Después de conocer realmente quién fue el asesino de su amiga Lilly, Veronica está trabajando en un restaurante, donde recibe la visita de un compañero de clase, Kevin, que le pide ayuda. Ha dado positivo en el control antidopaje a pesar de estar limpio desde hace 10 meses. Ella declina ayudarle, ya que ya no se dedica a resolver casos. Todo cambia cuando Wallace tampoco pasa el test: Veronica se mete de nuevo en el mundo de la investigación. La ciudad de Neptune está revolucionada por un nuevo suceso acaecido al principio del verano. Por otra parte, la nueva profesora de periodismo organiza una visita a un estadio de béisbol. Los alumnos, que van en autobús hasta el lugar, conocen al candidato a alcalde, Woody Goodman, y a su hija, Gia. Keith asiste a un programa de televisión donde habla de un libro que ha escrito junto a un periodista: “Gran asesinato, pequeña ciudad”. Además, Logan pasa el día en cada de los Casablancas junto a sus amigos, Dick y Cassidy, y la joven madrastra de estos, Kendall.

Sorprendentemente, una persona ha sobrevivido al accidente de autobús. Veronica tiene sentimientos encontrados, ya que se siente culpable de que Meg se encuentre en coma, pero alegría por seguir viva. El sheriff Lamb investiga el caso del accidente de autobús. Su principal vía de investigación es el conductor del autobús, Ed Doyle, un hombre casado y con 2 hijos. Resulta que Ed no tomaba la medicación que tenía recetada y podría ser un suicidio. Jessie, la hija de Doyle, va en busca de Veronica para que la ayude y demuestre que su padre no se suicidó, ya que, si es así, la aseguradora no les dará el dinero que deberían recibir. Por otra parte, una alumna nueva, Jackie, llega a la clase de Wallace, que queda totalmente prendado. Se presenta voluntario para acompañarla a secretaría y así poder acercarse a ella. Más tarde, alguien ha chocado con el Porsche del padre de Jackie y le ha dejado una nota en la que se mofa. Wallace se ocupa de buscar a la persona culpable. Además, Woody Goodman, el candidato a alcalde de Neptune, le pide a Keith que se presente a las elecciones para sheriff.

Beaver pide a Verónica que le ayude a investigar a su madrastra, Kendall, ya que piensa que está engañando a su padre. Pero esta ibvestigación desvelará secretos que nadie imaginaba. Por su lado, Wallace comienza a salir con la nueva alumna, aunque sabe que a Verónica no le hace mucha gracia.

Duncan habla con Verónica para que entre ambos pueden ayudar a uno de los niños de los que Meg hacía de canguro que es maltratado psicológicamente por sus padres. Mientras tanto Dick, Beaver y Kendall se reunen para ver lo que Big Dick les ha dejado.

Veronica encuentra el anuario de su instituto, donde ve a su madre y se plantea si la conocía tan bien como se pensaba e investiga buscando a viejos amigos de su madre. Mientras, la hermana de Logan, Trina, hace de directora de la función de teatro del instituto y tiene algún que otro percance con Kendall.

Duncan desaparece con el bebé de Meg. Lamb debe cooperar con dos agentes del FBI que tratan de sacar información a Veronica. Wallace confiesa la razón real por la que ha vuelto a Neptune..

Jane, la nueva novia de Wallace, pide ayuda a Verónica para buscar a su hermana mayor, quien ha desaparecido misteriosamente después de su fiesta de despedida de soltera. Mientras, Logan encuentra mas dificultades para vivir en Neptune cuando una revista publica la historia de su padre. Beaver y Kendall siguen con su mano a mano con referente a la compañía que está creando el primero.

Lo que debía ser un caso simple de averiguar cómo un paria social pasa a ser la revelación estrella del campus cuando salen a la luz nueves secretos el accidente de autobús, y Veronica vuelve a investigar el asesinato de Lilly. Mientrastanto, Wallace y Jackie intentar recuperar su buena relación y el PCHers acude a Weevil para que le proteja de los Fitzpatricks.

Veronica ayuda a Gia a descubrir quien la está acosando pero todo se complica cuando Keith es contratado por un escandalo en el que se ve envuelto el padre de Gia. Logan organiza una fiesta de promoción alternativa cuando la oficial se cancela. Wallace y Jackie solidifacan su nueva relación.

Después de su absolución por el asesinato de Lilly Kane, Aaron sale a la calle, cosa que decepciona a Veronica. Keith le dice que tienen que seguir adelante, ya que seguro que Aaron recibirá su merecido. Al llegar a la oficina, Veronica lee que el padre de Meg ofrece dinero por la captura de Woody Goodman. Keith recibe la llamada de Vinnie Van Lowe, que le ofrece trabajar juntos en la búsqueda de Woody. Vinnie posee información valiosa que puede ayudar a Veronica y a Keith a encontrar a Woody. Entre esa información, Veronica encuentra ciertos datos que le ayudan a resolver ciertas cuestiones de su pasado. Por otra parte, el día de la graduación llega y Keith está exultante. En la ceremonia, Veronica se lleva una gran sorpresa. Además, Veronica sueña con cómo sería su vida si Lilly no hubiera sido asesinada. Mientras tanto, Veronica encuentra la pista definitiva que revela el culpable del accidente de autobús. Nuevamente, la vida de Veronica vuelve a correr peligro.

Veronica ha llegado a la universidad, lo que no hace que deje de investigar casos de sus compañeros de estudios. Esta vez, el compañero de habitación de Wallace, Piz, pide ayuda a veronica mars porque le han robado todas sus cosas. Mientras, una ola de violaciones se extiende entre las chicas de la residencia.

Verónica quiere entrar cómo fotógrafa en el periódico de la facultad. Para ello, la someten a una prueba: debe investigar a la hermandad Zeta Theta y tratar de descubrir el secreto que guardan. Verónica sospecha que pueden ser las culpables de las violaciones.

Duncan habla con Verónica para que entre ambos pueden ayudar a uno de los niños de los que Meg hacía de canguro que es maltratado psicológicamente por sus padres. Mientras tanto Dick, Beaver y Kendall se reunen para ver lo que Big Dick les ha dejado.

Después de conocer realmente quién fue el asesino de su amiga Lilly, Veronica está trabajando en un restaurante, donde recibe la visita de un compañero de clase, Kevin, que le pide ayuda. Ha dado positivo en el control antidopaje a pesar de estar limpio desde hace 10 meses. Ella declina ayudarle, ya que ya no se dedica a resolver casos. Todo cambia cuando Wallace tampoco pasa el test: Veronica se mete de nuevo en el mundo de la investigación. La ciudad de Neptune está revolucionada por un nuevo suceso acaecido al principio del verano. Por otra parte, la nueva profesora de periodismo organiza una visita a un estadio de béisbol. Los alumnos, que van en autobús hasta el lugar, conocen al candidato a alcalde, Woody Goodman, y a su hija, Gia. Keith asiste a un programa de televisión donde habla de un libro que ha escrito junto a un periodista: “Gran asesinato, pequeña ciudad”. Además, Logan pasa el día en cada de los Casablancas junto a sus amigos, Dick y Cassidy, y la joven madrastra de estos, Kendall.

Sorprendentemente, una persona ha sobrevivido al accidente de autobús. Veronica tiene sentimientos encontrados, ya que se siente culpable de que Meg se encuentre en coma, pero alegría por seguir viva. El sheriff Lamb investiga el caso del accidente de autobús. Su principal vía de investigación es el conductor del autobús, Ed Doyle, un hombre casado y con 2 hijos. Resulta que Ed no tomaba la medicación que tenía recetada y podría ser un suicidio. Jessie, la hija de Doyle, va en busca de Veronica para que la ayude y demuestre que su padre no se suicidó, ya que, si es así, la aseguradora no les dará el dinero que deberían recibir. Por otra parte, una alumna nueva, Jackie, llega a la clase de Wallace, que queda totalmente prendado. Se presenta voluntario para acompañarla a secretaría y así poder acercarse a ella. Más tarde, alguien ha chocado con el Porsche del padre de Jackie y le ha dejado una nota en la que se mofa. Wallace se ocupa de buscar a la persona culpable. Además, Woody Goodman, el candidato a alcalde de Neptune, le pide a Keith que se presente a las elecciones para sheriff.

Beaver pide a Verónica que le ayude a investigar a su madrastra, Kendall, ya que piensa que está engañando a su padre. Pero esta ibvestigación desvelará secretos que nadie imaginaba. Por su lado, Wallace comienza a salir con la nueva alumna, aunque sabe que a Verónica no le hace mucha gracia.

Veronica encuentra el anuario de su instituto, donde ve a su madre y se plantea si la conocía tan bien como se pensaba e investiga buscando a viejos amigos de su madre. Mientras, la hermana de Logan, Trina, hace de directora de la función de teatro del instituto y tiene algún que otro percance con Kendall.

Jane, la nueva novia de Wallace, pide ayuda a Verónica para buscar a su hermana mayor, quien ha desaparecido misteriosamente después de su fiesta de despedida de soltera. Mientras, Logan encuentra mas dificultades para vivir en Neptune cuando una revista publica la historia de su padre. Beaver y Kendall siguen con su mano a mano con referente a la compañía que está creando el primero.

Lo que debía ser un caso simple de averiguar cómo un paria social pasa a ser la revelación estrella del campus cuando salen a la luz nueves secretos el accidente de autobús, y Veronica vuelve a investigar el asesinato de Lilly. Mientrastanto, Wallace y Jackie intentar recuperar su buena relación y el PCHers acude a Weevil para que le proteja de los Fitzpatricks.

Después de su absolución por el asesinato de Lilly Kane, Aaron sale a la calle, cosa que decepciona a Veronica. Keith le dice que tienen que seguir adelante, ya que seguro que Aaron recibirá su merecido. Al llegar a la oficina, Veronica lee que el padre de Meg ofrece dinero por la captura de Woody Goodman. Keith recibe la llamada de Vinnie Van Lowe, que le ofrece trabajar juntos en la búsqueda de Woody. Vinnie posee información valiosa que puede ayudar a Veronica y a Keith a encontrar a Woody. Entre esa información, Veronica encuentra ciertos datos que le ayudan a resolver ciertas cuestiones de su pasado. Por otra parte, el día de la graduación llega y Keith está exultante. En la ceremonia, Veronica se lleva una gran sorpresa. Además, Veronica sueña con cómo sería su vida si Lilly no hubiera sido asesinada. Mientras tanto, Veronica encuentra la pista definitiva que revela el culpable del accidente de autobús. Nuevamente, la vida de Veronica vuelve a correr peligro.