Después de una elaborada configuración, Tony y Ziva irrumpen en una instalación clasificada de la Marina; sin embargo, esa prueba en sí misma es una estratagema para identificar a un topo dentro del NCIS. Gibbs y Lee se encuentran en la sala de chat, y Gibbs dice que ahora trabajan juntos.

Tony y McGee intentan sin éxito seguir al hombre que recoge a Lee; un satélite lleva al grupo a una casa con una habitación secreta y un cuerpo muerto; una segunda vigilancia produce un resultado diferente, lo cual lleva al equipo a una solución, un atrapamiento y más.

Durante una partida de póker en la casa del SecNav, un agente de ICE muere mientras está en el detalle de protección; Gibbs y su equipo investigan con el apoyo del FBI y de ICE. Un hombre invisible se vuelve visible y aparece muerto. Tony arresta a Michael, quien se resistirá.

Alguien dispara y mata al oficial ejecutivo (XO) de un buque naval, un comandante, en su propia camarote; Gibbs y su equipo investigan. Sin embargo, llega una psicóloga (persistente y presumida) para realizar evaluaciones psicológicas obligatorias a todos los miembros del equipo, y los acompaña a bordo del barco. Ziva reconoce los casquillos gastados como rusos. La noticia del asesinato se propaga rápidamente, ya que hay siete periodistas internacionales a bordo como invitados; un reportero hace una confesión y revela un posible polvorín. El equipo continúa y finalmente encuentra la solución. Mientras tanto, la psicóloga también continúa, provocando una serie de flashbacks, principalmente relacionados con Kate Todd, una ex miembro y agente especial. Eventualmente Tony y Gibbs se dan cuenta de quién es la psicóloga, luego ella entrega su informe al director.

Gibbs y Tony siguen a EJ y a su equipo hasta un edificio casi vacío; descubren que el asesino P2P ha matado a Levin, dejado gravemente herido a Cade y secuestrado a EJ; Gibbs persigue al sospechoso y a EJ; la encuentra, abandonada a su suerte para sofocarse. McGeek rastrea un número de teléfono hasta CI-Ray (el novio de Ziva). Ducky, con la ayuda de Gibbs, explica los cambios en el modus operandi del asesino. EJ secretamente saca un pequeño objeto del antebrazo izquierdo de Levin. Ziva intenta interceptar a Ray, pero Cobb, el sospechoso, la intercepta y la secuestra; más tarde, mientras Gibbs, Tony, McGee y EJ están presentes dentro de una habitación de hotel, Cobb llega, entra y se rinde, pero se niega a decir dónde puso a Ziva. Sin embargo, Abby proporciona pistas sobre un lugar donde el grupo más Ray encuentra y rescata a Ziva, quien da explicaciones. De regreso en la sede, Cobb escapa con dos rehenes; Gibbs y los demás lo siguen; una confrontación pone fin a la carrera del asesino P2P. El SecNav renuncia y su sucesor le asigna a Tony una tarea altamente sensible y clasificada.