Sydney logra escapar de los guardaespaldas de Sawari que quieren atraparla porque ha presenciado cómo un equipo sanitario implanta una bomba en el marcapasos de un orador. Dixon roba una ambulancia y, mientras son perseguidos, intenta extraer el dispositivo explosivo. Lamentablemente, Jacbnoud lo activa antes de que pueda terminar la intervención. Will, el amigo de Sydney que investiga la muerte de Danny, ha descubierto que el vuelo no viajaba a Hong Kong sino a Singapur. Además, Kate Jones, la mujer que se sentaba a su lado, tampoco se subió a dicho avión. Will se cita con la misteriosa joven, que admite que mantuvo un romance con Danny. Para sorpresa de ella, Will la informa de que, según la seguridad social, lleva muerta desde 1973.

El equipo de salvamento organizado por Jack cumple a la perfección su cometido y Sydney está a salvo. Con la nueva información conseguida, Jack y Sydney viajan al lugar marcado por las coordenadas ocultas y encuentran una caja con una desagradable sorpresa. En el intento por recuperar la memoria de Sydney, Sloan advierte de la existencia de un Doctor especializado en técnicas de recuperación de memoria. Vaughn, Jack y Sydney visitan al Doctor Brezzel (David Cronenberg), el excéntrico neurólogo profesor de Yale que puede sacar a Sydney de la oscuridad de sus últimos dos años.

Sark (David Anders) es retenido por las fuerzas de seguridad francesas y extraditado a los Estados Unidos. Sydney (Jennifer Garner) y Vaughn (Michael Vartan) esperan a pie de pista el aterrizaje de su avión, pero no llega. Mientras, el senador George Reed (Raymond J. Barry, Ley y Orden, CSI) ha sido enviado para dirigir la operación. Se trata del padre de Lauren Reed, la esposa de Vaughn y también agente doble del Pacto y la CIA. Finalmente, Sark aterriza en el desierto y escapa, asesinando a los guardias y secuestrando a los hijos de Dixon (Karl Lumbly). George Reed no quiere negociar con terroristas, pero Jack sugiere que se abran las negociaciones para ganar un poco de tiempo. Por otro lado, Sloane y Barnett deciden terminar su relación.