Malcolm es el tercer hijo de Lois y Hal, tiene otros 3 hermanos (Francis, Reese y Dewey) con los que normalmente se suelen meter en muchos problemas. En este episodio se descubre que Malcolm es un niño genio, tiene un coeficiente intelectual (IQ) de 165 por lo cual lo traspasan a una clase avanzada lo cual le trae problemas al ser catalogado como un KrelBoyne (Nerd).

Francis está de nuevo en casa! Debe cuidar a sus hermanos mientras Hal y Lois van a una boda de la familia; al parecer todo es normal pero hay un truco... El regreso de Francis a casa y abandonar la academia militarizada Marlin, dependerá de su comportamiento en esta ausencia de sus padres.

Malcolm golpea a un niño de 7 años, la culpa lo remuerde por haber hecho eso sin saber que era tan solo un niño, busca varias formas para enmendar su culpa... Mientras tanto Hal tala un arbol de su patio y el vecindario se pone furioso por eso, ya que ese arbol cubría su casa y nadie queria verlos.

Los Kenarban hacen una pijamada de la noche a la mañana en casa de Stevie, Malcolm tiene que sufrir la vigilancia de los padres hasta que ambos se escapan a jugar videojuegos justo donde roban la silla de Stevie por lo que Malcolm lo tiene que llevar en varias cosas para poder llegar a la casa de Stevie.

Francis escapa de la militarizada para poder ver a su novia Bibi. Accidentalmente, Malcolm se lo dice a su mamá.

La escuela de Malcolm ha preparado un día de campo, todos los alumnos de la clase de avanzados han preparado proyectos para la feria de ciencias y Malcolm tambien está incluido, solo que le molesta tener que hacerlo... Malcolm tratará de sabotear el dia de campo para no tener que enseñar su presentación en público...

Lois es despedida de su trabajo en la tienda de abarrotes después que Dewey se robara una botella de licor de $150 dolares, esto lleva a la familia a una crisis económica... Por esta razón los niños de la escuela creen que la familia de Malcolm es pobre y les dan comida enlatada. Lois enfrentará a su jefe para que le devuelva el trabajo.

Malcolm trata de evitar ir al funeral de la tía Helen para poder asistir a un concierto con Julie Houlerman, por lo que se le ocurre varios intentos para logra su objetivo mientras que Reese intenta dejar en el ataud de su tía un muñeco roto que se supone que iba ser un regalo para Dewey.

Reese se une a la escuadra de porristas para impresionar a una chica.

Malcolm quiere aprender a andar en patines y le pide a Hal que sea su instructor, pero él tiene sus propios métodos para enseñarle a Malcolm como se debe patinar, sin embargo, Malcolm empieza a cuestionar sus métodos debido a que son muy extraños.

Lois va a la escuela militar para cuidar a Francis, mientras Hal quien sufre de su ausencia empieza a ayudarle a los Kreelboys a hacer un robot pero... todo se sale de control cuando Hal se adueña totalmente del proyecto para sus propias intenciones.

Francis va a visitar la casa para poder tener con los muchachos un día de brujas posterior al día festivo, para eso construirán una catapulta. Mientras que Hal está muy incomodo por un conductor imprudente, donde construye un tope. Sin embargo, lo destruye. Hal le enseña una lección, robando y mandando al fondo de un lago el automóvil.

los Kenarbans invitan a Malcolm y su familia a cenar en un restaurante, donde ya en el lugar Stevie juega con Reese un juego muy pesado, Abe se va con Hal al bar a tomar y Kitty se queda con Lois donde ella le enseña a no reprimir su furia. Al final Stevie se venga de Reese, Abe queda completamente ebrio y Kitty por primera vez saca su furia reprimida.

Mientas Hal y Lois van a una convención, una niñera sexy va a cuidar a los muchachos.

Para perderse el baile, Malcolm hace que le den terapia. Lois y Hal descubren que tienen segundo baño, sin embargo, lo esconden. Francis se encarga de lavar ropa en la militarizada.

Malcolm recibe un papel en una obra de teatro de la escuela y está obsesionado con los chismes.

Después de haber sido golpeado por una niña en una pelea de lucha grecoromana, Reese abandona su imagen de la intimidación, provocando que los niños que le tenían mucho temor empiezen aprovecharse de la situación para poder vengarse de Malcolm por hacer comentarios burlones hacia ellos. Mientras tanto, Francis trata de evitar su cumpleaños en la academia porque los cadetes afeitan "todo" el vello corporal a la persona que celebra su cumpleaños 17.

Después de romperle por accidente el brazo a una anciana, Malcolm debe ayudarla en sus labores cotidianas. Richie, el amigo de Francis, es enviado a la militarizada, donde se gana la amistad del comandante.

Malcolm conoce a la nueva niña Cynthia, que comienza a tener un flechazo con él.

Hal termina en crisis por mención de un niño de la clase de Dewey, así que deja el trabajo y se pone a pintar. Francis se ve obligado a trabajar en Lucky Aide.

Malcolm es enviado al hospital por razones equívocas mientras que el resto de la familia juega risk. Francis y los cadetes van a una huelga de hambre porque Spangler se llevó su televisión.

Reese es enviado a una clase de cocina por un castigo, luego resulta que tiene talento y le gusta cocinar, pero lo sacan de la clase por hacer trampa para ganar un concurso.

Lois obliga a Malcolm a que le dé clases a Reese para que suba sus calificaciones. Los esfuerzos llegan ser positivos, sin embargo, el maestro de Reese quien está en contra de él trata de sabotear sus esfuerzos para poder enviarlo a una clase de lento aprendizaje y Malcolm quien ya sabe las intenciones del maestro, tratará de resolver un examen en lugar de Reese para que él pase con una buena calificación. Como historia secundaria, Francis se pelea con su madre y se va a vivir con Richie.

Malcolm, Reese y Stevie planean ir a la feria del condado porque ya son los ultimos días que estará en la ciudad, pero Dewey los escucha y no tienen de otra más que llevarlo. Para ir, engañan a Lois y Hal diciendoles que irán a la casa de Stevie y él hace lo mismo con sus papás diciendo que dormirá en la casa de Malcolm, sin embargo, ya en la feria los muchachos quedan atrapados, pero también huyen de un malvado oficial de policía.

Malcolm y su familia se van de vacaciones con los Kenarbans en una casa flotante junto a un gran lago, mientras que Francis sufre un accidente provocando que deje la escuela militarizada y se emancipe.

Francis se emancipa y trata de tener una platica con Lois para poder aclarar la situación pero ella se niega a escucharlo, mientras, Malcolm tiene un nuevo maestro, quien somete a todo el grupo Krelboyne con un estricto sistema educativo, diseñado para denigrar a todos los inteligentes. Al final, Malcolm sabotea el sistema de calificaciones del profesor.

Después de tener una novia, Malcolm descuida a toda la familia. Dewey empieza a tener un nuevo amigo, lo cual todo termina cuando Dewey le arruina su fiesta de cumpleaños.

Lois hace que los muchachos trabajen en una iglesia sin fines de lucro con bienes materiales. Después de una serie de eventos, que van desde el comercio de sus propias cosas y el robo de la mercancía, crearon un mercado negro. Lois los castiga, vendiendo todas sus cosas. Francis llegó finalmente a su destino en Alaska.

Hal juega poker con sus amigos, Lois consigue bailar y Francis se ve atrapado en una tormenta de nieve en Alaska.

Cynthia regresa de Europa y Malcolm descubre que su cuerpo ha tenido cambios drasticos. Por otra parte, Dewey intenta enseñar a Hal como llevar una cometa, ya que éste último tiene un trauma infantil relacionado con éstas. La amiga de Lois; Karen se vuelve sobria, y le cuenta que beso a su marido con todo y lengua en año nuevo. Y Francis trata de encontrarle el significado a su vida en Alaska con un tótem.

Hal es asignado como Director Técnico del equipo deportivo de Dewey para poder entrenar a todo el equipo de fútbol, pero sus tecnicas muy ineficientes hace que todo el equipo sea un desastre. Mientras, Malcolm se obsesiona con un juego de computadora cuyo equipo es un obsequio de su vecino, pero Reese lo tiene a su merced por descubrir que él tiene aventuras con muchas mujeres y él tiene mucho temor de que Reese se lo diga a su esposa.

Hal, junto con sus amigos, juegan poker extremo. Malcolm, Stevie, y Reese se ven obligados a pasar la noche con 2 niñas populares en su cuarto. Reese le dice a una que Stevie tiene una enfermedad mental, y Malcolm descubre que la otra tiene una pistola automática

Lois va al deber del jurado, sin embargo, su imparcialidad y un error provocan que la expulsen. Malcolm y Reese ven a la mamá de Stevie desnuda sobre el fin de semana y no pueden dejar de jactarse sobre ella mientras que, junto con Dewey y Stevie, pasan el día explorando una alcantarilla. Hal y Abe piensan que es el caso de Lois que tiene es el caso de Reyes, y pasa el día que prueba sus propias teorías en quién tiene la parte culpable. Atrapan a Francis y a los otros individuos en hedientos con un oso afuera.

Después de que Kevin (amigo de Malcolm) hiciera un experimento desconocido para todos, su salón se contamina y los Kreelboys están obligados a juntarse con cada una de las pandillas que hay en la escuela. Dewey padece de varicela, mientras que Hal se obsesiona con derribar fichas de dominó. Francis descubre que el terreno donde esta construida su casa es una reserva india, así que abre un casino en su casa.

Malcolm entra a la preparatoria y su forma de ver el mundo ha cambiado. Llevaba una buena reputación hasta que Lois lo humilla sin querer. Dewey pasa más tiempo solo en casa, así que le dedica ese tiempo a la música. Francis empieza a descubrir que Otto no sabe administrar el rancho correctamente.

Al ver que Reese puede esquivar cualquier tipo de problemas, desde los que tiene con su madre hasta los de la preparatoria, con solo haciéndose el estúpido y cantar la canción de "Menti Mentas", Malcolm decide imitarlo y recurre a "apagar su cerebro" cada vez que tiene que enfrentarse a una situación difícil. Así logra conquistar a una chica boba sin saber que eso le traería serios problemas. Stevie se queda con la familia de Malcolm durante un tiempo hasta que sus padres regresen de Hawái.

Malcolm tiene una serie de enfrentamientos con Reese aplicando el viejo estilo "ojo por ojo, diente por diente",esto a unos pocos días de que sea el cumpleaños de Malcolm y hace que Hal y Lois se pongan histéricos provocando que no vayan a la obra teatral de Dewey, pero hay retazos que muestran de como Malcolm y Reese inician su riña poco a poco.

Malcolm se enamora de una bella joven luego de darle clases particulares de trigonometría. Parecía disfrutar de su vida, sin embargo, el padre de la joven se rehúsa a que su hija ande de enamorada del "niño listo". Malcolm tendrá que ingeniárselas para verla sin ser descubierto.

Malcom descubre que si en lugar de decir todo lo malo que va a decir y mejor solamente lo piensa, evade muchos problemas y su vida mejora. Por otro lado, Hal descubre el deporte de trote pero también descubre un nuevo enemigo, hasta que lo descubre haciendo trampa. La novia de Reese lo invita a un concierto, pero éste no puede ir por no tener auto. Es entonces que Reese se ve forzado a recurrir a Craig.

Hal invita a su viejo amigo Larry de la universidad para pasarla bien, pero acaban destruyendo un muro de su casa. Luego le harán una pequeña visita a su viejo jefe para vengarse de él.

Malcolm va con todos los dotados a un octatlón académico, donde descubre que uno de los participantes ha estado haciendo trampa, por lo que Malcolm decide hacer lo mismo para que todos los participantes ganen, pero él termina perdiendo.

En esta continuación de escenas pasadas Hal y Lois elaboran un testamento para sus hijos pero a la vez empiezan a tener una discusión por sus grandes deudas económicas que tienen. Al final, terminan portándose como padres normales, y el episodio termina recordando el final del episodio «El cumpleaños de Lois». Curiosidades: El episodio muestra flashbacks de otros episodios.

Malcolm conoce a Leonard, un señor que siempre está jugando ajedrez y nunca deja de quejarse del mundo que lo rodea. Gracias a él, empieza a preguntarse a qué se dedicará de mayor. Dewey comienza a hacer cosas locas porque según él, el bebé se lo está "diciendo", lo que causa el enojo de Lois y Hal. Francis posa desnudo para pintores.

Las muchachas calientes, populares desean ser vistas con Reese, Malcolm y Stevie como venganza en sus novios. Una de ellas "desea" besar a Reese, pero los muchachos los dejan, porque tienen que conseguir pañales a Jamie. Dewey cuenta a Jamie una historia elaborada, en la cual sus padres son realmente ricos. En esta historia Dewey encuentra los "pantalones perfectos", que se ocultan en la casa hermosa de sus padres y Francis es un robot que les sirve a Lois y a Hal. Hal desea comprar pañales para Jamie pero no puede pagarlos, así que él tiene que trabajar para Craig en el ayudante afortunado. Allí él y otros empleados comienzan una revolución para derrocar a Craig.

Stevie queda impactado al saber que sus padres se están divorciando. Reese encuentra y lee el diario de una muchacha (y está enamorado con el dueño original), que resulta ser Lois. Dewey desea regresar al infantilismo.

Malcolm filma a Reese para una asignación de psicología de la escuela, sin saber que el propósito de la grabación es para humillar a Reese. Dewey trabaja como ejecutante de la calle, hasta que sus padres se expropian sus ganancias.

Malcolm es parte del equipo del boletín de noticias de la escuela. Cuando un estudiante aparece con una historia brillante, Malcolm decide a publicarla a pesar de la naturaleza del gráfico y de las exhibiciones, saliendo del bloque principal para cancelar todas las actividades extracurriculares más bien que "dando vuelta a la secundaria en una librería de adulto".

Lois boicotea Luigi (La Pizzería preferida de la familia), mientras que Malcolm flecha a hija de una familia intelectual, y sigue implicado con la familia en el proceso. Mientras, Hal y Reese siguen yendo a comer a la pizzería, en secreto.

Polly, la niñera de Jamie (Julie Hagerty) causa competencia entre Abe y Craig para ver quien de los dos sale con ella en una cita.

Dewey, después de que reprobara en su examen de IQ, se mete en una clase especial pero de niños con problemas, Hal participa en un concurso de baile con Craig.

Malcolm y Stevie intentan separar dos bases de su experimento sin tener éxito pero descubren que Reese logra resolver su experimento, sin embargo, Reese no se acuerda qué fue lo que hizo. Gracias a la técnica de recordar todo una cosa en tiempo, descubren que el techo tiene la solución.

Kitty, la mamá de Stevie regresa y comenta que vivió la vida loca y llego a ser estrella porno, pero Lois la rechazara. Stevie dará un discurso por ganar un premio pero Reese lo arruinara todo.

Malcolm compra un auto usado, al que le dedicara mucho dinero. Reese hace apuestas en el Hipódromo. Lois descubre que Craig tiene una aventura con la esposa del gerente y Hal abre una estética.

Hal se enoja con Lois por haber comprado un colchón nuevo por ser muy grande, mientras Dewey toma ventaja de esto y compone su ópera sobre la pelea que hay entre sus padres.

Después de salvar a Dewey de ser atropellado por un camión, Ida pierde una pierna. Malcolm y Reese tratan de pegarse la cabeza con un líquido adhesivo súper fuerte. Dewey tiene la conciencia intranquila por no poder hacer nada por la abuela, así que le hace un funeral a su pierna, pero un perro termina comiéndosela.

Reese esta harto de que Malcolm siempre defienda a Stevie y que a él lo traten como un tonto y decide pelear con Stevie entumiéndose las piernas para que sea una batalla justa, pero Stevie le tiene una sorpresa. Dewey se enganche en los cigarrillos gracias al ex-fumador Hal y los muchos cigarrillos alrededor de la casa. Lois intenta hacer que Jamie hable poco diciéndole su vida moderna y sus años de escuela secundaria. Las primeras palabras de Jamie son "Callate mamá" en respuesta a su madre que no para de hablar.

Stevie acaba de salir de cirugía y Malcolm quiere ir a visitarlo, pero siempre pierde el tiempo con cualquier cosa, hasta que Hal platica con él y decide ir a verlo directamente. Hal va al lago con Jamie a jugar con su lancha a control remoto, pero sin querer se sienta en la banca de un niño, y éste tiene una mejor lancha que Hal, por lo que hunde el barquito de Hal varias veces, hasta que él se harta y busca una manera de derrotar al niño, Malcolm le ayuda y al final derrota al niño, pero este se deprime porque el barco se lo había dejado su abuelo antes de morir.

En el capítulo final de esta serie, Malcolm, Reese y Dewey deciden quemar el único secreto que los tenía unidos porque ya no estarán más juntos, hacerle creer a Lois que tiene cáncer, se saben los deseos de Lois y Hal. Pasan tres meses y se ve que Dewey comprara un cohete y Jamie ya muestran signos de que serán muy problemáticos al igual que sus hermanos, Francis tiene un empleo igual al de su padre y vive feliz con Piama, Reese es conserje de su antigua escuela, Malcolm tiene que trabajar para poder seguir pagando sus estudios, y en la casa Hal se exalta cuando recibe la sorpresa de que Lois muestra una prueba de embarazo con resultado positivo.

los Kenarbans invitan a Malcolm y su familia a cenar en un restaurante, donde ya en el lugar Stevie juega con Reese un juego muy pesado, Abe se va con Hal al bar a tomar y Kitty se queda con Lois donde ella le enseña a no reprimir su furia. Al final Stevie se venga de Reese, Abe queda completamente ebrio y Kitty por primera vez saca su furia reprimida.

Malcolm, Reese y Stevie planean ir a la feria del condado porque ya son los ultimos días que estará en la ciudad, pero Dewey los escucha y no tienen de otra más que llevarlo. Para ir, engañan a Lois y Hal diciendoles que irán a la casa de Stevie y él hace lo mismo con sus papás diciendo que dormirá en la casa de Malcolm, sin embargo, ya en la feria los muchachos quedan atrapados, pero también huyen de un malvado oficial de policía.

Hal, junto con sus amigos, juegan poker extremo. Malcolm, Stevie, y Reese se ven obligados a pasar la noche con 2 niñas populares en su cuarto. Reese le dice a una que Stevie tiene una enfermedad mental, y Malcolm descubre que la otra tiene una pistola automática

Reese esta harto de que Malcolm siempre defienda a Stevie y que a él lo traten como un tonto y decide pelear con Stevie entumiéndose las piernas para que sea una batalla justa, pero Stevie le tiene una sorpresa. Dewey se enganche en los cigarrillos gracias al ex-fumador Hal y los muchos cigarrillos alrededor de la casa. Lois intenta hacer que Jamie hable poco diciéndole su vida moderna y sus años de escuela secundaria. Las primeras palabras de Jamie son "Callate mamá" en respuesta a su madre que no para de hablar.

Los Kenarban hacen una pijamada de la noche a la mañana en casa de Stevie, Malcolm tiene que sufrir la vigilancia de los padres hasta que ambos se escapan a jugar videojuegos justo donde roban la silla de Stevie por lo que Malcolm lo tiene que llevar en varias cosas para poder llegar a la casa de Stevie.

Stevie queda impactado al saber que sus padres se están divorciando. Reese encuentra y lee el diario de una muchacha (y está enamorado con el dueño original), que resulta ser Lois. Dewey desea regresar al infantilismo.

Malcolm es el tercer hijo de Lois y Hal, tiene otros 3 hermanos (Francis, Reese y Dewey) con los que normalmente se suelen meter en muchos problemas. En este episodio se descubre que Malcolm es un niño genio, tiene un coeficiente intelectual (IQ) de 165 por lo cual lo traspasan a una clase avanzada lo cual le trae problemas al ser catalogado como un KrelBoyne (Nerd).

Lois boicotea Luigi (La Pizzería preferida de la familia), mientras que Malcolm flecha a hija de una familia intelectual, y sigue implicado con la familia en el proceso. Mientras, Hal y Reese siguen yendo a comer a la pizzería, en secreto.

Malcolm compra un auto usado, al que le dedicara mucho dinero. Reese hace apuestas en el Hipódromo. Lois descubre que Craig tiene una aventura con la esposa del gerente y Hal abre una estética.

Stevie acaba de salir de cirugía y Malcolm quiere ir a visitarlo, pero siempre pierde el tiempo con cualquier cosa, hasta que Hal platica con él y decide ir a verlo directamente. Hal va al lago con Jamie a jugar con su lancha a control remoto, pero sin querer se sienta en la banca de un niño, y éste tiene una mejor lancha que Hal, por lo que hunde el barquito de Hal varias veces, hasta que él se harta y busca una manera de derrotar al niño, Malcolm le ayuda y al final derrota al niño, pero este se deprime porque el barco se lo había dejado su abuelo antes de morir.