Clark descubre que a John Jones le dispararon mientras trabajaba como policía, así que decide ponerse el uniforme y tratar de localizar al culpable. Mientras, Lana se enfrenta a Tess y le dice que Lex no es el hombre que ella cree que es. Lo que le cuenta Lana obliga a Tess a volver a plantearse su papel como líder de LuthorCorp.

Clark descubre que Davis sigue vivo y se enfrenta a Chloe por haberlo protegido. Oliver sorprende a Jimmy colándose en el apartamento de Chloe, y la situación empeora rápidamente cuando Davis aparece de entre las sombras y los ataca. Además, Davis le pide a Chloe que se vaya de la ciudad con él.

Chloe regresa y le suplica a Clark que mate a Davis, ya que él ya no es capaz de mantener a la bestia a raya. Tess ha reunido un grupo de personas afectadas por los meteoritos, entre ellas Plastique, con el objetivo de localizar a Davis para que Clark pueda matarlo. Sin embargo, la situación se desmadra cuando el equipo de Tess descubre que ella los ha engañado.

Clark le dice a Jor-El que está preparado para empezar con su entrenamiento, pero Jor-El lo envía de vuelta a Metrópolis para cortar los vínculos con Lois antes de que pueda empezar. Chloe se queda conmocionada cuando Lois de repente aparece después de haber estado desaparecida durante semanas, pero Lois no recuerda haberse desvanecido en el aire con el anillo de la Legión. Mientras investiga el descarrilamiento de un monoraíl, Lois se encuentra con John Corben, un nuevo reportero del Daily Planet, con una actitud negativa hacia el Borrón-Rojo-Azul. Chloe le suplica a Clark que use el anillo de la Legión para volver atrás en el tiempo y salvar a Jimmy, pero él se niega, provocando una fisura en su amistad. Mientras tanto, Oliver continúa avanzando en un oscuro camino, y Zod llega a la mansión de los Luthor...

Después de ser atropellado por un camión, John Corben se levanta solo en un apartamento abandonado como un hombre-máquina con un corazón de Kriptonita. Corben se da cuenta de que ahora tiene una fuerza sobrehumana y se propone vengarse en el Borrón Rojo-Azul, quien piensa que es un vigilante irresponsable. Contra los deseos de Clark, Lois se involucra a sí misma en la investigación del Borrón Rojo-Azul, y termina siendo raptada por Corben.

Zod y sus soldados liberan un virus en el aire que convierte a los humanos en zombies. La única manera de pararlo es fabricar un antídoto con la sangre de otro kriptoniano. Después de que Lois es infectada, Chloe le suplica a Clark que done su sangre para parar la epidemia, aunque eso pone en riesgo el que se revele ante Zod.

Tess secuestra a Lois para descubrir dónde fue Lois tras haber desaparecido durante semanas. Los recuerdos de Lois del futuro representan a una Metrópolis bajo las reglas de Zod y a Clark sin poderes bajo el sol rojo, mientras que Chloe forma un grupo de resistencia con Oliver. Después de conocer estos eventos futuros, Clark toma una importante decisión sobre Zod.

Un misterioso hombre aparece ante Chloe para hacerle una terrible revelación , que desencadena una serie de descubrimientos sobre un grupo de justicieros aparentemente olvidados.

Es el Día de San Valentín y mientras que Clark está en una cita con Lois, sin saberlo se ve infectado por una gema de kriptonita, que tiene propiedades mágicas para satisfacer deseos. Clark le menciona a Lois que él desearía que tuvieran una relación más tradicional, así es que Lois deja el Daily Planet, se muda con Clark y empieza a planear su boda. Aún ajeno a su nuevo poder, Clark también le dice de forma casual a Chloe que desearía que pasara más tiempo vigilándole, así es que una infectada Chloe se toma a pecho su deseo y pone la vista sobre un nuevo objetivo – Lois.

El estreno de la décima temporada comienza exactamente donde terminó la novena. Lois encuentra el cuerpo sin vida de Clark y elimina la kryptonita azul que le permite curarse a sí mismo. Lois se escabulle antes de que Clark despierte totalmente, con el fin de proteger su secreto. Chloe está desesperada por encontrar a Oliver, por lo que acude a una fuente poco ortodoxa para las respuestas. Jonathan Kent vuelve a la granja con un mensaje para Clark, y Tess se despierta en un laboratorio de LuthorCorp.

Oliver pone a prueba la Ley de Registro de Vigilantes al revelar su identidad en una conferencia de prensa, siendo elogiado por el general a cargo. Como se temía, es torturado en una prisión secreta para que traicione a sus amigos superhéroes. Tess ayuda a descifrar los planes de Luthor para construir una instalación de máxima seguridad submarina, construida en seis partes. Aquaman, Arthur Curry, y su nueva esposa Mera descubren y penetran en la prisión donde está Oliver, pero el general decide activar la autodestrucción. Clark se mantiene cauteloso y acude al rescate, pero tiene que lidiar con una contramedida específica.

A medida que la amenaza de la VRA se intensifica, Clark toma la iniciativa al cerrar la torre de vigilancia y declarar que la Liga se sumerge oficialmente en la clandestinidad, pero ¿será suficiente para detener al Teniente Trotter y a Slade Wilson alias Deathstroke de exponerlos? Las tensiones aumentan en este final de mitad de temporada.

Después de que Zatanna envía una botella de champán mágicamente adulterada a Clark y Lois para sus despedidas de soltero/a, el grupo pierde el conocimiento después del brindis, solo para despertar a la mañana siguiente y darse cuenta de que no pueden recordar nada de la noche anterior. Mientras intentan reconstruir lo sucedido, Lois se da cuenta de que perdió su anillo de compromiso y arrastra a Oliver de vuelta al Casino Fortune donde cree haberlo perdido. Los dos se encuentran con Fortune, el excéntrico dueño del casino, quien los acusa de robarle dinero. Mientras tanto, Clark le cuenta a Chloe que tiene un recuerdo de haber robado un camión blindado la noche anterior.

Clark Kent está en un estado de nostalgia después de que Martha le cede la escritura de la granja como regalo de bodas, preguntándose si eso sugiere que él y Lois deberían vender y mudarse. Clark Luthor lo sorprende, usando la caja de espejo y rompiéndola después de haber enviado a Kent a su mundo, luego engaña a todos por un tiempo, en busca de una venganza sangrienta contra al menos un Luthor. Kent se encuentra a sí mismo como el enemigo público número uno, contra quien todos llevan kryptonita verde, en el funeral de Oliver, donde un amargo Jonathan reprende al "Scrooge". Reconocido y ayudado por la otra Lois, él busca apaciguar el odio y encontrar una manera de regresar. El Dr. Emil Hamilton intenta frenéticamente reparar la caja de espejo, justo a tiempo.

La historia de Clark Kent culmina en este final de dos horas de la serie mientras Clark da el último paso para convertirse en el Hombre de Acero.