Capitán Tom Chandler y la tripulación del USS Nathan James partieron hacia el Ártico con dos virólogos civiles, Dr. Rachel Scott y el Dr. Quincy Tofet, que afirman estar estudiando las aves. Cuando son atacados por un grupo de renegados de las fuerzas rusas, Chandler se entera de estos virólogos están recolectando en realidad muestras de la fuente de un virus mortal que ha acabado con más de la mitad de la población humana, mientras que han estado en el mar. Mientras se dirigen a casa bajo las órdenes del gobierno de Estados Unidos restante, Chandler y su equipo se dan cuenta de que el hogar es una sombra de lo que fueron, y el lugar más seguro para desarrollar una vacuna para esta enfermedad mortal es en el mar en su barco.

Chandler y su cabeza tripulación a la base militar de EE.UU. en Guantánamo con la esperanza de recogida de alimentos, suministros médicos y reposiciones de combustible. Tres equipos son enviados a llevar a cabo estas tareas variadas. Una vez allí, son atacados por los presos de Guantánamo escapado y contar con la ayuda de un contratista privado canoso que ha estado sobreviviendo durante semanas y vivir de la tierra.

En el final de la serie, es una guerra total mientras Chandler debe enfrentar sus miedos y confrontar la mayor amenaza que jamás ha enfrentado.