Una elusiva chica con un vestido de flores puede ser la clave para el misterio que lleva a Coulson y al equipo a Asia a rescatar a un joven con un poder inusual y peligroso. Skye tiene un secreto que pone en peligro su relación con el equipo justo cuando más se la necesita.

En un episodio de suspenso impactante, Coulson lleva la guerra de nuevo a Centipede, y esta vez trae a Mike Peterson, ahora un Super-soldado, como apoyo. A medida que se acercan a la verdad se revelan secretos alarmantes, y un giro inesperado amenaza del equipo.

Coulson descubre información importante sobre su muerte, pero puede costarle caro al equipo.

Con el Coronel Glenn Talbot tras ellos, Coulson y su equipo buscan refugio en el último lugar que nadie miraría, donde empiezan a descubrir los secretos más peligrosos de S.H.I.E.L.D., secretos que pueden destruir a todos.

La traición de Ward y secretos impactantes de Hydra se revelan mientras el equipo de Coulson se infiltra en una misión que no deja a nadie indemne.

Oscuros secretos se revelan mientras Coulson y su equipo ponen todo en juego para detener a Garrett y las fuerzas de Hydra. Pero cuando el polvo se asiente, Coulson se encontrará con que nadie saldrá indemne de ésta batalla. Y justo cuando toda esperanza parece perdida, se les une el único hombre que puede ser capaz de cambiar el rumbo - Nick Furia.

Perseguido y quedándose sin soluciones, Coulson pone a su equipo justo en la línea de fuego, con el General Talbot, Hydra y Creel en el ataque. Un Doctor misterioso alberga algunos secretos peligrosos que podrían destruir a uno de nuestros miembros del equipo central.

Mientras está en una misión para aprender más acerca de los secretos de la escritura misteriosa, Coulson se ve atacado por la única persona en quien puede confiar: la Agente Melinda May. El resto del equipo está atrapado en una situación explosiva, y le toca a Fitz salvarlos.

El equipo de Coulson está en contra de la hermosa y mortal Bobbi Morse - Jefa de Seguridad de Hydra. El padre de Skye obliga Raina a reunirlo con su hija a cualquier precio.

S.H.I.E.L.D. descubre la antigua ciudad antes de Hydra, pero descubrir los secretos puede requerir que uno del equipo de Coulson haga el último sacrificio. Mientras tanto, May y Skye corren para llegar a Raina antes de que Whitehall se la lleve.

Coulson y las fuerzas de Whitehall se reúnen en un enfrentamiento explosivo que altera dramáticamente destinos de todo el mundo. Mientras tanto, Skye descubre secretos impactantes sobre su pasado.

El equipo de Coulson debe lidiar con las consecuencias de su guerra con Hydra mientras revelaciones impactantes amenazan con separarlos, e Hydra hace una jugada peligrosa que puede implicar a un traidor en medio de S.H.I.E.L.D.

Gordon lleva a Skye al "Más Allá", el refugio para gente con habilidades, donde conoce a Lincoln Campbell, otro joven con poderes quien le explica que a cada uno de ellos les es asignado un guía para ayudarlos a controlar sus habilidades. Gonzales les pide ayuda a Fitz-Simmons para abrir la caja de herramientas de Furia, pero Fitz se niega y decide abandonar S.H.I.E.L.D., aunque es en realidad una treta organizada entre él y Simmons para así poder escaparse con el objeto y mantenerlo a salvo. Mientras, Coulson y Hunter roban un quinjet con la ayuda de Mike Peterson, quien ha estado trabajando secretamente bajo las órdenes de Coulson y vigilando al Dr. List, uno de los líderes de HYDRA, con lo que ha descubierto que éste está realizando experimentos con gente que posee "dones".

La historia de la transformación de Melinda May en "La Caballería" se revela mientras se encuentra en una encrucijada en la guerra entre Coulson y Gonzales. Cuando Skye aprende más sobre su verdadera herencia a través de Lincoln, la verdad acerca de los Inhumanos le llevará en una nueva dirección.

Gonzales y Coulson deben encontrar una manera de poner sus diferencias a un lado y trabajar juntos contra HYDRA, incluso si esto significa colaborar con alguien en quien no confían.

Skye se debate entre su lealtad a S.H.I.E.L.D. y su conexión con los Inhumanos mientras la tensión aumenta entre los grupos - y Coulson revela un secreto que ha estado escondiendo de incluso los más cercanos a él.

S.H.I.E.L.D. apuesta todo para sobrevivir a una guerra que emborrona los límites entre amigo y enemigo. Coulson y su equipo deberán hacer grandes sacrificios que cambiarán sus relaciones y sus mundos.

Coulson convence a uno de los seguidores de Hale para que lo ayude. Mientras, Jemma y Elena aleboran un plan para liberar a Fitz, a la vez que Daisy y Melinda recurren a Robin en busca de ayuda.