Sayid, arrepentido por lo que hizo a Sawyer, decide irse por la isla. En medio de otra playa encuentra un cable, que al seguirlo lo conduce a un trampa donde pierde el conocimiento. Al despertar se encuentra atado a una cama, en una habitación con una mujer, Danielle Rousseau. Al hablar con ella, Sayid se da cuenta de que esa es la mujer francesa del mensaje de auxilio. Ella le cuenta de que llegó a la isla con una expedición, entre ellos su amor. Y no hace más que hablar de “Alex”. Cuando la mujer sale de allí, Sayid aprovecha para liberarse y escapar. Cuando en medio del bosque se encuentra con Rousseau, Sayid la convence para que no le dispare. Cuando Rousseau decide marcharse, Sayid la pregunta quién es Alex. “Es mi hijo”. Mientras Hurley decide montar un campo de golf en una explanada de la montaña. Y a todos les parece una buena idea ya que está bien para distraerse. Los flashbacks muestran la vida de Sayid, soldado de la Guardia Republicana. Él se enamora de una prisionera a la que mandan ejecutar, Nadia. El día de su ejecución, Sayid la ayuda a escapar, teniendo que matar a un soldado y disparándose a él mismo. Cuando Sayid estaba con Rousseau, ésta le habló de unas voces que oye en el bosque y de “Los Otros”. Sayid pensaba que estaba loca, pero cuando logra escapar, al cruzar el bosque, empieza a escuchar voces y susurros...

Mientras construyen una nueva balsa, Michael tiene una idea: será más fácil que los encuentren si llevan un transmisor. Pero para eso necesitan las baterías que Sayid vio en la cueva de la mujer francesa. Él no se muestra demasiado entusiasmado con la idea de regresar, y además dice que no se siente capaz de encontrar el luegar de nuevo, así que Hurley empieza a estudiar los planos que se llevó para ver si es capaz de ubicar el escondite. Pero lo que descubre es que tienen una serie de números escrita que le resulta muy familiar.

Mientras los supervivientes están alrededor de un fuego escuchan ruidos en la selva. Todos se alarman y van a por las armas que tienen a mano. De pronto, surge de entre la oscuridad la figura de una mujer. Sayid, al reconocerla, tranquiliza a todos. Es Rousseau, la mujer francesa. Está asustada y les avisa de que están en peligro ya que “los otros” les acechan. Rousseau desvela al resto de lo supervivientes que es miembro de un equipo de científicos que llegaron a la isla, después de un naufragio. Pero para sorpresa de todos les dice que en esa época ella estaba embarazada. ¿Dónde está el hijo de Rousseau? Mientras, en la playa Michael y Jin ultiman la construcción de la balsa para salir de la isla. Claire continúa preocupada por el futuro de su bebé, sobre todo después de conocer la historia de la mujer francesa. Charlie no deja de ofrecerse para prestarle ayuda. El joven se siente con el deber de proteger a Claire y al recién nacido. Jack, Locke, Kate y Sayid continúan empeñados en abrir la escotilla. Para ello utilizan dinamita. Por fin Michael consigue finalizar la balsa y la llenan de provisiones. Los elegidos para ir en busca de ayuda son Michael, Walt, Jin y Sawyer. Ha llegado el momento de despedirse de los supervivientes que se embarcan. Sun ha preparado un diccionario para que Michael, Walt y Sawyer puedan comunicarse con su marido Jin. Todas las esperanzas están puestas en ellos y en averiguar qué es lo que hay detrás de la escotilla.

Michael junto con sus compañeros ya han empezado a navegar, mientras en la isla los demás supervivientes se refugian en las cuevas. Entre las mujeres empieza a haber inquietud y a creer que lo que les ha sucedido es un castigo. Por otro lado, Jack y los demás encuentran la dinamita. Azt advierte del peligro de manipulación de la dinamita. Michael, Walter Lloyd, Jin y Sawyer consiguen a duras penas hacerse a la mar con la embarcación que han construido. En la playa quedan el resto de los supervivientes, con todas las esperanzas puestas en ellos. Pero mientras intentan gobernar la balsa son sorprendidos por algo inesperado. Esta nueva sorpresa puede poner en peligro sus planes para intentar pedir ayuda y rescatar a sus compañeros.

Un visitante al campamento podría representar una amenaza para el hijo de Claire.

Rousseau se encuentra con un extraño hombre en la selva, y consigue capturarlo. El extraño que Rousseau ha capturado le dice a los supervivientes que llegó a la isla, junto a su mujer, en un globo aerostático y que tuvieron que aterrizar en ella. Como no están convencidos de que diga la verdad, los supervivientes instan a Sayid, -como experto interrogador-, que sea él el que hable con el hombre para averiguar lo que sabe. Pero Sayid, que no ha superado la muerte de Shannom, no se siente con fuerzas ni está por la labor de interrogar al prisionero que ha traido Rousseau . El resto de los supervivientes le convencen, ya que todos corren peligro si el prisionero pertence al grupo de “Los otros”. Flash back de Sayid Sayid recuerda como los americanos le capturaron en medio de la guerra del golfo y le obligaron a servir para sus intereses.

El hijo de Claire, Aaron, está enfermo. A pesar de los cuidados, Jack no sabe muy bien lo que tiene el niño.Para Rousseau, el origen de la enfermedad de niño está en lo que le sucedió a Claire cuanto fue capturada por "Los otros". Pero como la joven no recuerda nada, no pueden averiguar lo que le ocurrió durante ese tiempo. Claire no renuncia a saber lo que le ocurre a su hijo, por lo que le pide a Lily, que es psicóloga clínica, que le ayude a averiguar que es lo que pasó mientras estaba retenida por “Los otros”. La mujer sólo recuerda que estuvo en un laboratorio. Y esta información hace que Claire y Kate presionen a Rousseau -que parece conocer el lugar donde se encuentra el laboratorio-, para que vaya hasta allí y consiga algún remedio para la extraña enfermedad de Aarón. Flash backs de Claire Claire empieza a recordar el tiempo que se pasó en cautiverio, lo que la hicieran a ella y al bebe y como consiguió escapar

Hurley, gracias a Vincent, descubre en la selva una furgoneta de cuyos ocupantes, miembros de Dharma, sólo queda el esqueleto. Este hallazgo hace recordar a Hurley su tumultuoso pasado. El consejo de su padre: tener y buscar esperanza, es lo que le llevará a intentar ponerla en marcha, invitando a Charlie a que desafíe su trágico destino pronosticado por Desmond. Kate mantiene una lucha interna por haber dejado en manos de "los otros" a Jack, pero a pesar de ello, ella y Sawyer llegan al campamento de la playa.

Kate, Locke, Sayid y Rousseau se dirigen al norte siguiendo las marcas del bastón de Eko, donde descubren una estructura rodeada por animales y conocen a su extraño habitante. La experiencia de Sayid como torturador y torturado le hace sospechar que este hombre forma parte de los "otros" y que la estructura es una de sus bases. Mientras en la playa, Sawyer reta a cualquiera de sus compañeros a una partida de ping-pong para poder recuperar todos sus enseres.

Claire ha tenido una idea para poder mandar un mensaje al mundo exterior: atrapar a un ave migratoria. Pero, mientras Charlie se resiste a la idea, Desmond sabotea cualquier iniciativa para capturar al ave. Claire intenta averiguar la verdad siguiendo a Desmond y por fin le revelara sus visiones acerca del destino de Charlie. En este capítulo Claire recuerda algunos acontecimientos dramáticos de su pasado. Mientras, el grupo de rescate formado Kate, Sayid, Locke y Russeau avanza por la selva siguiendo un mapa requisado al prisionero, hasta que se topan con un obstáculo muy peligroso.

Kate, Sayid, Locke y Rousseau consiguen llegar hasta el campamento de "los otros". Kate se sorprende de la actitud tan amigable de Jack con sus captores, Jack se justifica diciendo que Ben le ha hecho la promesa de dejarle volver a casa. En este episodio se revelan más datos del pasado de Locke y recuerda la relación tormentosa con su padre. En su afán por buscar la verdad de la isla, Locke presiona a Ben para que le cuente ciertos secretos de este misterioso lugar. Al poner en marcha su destructivo plan, hará realidad su sueño de quedarse en la isla, mientras que Ben no romperá la promesa a Jack; pero el líder de los otros aún tiene una sorpresa para Locke...

Locke (Terry O'Quinn) no da crédito a sus ojos cuando Ben (Michael Emerson) le muestra a su padre encerrado en una habitación del campamento de "los otros". Ben ofrece a Locke unirse a ellos para ir a un nuevo sitio, pero hay una exigencia, un compromiso de libertad que consiste en liberarse de su padre. Locke buscará a Sawyer (Josh Holloway) para llevar a cabo su plan: eliminar a un enemigo común. Mientras, en la playa, la paracaidista da una información crucial acerca del vuelo que se estrelló en la isla.

Los supervivientes se preparan para la llegada inminente de "los otros" y Jack dispone de un plan para enfrentarse a ellos. Juliet ayuda aportando los datos que conoce de las distintas estaciones que hay diseminadas por la isla. Sayid pretende enviar un mensaje que solo podría realizarse desde la estación submarina de "El Espejo". Desmond ha vuelto a tener otra visión en la que, de nuevo, Charlie muere y un helicóptero rescata a Claire y Aaron. La misión de desconectar la estación de "El Espejo" y la supuesta muerte de Charlie parece estar conectada para lograr enviar el mensaje y que les rescaten.

Charlie consigue llegar hasta la estación submarina de "El Espejo", donde es capturado por dos mujeres que le custodian, éstas rompen el silencio cuando se comunican con Ben. Mikhail será enviado a la subestación para hacer limpieza, aunque hay cierta desconfianza hacia su líder. Mientras Jack y el resto de los supervivientes se dirigen a la torre de radio, Sayid, Jin y Bernard consiguen, sólo a medias, el plan para destruir a "los otros" y son capturados. Al mismo tiempo, Jack recuerda su intento de suicidio en un puente y cómo tuvo que abortarlo a consecuencia de un accidente de trafico.

Mientras Richard guía a "los otros" hacia el templo, Ben va a la torre de radio con Alex y allí espera a Jack y a los demás supervivientes. Ben trata de enfrentar a Jack contra Noemi, aduciendo que no es quien parece. Al mismo tiempo, Sawyer y Juliet, que han rechazado la ayuda de Hurley, traman un plan para rescatar a Sayid, Jin y Bernard, capturados por "los otros" en la playa. Por otro lado, Charlie y Desmond consiguen desbloquear la señal, pero al mismo tiempo, Charlie recibe una comunicación de Penélope -la novia de Desmond- que le asegura que no conoce a ninguna Noemi.

Pensaban que habían encotrado al enemigo. Pensaban que habían visto el mal. Se equivocaron... Al comienzo de la nueva temporada, los supervivientes sienten que el rescate está al alcance de la mano, pero no saben si creer o no el último mensaje de Charlie diciendo que la gente que supuestamente les iba a liberar no son lo que parecen ser. Las extrañas alianzas forjadas, aquellos en los que confiaban pueden tornarse en su contra, del mismo modo que los enemigos de sus enemigos se convertirán sus amigos. Pero, ¿en quién confiar?, ¿está el rescate realmente tan cerca como parece?

Los supervivientes empiezan a preguntarse por las intenciones del equipo de rescate, cuando cuatro extraños llegan a la isla.

El rehén de Locke puede ser la clave para salir de la isla, así que Sayid y Kate van a la búsqueda de su compañero en un intento de negociar un trato pacifico.

Sayid se enfrenta al espía que Ben tiene en el carguero, y Ben, a su vez, presiona a Alex a que huya del campamento de Locke, para sobrevivir al inminente ataque.

Cuando la salud de Jack está en grave peligro, Kate y Juliet deben aprender a trabajar juntas para poder salvarlo. Mientras tanto, Claire, Sawyer, Aaron y Miles tendrán problemas en su huída del campamento de Locke hacia la playa.

Mientras Locke idea una nueva estrategia, el grupo de Jack busca a Desmond.

Sayid se enfrenta al espía que Ben tiene en el carguero, y Ben, a su vez, presiona a Alex a que huya del campamento de Locke, para sobrevivir al inminente ataque.

Mientras los supervivientes están alrededor de un fuego escuchan ruidos en la selva. Todos se alarman y van a por las armas que tienen a mano. De pronto, surge de entre la oscuridad la figura de una mujer. Sayid, al reconocerla, tranquiliza a todos. Es Rousseau, la mujer francesa. Está asustada y les avisa de que están en peligro ya que “los otros” les acechan. Rousseau desvela al resto de lo supervivientes que es miembro de un equipo de científicos que llegaron a la isla, después de un naufragio. Pero para sorpresa de todos les dice que en esa época ella estaba embarazada. ¿Dónde está el hijo de Rousseau? Mientras, en la playa Michael y Jin ultiman la construcción de la balsa para salir de la isla. Claire continúa preocupada por el futuro de su bebé, sobre todo después de conocer la historia de la mujer francesa. Charlie no deja de ofrecerse para prestarle ayuda. El joven se siente con el deber de proteger a Claire y al recién nacido. Jack, Locke, Kate y Sayid continúan empeñados en abrir la escotilla. Para ello utilizan dinamita. Por fin Michael consigue finalizar la balsa y la llenan de provisiones. Los elegidos para ir en busca de ayuda son Michael, Walt, Jin y Sawyer. Ha llegado el momento de despedirse de los supervivientes que se embarcan. Sun ha preparado un diccionario para que Michael, Walt y Sawyer puedan comunicarse con su marido Jin. Todas las esperanzas están puestas en ellos y en averiguar qué es lo que hay detrás de la escotilla.

El hijo de Claire, Aaron, está enfermo. A pesar de los cuidados, Jack no sabe muy bien lo que tiene el niño.Para Rousseau, el origen de la enfermedad de niño está en lo que le sucedió a Claire cuanto fue capturada por "Los otros". Pero como la joven no recuerda nada, no pueden averiguar lo que le ocurrió durante ese tiempo. Claire no renuncia a saber lo que le ocurre a su hijo, por lo que le pide a Lily, que es psicóloga clínica, que le ayude a averiguar que es lo que pasó mientras estaba retenida por “Los otros”. La mujer sólo recuerda que estuvo en un laboratorio. Y esta información hace que Claire y Kate presionen a Rousseau -que parece conocer el lugar donde se encuentra el laboratorio-, para que vaya hasta allí y consiga algún remedio para la extraña enfermedad de Aarón. Flash backs de Claire Claire empieza a recordar el tiempo que se pasó en cautiverio, lo que la hicieran a ella y al bebe y como consiguió escapar

Sayid, arrepentido por lo que hizo a Sawyer, decide irse por la isla. En medio de otra playa encuentra un cable, que al seguirlo lo conduce a un trampa donde pierde el conocimiento. Al despertar se encuentra atado a una cama, en una habitación con una mujer, Danielle Rousseau. Al hablar con ella, Sayid se da cuenta de que esa es la mujer francesa del mensaje de auxilio. Ella le cuenta de que llegó a la isla con una expedición, entre ellos su amor. Y no hace más que hablar de “Alex”. Cuando la mujer sale de allí, Sayid aprovecha para liberarse y escapar. Cuando en medio del bosque se encuentra con Rousseau, Sayid la convence para que no le dispare. Cuando Rousseau decide marcharse, Sayid la pregunta quién es Alex. “Es mi hijo”. Mientras Hurley decide montar un campo de golf en una explanada de la montaña. Y a todos les parece una buena idea ya que está bien para distraerse. Los flashbacks muestran la vida de Sayid, soldado de la Guardia Republicana. Él se enamora de una prisionera a la que mandan ejecutar, Nadia. El día de su ejecución, Sayid la ayuda a escapar, teniendo que matar a un soldado y disparándose a él mismo. Cuando Sayid estaba con Rousseau, ésta le habló de unas voces que oye en el bosque y de “Los Otros”. Sayid pensaba que estaba loca, pero cuando logra escapar, al cruzar el bosque, empieza a escuchar voces y susurros...

Los supervivientes se preparan para la llegada inminente de "los otros" y Jack dispone de un plan para enfrentarse a ellos. Juliet ayuda aportando los datos que conoce de las distintas estaciones que hay diseminadas por la isla. Sayid pretende enviar un mensaje que solo podría realizarse desde la estación submarina de "El Espejo". Desmond ha vuelto a tener otra visión en la que, de nuevo, Charlie muere y un helicóptero rescata a Claire y Aaron. La misión de desconectar la estación de "El Espejo" y la supuesta muerte de Charlie parece estar conectada para lograr enviar el mensaje y que les rescaten.

Cuando la salud de Jack está en grave peligro, Kate y Juliet deben aprender a trabajar juntas para poder salvarlo. Mientras tanto, Claire, Sawyer, Aaron y Miles tendrán problemas en su huída del campamento de Locke hacia la playa.

Pensaban que habían encotrado al enemigo. Pensaban que habían visto el mal. Se equivocaron... Al comienzo de la nueva temporada, los supervivientes sienten que el rescate está al alcance de la mano, pero no saben si creer o no el último mensaje de Charlie diciendo que la gente que supuestamente les iba a liberar no son lo que parecen ser. Las extrañas alianzas forjadas, aquellos en los que confiaban pueden tornarse en su contra, del mismo modo que los enemigos de sus enemigos se convertirán sus amigos. Pero, ¿en quién confiar?, ¿está el rescate realmente tan cerca como parece?

Mientras Richard guía a "los otros" hacia el templo, Ben va a la torre de radio con Alex y allí espera a Jack y a los demás supervivientes. Ben trata de enfrentar a Jack contra Noemi, aduciendo que no es quien parece. Al mismo tiempo, Sawyer y Juliet, que han rechazado la ayuda de Hurley, traman un plan para rescatar a Sayid, Jin y Bernard, capturados por "los otros" en la playa. Por otro lado, Charlie y Desmond consiguen desbloquear la señal, pero al mismo tiempo, Charlie recibe una comunicación de Penélope -la novia de Desmond- que le asegura que no conoce a ninguna Noemi.