran.

El grupo regresa al campamento base pero, instados por Sayid, acuerdan entre ellos no hablarle al resto de los supervivientes sobre el extraño mensaje de radio en francés. Jack y Hurley descubren que la prisionera es Kate, pero deciden ocultarlo a los demás y a la propia Kate. Finalmente el Marshall muere cuando su situación es crítica y Sawyer decide dispararle para acabar con su sufrimiento. Jack le dice a Kate que no necesita saber su secreto, que todos en la isla han vuelto a renacer y es lo que importa. A Michael no le gusta la amistad de su hijo con Locke. Aún así, Locke construye un silbato con el que atraer a Vincent, el perro de Walt, pero hace que el niño piense que ha sido su padre el que lo ha recuperado. Música en este capítulo: "Leavin´ On Your Mind" - Patsy Cline "Wash Away" - Joe Purdy

Mientras los supervivientes están alrededor de un fuego escuchan ruidos en la selva. Todos se alarman y van a por las armas que tienen a mano. De pronto, surge de entre la oscuridad la figura de una mujer. Sayid, al reconocerla, tranquiliza a todos. Es Rousseau, la mujer francesa. Está asustada y les avisa de que están en peligro ya que “los otros” les acechan. Rousseau desvela al resto de lo supervivientes que es miembro de un equipo de científicos que llegaron a la isla, después de un naufragio. Pero para sorpresa de todos les dice que en esa época ella estaba embarazada. ¿Dónde está el hijo de Rousseau? Mientras, en la playa Michael y Jin ultiman la construcción de la balsa para salir de la isla. Claire continúa preocupada por el futuro de su bebé, sobre todo después de conocer la historia de la mujer francesa. Charlie no deja de ofrecerse para prestarle ayuda. El joven se siente con el deber de proteger a Claire y al recién nacido. Jack, Locke, Kate y Sayid continúan empeñados en abrir la escotilla. Para ello utilizan dinamita. Por fin Michael consigue finalizar la balsa y la llenan de provisiones. Los elegidos para ir en busca de ayuda son Michael, Walt, Jin y Sawyer. Ha llegado el momento de despedirse de los supervivientes que se embarcan. Sun ha preparado un diccionario para que Michael, Walt y Sawyer puedan comunicarse con su marido Jin. Todas las esperanzas están puestas en ellos y en averiguar qué es lo que hay detrás de la escotilla.

Michael junto con sus compañeros ya han empezado a navegar, mientras en la isla los demás supervivientes se refugian en las cuevas. Entre las mujeres empieza a haber inquietud y a creer que lo que les ha sucedido es un castigo. Por otro lado, Jack y los demás encuentran la dinamita. Azt advierte del peligro de manipulación de la dinamita. Michael, Walter Lloyd, Jin y Sawyer consiguen a duras penas hacerse a la mar con la embarcación que han construido. En la playa quedan el resto de los supervivientes, con todas las esperanzas puestas en ellos. Pero mientras intentan gobernar la balsa son sorprendidos por algo inesperado. Esta nueva sorpresa puede poner en peligro sus planes para intentar pedir ayuda y rescatar a sus compañeros.

Un visitante al campamento podría representar una amenaza para el hijo de Claire.

Sawyer sigue convaleciente, y su estado está haciendo que Kate empiece a recordar los motivos por los cuales fue arrestada. Pero además, empieza a sospechar que Sawyer está poseído por el espíritu del agente que la arrestó. Michael está inspeccionando el interior del bunker, cuando descubre que hay unas puertas que estaban ocultas. Locke anima a Michael y a Eko para que vean la grabación que hay dentro del laboratorio. Atónito ante lo que está viendo, Eko les informa que él había descubierto, en el otro lado de la isla, un lugar como el que se encuentran y una filmación muy parecida. Flash back de Kate En el descubriremos que hizo Kate para ser perseguida por la policia y como empezó una fuga, además de saber el motivo por el cual su madre la teme.

Juliet pide a Jack que intervenga a Ben pero éste dice que no superará la operación. Mientras, la vida de Sawyer está en peligro ya que Dani, uno de los guardianes de Ben, ha decidido que es una amenaza para la comunidad. Kate recuerda una parte de su pasado, lo que la llevará a tomar una importante decisión. Jack, presionado tanto por Kate como por Juliet, elegirá qué hacer respecto a una importante oferta de Ben. Y al mismo tiempo Locke descubre oculto un mensaje que cree que posiblemente les ayude a resolver los secretos de la isla.

Los "Otros" han decidido abandonar el campamento y Locke, tras su descubrimiento se ha unido a ellos. Kate, drogada, es abandonada en la selva esposada junto con Juliet. Kate tiene la determinación de regresar a por Jack, y ambas, aunque desconfiadas, se unirán en su carrera por la supervivencia. En este episodio Kate recuerda sus intentos por reconciliarse con su madre. Mientras, en la playa, Hurley comunica a Sawyer que los supervivientes han decidido hacer una votación para desterrarle. Sólo si les pide perdón y cambia su conducta podrá lograr que le dejen permanecer en el campamento.

Un universo paralelo, en el que nunca ocurrió el accidente, se revela como una consecuencia de la detonación de la bomba. Mientras tanto, Sawyer culpa a Jack por la pérdida de Juliet y la verdadera identidad del monstruo se revela.

Jack, Sawyer, Kate, Miles y Hurley, luchando por salvar a Sayid, se enfrentan a un antiguo secreto. Mientras tanto, un falso Lock sale de la cámara para asombro de todos.

Cuando Sawyer deja el templo, Kate y Jin son enviados para traerlo de vuelta. Mientras tanto, los Otros determinan que Sayid está infectado e intentan envenenarlo. En la realidad paralela, Kate lleva a claire al hospital.