Walter White, era un famoso investigador químico de un prestigioso Laboratorio del Gobierno, que a día de hoy ha sido relegado a enseñar a apáticos estudiantes de un Instituto en Albuquerque. Para poder llegar a fin de mes también tiene un trabajo a media jornada en un lavadero de coches. Además, él y su esposa, Skyler (Anna Gunn, Deadwood), una mujer que se ha forjado una modesta carrera en la compra-venta de artículos por eBay, están criando a Walter, Jr. (R.J. Mittle), un joven de diecisiete años, con una gran fuerza de voluntad, que tiene parálisis cerebral lo que presenta un continuo reto para la familia. Pero todas estas dificultades palidecen en relación con el nuevo descubrimiento de Walter: tiene cáncer con un pronóstico de dos años de vida.

Walter no sabe si matar o no a Krazy-8. Mientras, Marie cree que su hijo está enganchado a la marihuana y le pide a Hank que le de algún susto para que lo deje. Walter decide invitar a comer a Krazy-8, pero las cosas se tuercen cuando se marea mientras baja unos escalones. ¿Le contará lo que pasa?

Walter y Jesse han llegado a un acuerdo: Walter será el que “fabrique” las drogas y Jesse se encargará de su distribución en la calle. Skyler le pregunta sobre todo el tiempo que pasa fuera de casa, y él le miente diciéndole que tan solo quiere estar a solas a veces.

Walter y Jesse tienen serios problemas para fabricar toda la cantidad de droga que le han prometido a Tuco. Por otro lado, Skyler se enfrentará a su hermana Marie por su tendencia a robar en las tiendas.

Gretchen, recién llegada de Santa Fe, llama a casa de Walt para saber como se encuentra por lo que Skyler la llama para agradecerle que paguen su tratamiento. Por suerte Gretchen no la saca del error aunque queda con ella para esa tarde pero cuando se encuentran todos juntos Gretchen sigue disimulando. Walt ha vuelto a dar clases y Carmen, la directora, habla con él para saber como se encuentra y por si necesita hablar con alguien. Tras recibir el consejo de Walt de que ha de mostrarse firme con los ladrones o en la calle se lo comerán vivo, Jesse acude a casa de la pareja que le había robado a uno de sus muchachos para conseguir su dinero pero allí solo encuentra a un crio con hambre viendo la tele. Cuando llegan trata de sacarles lo que robaron pero ya casi no tienen material aunque le ofrecen el dinero de un cajero que robaron.

Walt y Hank entrar en una acalorada discusión en una fiesta. Skyler se abre a su jefe. Jane esconde su relación con Jesse a su padre.

Mientras la ciudad trata de sobreponerse al accidente aéreo, Walt tiene que mudarse aunque su hijo no entiende la situación. Jesse sigue en tratamiento y Skyler empieza a preparar los papeles del divorcio.

Walter descubre que Saul le espiaba en su propia casa y decide cortar su relación con él. MIentras, Jesse trata de convencerle de volver al negocio, pero ante la negativa de Walt, decide seguir por su cuenta. Por otro lado, cuando Hank está a punto de volver a trasladarse a El paso, la famosa metanfetamina azul de Heisenberg vuelve a hacer aparición.

Eventos puestos en marcha hace mucho tiempo avanzan hacia su conclusión.