Mientras el capitán Archer se ducha comienzan a surgir problemas con los paneles de gravedad de la cubierta E que son subsanados rápidamente. Otros problemas surgen con la comida, con la temperatura, fluctuaciones de energía, etc. El jefe de ingeniería Trip Tucker determina que el flujo del extractor del plasma de la nave está siendo limitado por alguna razón afectando a muchos sistemas de la nave. Salen de velocidad warp y T'Pol localiza una distorsión en la estela de la nave que les hace encontrar una nave camuflada en su estela. Al descubrirlo entran en contacto con ellos contestan distanciándose como les ordenaron y solicitando que no les ataquen. Explican que sus motores están averiados y los utilizaban para poder viajar. Al desconectar el sistema de camuflaje muestran su buena voluntad. Trip debe ayudar a la nave extraterrestre durante tres días en las reparaciones a las que ha de someterse arreglando sus problemas de propulsión. Pero antes de entrar ha de pasar un periodo de decomprensión que le hace pasar bastante mal rato. En la sala de máquinas empieza a encontrarse mal, con falta de concentración y síntomas de fiebre, y Trena'l (Randy Oglesby), el capitán de la otra nave, aconseja que el ingeniero descanse para así poder aclimatarse mejor. Archer le ordena dormir por lo menos una hora y Trip cumple la orden a regañadientes. Cuando despierta se encuentra bastante mejor y charla amigablemente con una de las alienígenas de la otra nave, la ingeniera Ah'len (Julianne Christie), pero al tocarse saltan chispas entre ambos y ella le explica que es algo normal. Su nueva amiga le muestra su planeta Vera mediante un holograma, hasta la tierra del suelo parece real gracias a fotones resecuenciados; la imagen cambia y están en el mar en un bote , allí le invita a jugar con un bol lleno de gránulos donde ambos sumergen las manos (hacen falta 4 manos para jugar) y les permite leerse las mentes. Regresa a la Enterprise encantado con lo que ha

Archer y la tripulación buscan mas información sobre la nueva raza hostil, los Xindi.

La Enterprise está a punto de una confrontación con los Xindi cuando de pronto toman a una extraña pasajera, una hermosa esclava Rajiin.

Archer, Reed y el Mayor Hayes se infiltran en una colonia minera Xindi con el objeto de descubrir el arma de destrucción masiva que usarán contra la tierra.

Una nave Andoriana al mando del comandante Shran llega a la Expansión Délfica para ayudar a la enterprise del ataque Xindi.

Archer finalmente se encuentra cara a cara con Degra, el diseñador de la super arma Xindi, a quien trata de forzar para que revele su ubicación.

Acher va en una misión suicida para destruir el sitio de construcción de la super arma Xindi, mientras la Enterprise está bajo ataque.

Archer es devuelto a la nave inexplicablemente después de una brutal tortura por parte de los Xindi. La Enterprise se recupera de los daños sufridos por el ataque de los Reptilian. Archer se entera que hay una facción del consejo Xindi que quiere dialogar con él, pero son varios años luz y la nave esta averiada.

Habiendo llegado a las esferas metálicas para un encuentro secreto con Degra, el supervisor de armamentos Xindi. Archer trata de convencerlos de que los humanos no son sus enemigos, mientras la tripulación repara los graves daños de la nave.

Yendo a enfrentar al consejo Xindi, la nave se encuentra con su gemela conducida por sus propios descendientes quienes les advierten a Archer que el atajo por el subespacio los llevara 100 años al pasado, asegurando de esa manera la destrucción de la tierra.

T'Pal y Reed van en una expedición a unas extrañas esferas metálicas causantes de la expansión Délfica, mientras Archer va al consejo Xindi a evitar diplomáticamente un ataque a la tierra.