Magnus y Luke revelan el pasado de Clary. Mientras tanto, Isabelle y Alec son puestos a prueba para restaurar el nombre de su familia a los ojos de la Clave. Con Luke necesitado de ayuda, Jace, Clary y Simon lo llevan a la casa de Magnus con la esperanza de que le salve la vida. Una vez allí, la historia de como Valentine se volvió malvado y el pasado de Jocelyn y Luke son revelados a Clary con la esperanza de restaurar su memoria y saber qué ocurrió con la Copa Mortal.

Después de juntar las pistas acerca de dónde escondió su madre la Copa, Clary, Jace, Alec e Isabelle van a contra reloj para encontrar antes que nadie el sitio en dónde está escondida. Pero con Demonios y Subterráneos al buscando por todos lados, conseguir la Copa puede no ser tan fácil como ellos creían. Mientras tanto, los síntomas de Simon empeoran, teme estar convirtiéndose en vampiro.

Clary considera si debe revivir a Simon como vampiro. En el instituto, la aparición de la enviada de Clave, Lydia Branwell, obliga a Alec a sacrificarse.

Tras el ataque, el Instituto y la Clave están en máxima alerta y no toman prisioneros para obtener respuestas. Lydia decide trasladar e interrogar a Meliorn. Jace, Clary e Isabelle temen que esta decisión podría ser desastrosa y el camino equivocado para derrotar a Valentine. Al no tener otra opción, el trío toma medidas drásticas para detener lo que está a punto de tener lugar. Mientras tanto, Simon se esfuerza por hacer frente a su nueva situación, y Alec está emocionalmente roto con lo que está sucediendo en el Instituto.

Clary y Jace escuchan un consejo de Meliorn, que les dice que pueden encontrar a Valentine mediante la localización de un portal en otra dimensión, pero sólo Clary puede adentrarse en este nuevo mundo. Clary lo encuentra en este universo alternativo en el que la vida es como si la amenaza de los demonios ya no existiera y los cazadores de sombras ya no fueran necesarios. Allí se da cuenta de que esta dimensión es la vida que siempre soñó, pero Clary debe actuar con rapidez o se perderá a sí misma en el mundo alternativo para siempre. Mientras tanto, Alec e Isabelle deben hacer frente a las consecuencias del ataque de los Subterráneos.

El Instituto está en pleno funcionamiento mientras todos se están preparando para la boda de Alec y Lydia. Lydia está recibiendo los últimos retoques en su vestido de novia, las decoraciones de la boda se ponen e Isabelle está tratando de encontrar una manera de hacer una fiesta de soltero mundana tradicional para su hermano-le guste o no. Durante lo que debería ser un momento de gran celebración para muchos es lejano a eso a medida que examinan sus relaciones. Alec está luchando entre dos lados -su matrimonio es uno de los días más importantes de su vida y su parabatai debe permanecer a su lado, pero por desgracia, todavía hay una gran cantidad de tensión entre él y Jace. Alec también continúa luchando con sus sentimientos por Magnus, especialmente cuando Magnus no se da por vencido con Alec. Mientras que en el Instituto hay un aire de romance, Clary trata desesperadamente de hacer funcionar las cosas entre ella y Jace, pero él no parece dispuesto a cambiar de opinión. Entre todo esto, Jace, Clary y Magnus buscan a Ragnor Fell, un brujo poderoso, para ayudarles a crear un antídoto para Jocelyn.

El tiempo corre para los Shadowhunters en su búsqueda de detener a Valentine. Jace, quien aún está lidiando con todo lo que ha sucedido, hace de la cacería de Valentine su prioridad número uno aunque continúa batallando con sus confusos sentimientos. Esperando encontrar una forma de detener a Valentine antes de que sea demasiado tarde, Clary y Simon deben encontrar la llave para desbloquear el coma de Jocelyn. Pero esa llave para desbloquear el hechizo de Jocelyn podría deshacer el tratado de paz con los subterráneos, la relación de Simon con Raphael y el clan de vampiros en el proceso. Mientras tanto, Alec debe lidiar con las consecuencias de su decisión y lo que su elección significa para su futuro.

Tras los últimos acontecimientos, a Simon le cuesta observar el Día de Expiación, mientras Clary y Jace viajan a Idris para encontrar a Valentine.

Después de un devastador ataque en el Instituto, todo el mundo está en alerta mientras los cazadores de sombras se acercan a la caza deJonathan. Mientras tanto, Simon y Maia ayudan a un nuevo submundo mientras la Reina Seelie exige una respuesta de Magnus y Luke.

Los aliados se enfrentan a Lilith en su versión más poderosa. Mientras tanto en la Tierra, Jonathan planea un ataque devastador contra los institutos.