Ana irrumpe en la operación de Argentina sorprendiendo a Dixon y a Sydney. Ana desparece con el diario de Rambaldi dejando a Dixon herido, Sydney consigue salir del pozo y cuando encuentra a Dixon herido no tiene otro remedio que pedir ayuda a la CIA aunque esté en una misión del SD6. Sydney trata de encubrir el rescate de la CIA pero en el SD6 desconfían de ella aunque superara el detector de mentiras. Sloan decide enviar a Sydney a la Toscana, quiere tender una trampa para descubrirla: filtra a la CIA una orden de ejecución contra ella para que estos intervengan, pero Jack, el padre de Sydney conoce demasiado bien a Sloan como para dejarse engañar. Tras Toscana Sydney viaja a Ginebra a retirar unos fondos en una misión del SD6, la contra-misión de la CIA es que lleve un trasmisor indetectable que no conseguirá serlo para el SD6.

La CIA descubre que el Directorio K ha contratado a un asesino a sueldo para que se encargue de Kashinau, ya que Shark, el asesino del jefe del Directorio K, trabajaba para él. La relación entre Noah y Sydney sigue en marcha y él quiere dejar el SD 6 y huir con Sydney a un lugar donde no puedan encontrarlos. El Chip electrónico rescatado de Rusia revela nuevos datos sobre la madre de Sydney, Irina, una agente encubierta soviética con una misión: Ganarse la confianza de Jack Bristow y sonsacarle toda la información posible. La prioridad de La CIA y el SD 6 es hallar a Kashinau esté dónde esté, pero un asesino, el temible "Hombre de Nieve", puede llegar antes que ellos.

La alianza de Sark con el SD-6 pone de forma repentina a Sydney en una situación en la que corre el riesgo de ser descubierta como agente doble. Ella se ve obligada a participar en su plan, hasta que su alianza con Sloane pone numerosas armas nucleares en manos equivocadas. Ahora, sólo Irina tiene la clave para desentrañar los planes de Sark, pero ella se niega a cooperar.