Kurt decide inscribirse en el equipo de fútbol americano del instituto para tapar las sospechas de su padre sobre su sexualidad. Quinn le dice a Finn que está embarazada y que el hijo es de él. Sue se alía con Sandy, el ex director del coro, para conspirar contra Will.

Puede que Artie no pueda viajar con el grupo a la competición, así que Will reta a los chicos a experimentar la vida desde un punto de vista diferente.

Cuando Kurt hace que su padre y la madre de Finn empiecen a salir, no cuenta con que las cosas no salgan como esperaba. Sue obliga a Mercedes a perder peso, mientras April Rhodes regresa para ayudar a Will y al Glee Club.

Cuando un problema en la gargante impide a Rachel cantar en condiciones, se pone de manifiesto el poco esfuerzo que ponen el resto de miembros del Glee Club en los ensayos. Por eso, Will les hará enfrentarse, individualmente, a sus compañeros cantando una canción que refleje el momento que están viviendo.

El señor Schuester anima a los chicos del Glee Club a expresarse a través de la música de Lady Gaga. Mientras tanto, Tina explora su lado gótico.

Cuando Will y Sue son bombardeados por los recortes presupuestarios, Finn y Rachel tratan de encontrar nuevos reclutas para New Directions, mientras tanto al equipo de fútbol se agrega la nueva entrenadora de fútbol americano Shannon Beiste, que temporalmente deja a Finn fuera del equipo por Sam, Quinn sustituye a Santana como jefa de las Cheerios, Tina y Mike empiezan a salir, Charice es la estudiante de intercambio de Filipinas.

Cuando New Directions quiere llevar a cabo canciones de Britney Spears en la Fiesta de la Asamblea, Will se resiste a aceptar. Al mismo tiempo, Brittany, Santana, Rachel, y Artie van a la consulta del dentista y nuevo novio de Emma, Carl, para tener sus dientes limpios, la experiencia de Britney Spears les hace fantasías mientras están bajo anestesia. Artie se une al equipo de fútbol.

Al ver el rostro de Jesús en su sándwich de queso a la parrilla, Finn tiene una crisis existencial, debido a esto, los chicos hablan de religión y la importancia para ellos. Kurt también se enfrenta a una crisis cuando su padre Burt tiene un ataque al corazón y queda en estado de coma. Sue tiene sus propias creencias y habla con su hermana Jean acerca de Dios también.

Will Schuester propone un desafío de duetos en el que los ganadores ganarán una comida gratis. Esto causa algunos problemas sentimentales entre los miembros del club.

Después de que Will se entera del nuevo amor de Emma por The Rocky Horror Picture Show, impulsivamente decide que el club Glee interprete la música, sin embargo, hay un problema tras otro, incluyendo a Sue quien va encubierta para exponer al club ante los límites en la televisión.

Will Schuester presenta la segunda competición anual de chicos contra chicas. Entretanto, Puck finalmente sale del centro de detención de menores.

Will se enferma y es reemplazado por la profesora suplente Holly Holliday (estrella invitada Gwyneth Paltrow). Mientras tanto, Sue se hace cargo como directora cuando Figgins también se enferma, y dobla su poder en la secundaria.

La caza nazis y madre de Sue, Doris Sylvester (Carol Burnett) hace una visita debido a la boda de Sue con ella misma, Finn y Kurt se preparan para el matrimonio de sus padres, y la administración tiene una postura en contra de Karofsky, quien conduce a Kurt dejar la secundaria McKinley.

New Directions, los Warblers y los rebeldes se enfrentan en las locales, resultando un empate entre New Directions y los Warblers. El romance entre Carl y Emma se desarrolla, llevándolos al matrimonio, dejando en consternación a Will.

El personal educativo hace el típico intercambio de regalos de Santa, pero Sue altera el resultado a su favor. Mientras tanto, Finn decide aclarar su mente con las vacaciones de invierno que se avecinan. Artie descubre que Brittany todavía mantiene la creencia en Santa Claus.

Está planeada una gran actuación en el descanso del partido de fútbol americano en el instituto McKinley. Los animadores de Sue tienen problemas en el estatal.

Will Schuester asigna al club Glee realizar canciones de amor en honor del Día de San Valentín. El club también establece una cabina de besos para la ocasión. Mientras tanto, Blaine (Darren Criss) y la Academia Dalton realizan «When I Get You Alone» en una tienda de ropa Gap.

Rachel intenta volver al nivel social alto de la secundaria McKinley, con la ayuda de Brittany. Sam forma una banda tributo con los chicos del club (a excepción de Finn), interpretando dos canciones de Justin Bieber.

El señor Schuester hace que el club cante una canción sobre el consumo de alcohol entre menores, pero el mensaje podría perder impacto cuando llegan a clase con resaca.

Cuando el espíritu libre y profesora sustituta Holly Holliday llega para ser la profesora de educación sexual, se une con el señor Schuester para enseñar a los niños de New Directions los hechos de la vida. Mientras tanto, Emma dirige el Club de celibato, y ella y el Dr. Carl resuelven algunos problemas en su vida personal.

Comienza con los Warblers practicando para las regionales, y deciden que Kurt y Blaine serán los que canten, luego su mascota Pavarotti muere. Quinn planea un plan para recuperar a Finn, se planean canciones originales para las regionales, Algunos cantan canciones de mal gusto en una práctica de originales. Blaine y Kurt hablan acerca de la competencia y Blaine confiesa que le gusta, terminan besándose. Las regionales comienzan y Aural Intensity comienza con una canción cristiana (por el jurado), los Warblers presentan sus canciones a capella, New Directions presenta sus dos canciones originales, el jurado luego de una discusión sobre religión, homosexualidad, etc., deciden darle la victoria a New Directions, lo que enfurece a Sue y golpea a la mujer que da los resultados. Kurt y Blaine entierran a Pavarotti y luego se van de la mano. Termina con Will enviando saludos al club por parte de Holly, y Will le entrega un reconocimiento a Rachel

El señor Schuester quiere conseguir dinero para enviar a los chicos al nacional. Sandy forma el Club del Saboteador con la mirada puesta en el Glee Club.

Finn le rompe la nariz a Rachel de forma accidental durante un ensayo de baile. La campaña para convertirse en reina del baile se caldea entre las chicas.

El director Figgins le pide a los miembros del club Glee que canten en la fiesta de graduación del colegio McKinley [pese a las objeciones de la coordinadora del baile (Sue)]. Mientras tanto, en el concurso para elegir al rey y a la reina del baile se calientan los ánimos.

Piden al grupo Nuevas Iniciativas que actúe en el baile tras la cancelación de Air Supply. Los estudiantes intentan conseguir pareja para el baile de graduación.

Nuevas Iniciativas sigue su lista de estrategias establecidas para las nacionales con un poco de ayuda de Jessie St. James (estrella invitada Jonathan Groff). Mientras tanto, la muerte de Jean Sylvester (Robin Trocki) da un giro en las vidas de los estudiantes del colegio McKinley, especialmente a la de su hermana Sue Sylvester.

Nuevas Iniciativas va a Nueva York para participar en el concurso nacional de coros, donde se enfrentan de nuevo a Vocal Adrenaline y al resto de coros ganadores del país.

Shelby Corcoran regresa a los pasillos del instituto McKinley. Mientras, el señor Schuester inicia un taller para algunos de los miembros de Nuevas Iniciativas.

Un nuevo estudiante de intercambio extranjero, Rory Flanagan (Damian McGinty) llega a la secundaria Mckinley.

Sue comienza una campaña de desprestigio para derrotar a su mayor rival en la carrera por un escaño en el Congreso.

La carrera por la presidencia de la secundaria McKinley llega a su fin. Llega el día de la elección de Sue. La vida se hace más complicada para Quinn y Puck. Santana es rechazada por su abuela después de confesar su homosexualidad, y Rachel pone en peligro los planes de New Directions al no participar en el coro de la próxima competencia de las Locales ya que cambia las votaciones en favor a Kurt y es expulsada una semana.

Will intenta organizar una sorpresa especial para Emma y recluta al Glee Club para que la chica caiga rendida a sus pies.

New Directions reta a los Warblers de Dalton y a su nuevo líder Sebastián (Grant Gustin), por el derecho a interpretar una canción de Michael Jackson en las Regionales. Mientras tanto, Rachel (Lea Michele) verá si acepta o rechaza la propuesta de Finn.

El amor está en el aire para las personas de la secundaria McKinley, es el segundo episodio del Día de San Valentín de Glee. 62 Los padres gay de Rachel, Hiram y LeRoy Berry (Jeff Goldblum y Brian Stokes Mitchell) hicieron su debut.

Las cosas se calientan cuando el grupo Nuevas Iniciativas y los Gorriones, de la Academia Dalton, se enfrentan en el estatal.

El Club Glee rinde homenaje a la fallecida Whitney Houston. Por otra parte, los preparativos para la boda de Will y Emma se mantienen en pie.

Se efectuan las graduaciones de los alumnos del año 2012.

La temporada empieza con los miembros de Nuevas Iniciativas compitiendo para convertirse en la próxima estrella del Glee Club. Llega una nueva remesa de estudiantes.

A medida que el año 2012 se acerca a su fin, Sam y Brittany viven la vida al máximo antes del apocalipsis maya. Entretanto, Kurt tiene una Navidad que nunca olvidará.

Los miembros de Nuevas Iniciativas interpretan los grandes éxitos de Stevie Wonder. Mientras tanto, Artie recibe noticias que podrían afectar a su futuro.

Los miembros de Nuevas Iniciativas rinden homenaje a los Beatles y cantan clásicos como "Yesterday", "Drive My Car" y "A Hard Day's Night".

La familia McKinley del pasado y del presente celebra la vida de Finn Hudson con interpretaciones de canciones como "Seasons of Love" y "Fire & Rain".

Los miembros de Nuevas Iniciativas viajan a la soleada ciudad de Los Ángeles para competir en el nacional y se llevan a dos invitados especiales.

Rachel da un paso más en su compromiso con su papel en "Funny Girl". Entretanto, Kurt es víctima de un crimen de odio debido a su orientación sexual.

Rachel y Kurt no se ponen de acuerdo sobre cómo dirigir Nuevas Iniciativas. Mientras tanto, Becky regresa al instituto McKinley con un nuevo novio.

Brittany y Santana se preparan para su gran día, y Sue, sorprendentemente simpática, anima a todos a que sigan los dictados del corazón.

Nuevas Iniciativas vuelve al año 2009 y los miembros originales revelan por qué se inscribieron en el Glee Club.

En este emocionante broche final de la serie, el instituto McKinley se despide y los antiguos y actuales miembros del Glee Club dicen adiós para siempre.

El señor Schuester anima a los chicos del Glee Club a expresarse a través de la música de Lady Gaga. Mientras tanto, Tina explora su lado gótico.

Cuando un problema en la gargante impide a Rachel cantar en condiciones, se pone de manifiesto el poco esfuerzo que ponen el resto de miembros del Glee Club en los ensayos. Por eso, Will les hará enfrentarse, individualmente, a sus compañeros cantando una canción que refleje el momento que están viviendo.

Al ver el rostro de Jesús en su sándwich de queso a la parrilla, Finn tiene una crisis existencial, debido a esto, los chicos hablan de religión y la importancia para ellos. Kurt también se enfrenta a una crisis cuando su padre Burt tiene un ataque al corazón y queda en estado de coma. Sue tiene sus propias creencias y habla con su hermana Jean acerca de Dios también.

Un nuevo estudiante de intercambio extranjero, Rory Flanagan (Damian McGinty) llega a la secundaria Mckinley.

Cuando el espíritu libre y profesora sustituta Holly Holliday llega para ser la profesora de educación sexual, se une con el señor Schuester para enseñar a los niños de New Directions los hechos de la vida. Mientras tanto, Emma dirige el Club de celibato, y ella y el Dr. Carl resuelven algunos problemas en su vida personal.

A medida que el año 2012 se acerca a su fin, Sam y Brittany viven la vida al máximo antes del apocalipsis maya. Entretanto, Kurt tiene una Navidad que nunca olvidará.

La caza nazis y madre de Sue, Doris Sylvester (Carol Burnett) hace una visita debido a la boda de Sue con ella misma, Finn y Kurt se preparan para el matrimonio de sus padres, y la administración tiene una postura en contra de Karofsky, quien conduce a Kurt dejar la secundaria McKinley.

Se efectuan las graduaciones de los alumnos del año 2012.

Los miembros de Nuevas Iniciativas interpretan los grandes éxitos de Stevie Wonder. Mientras tanto, Artie recibe noticias que podrían afectar a su futuro.

Los miembros de Nuevas Iniciativas viajan a la soleada ciudad de Los Ángeles para competir en el nacional y se llevan a dos invitados especiales.