Después de haber robado la espada y haberse teletransportado cinco años al futuro, Hiro y Ando son testigos del futuro triste y horroroso que les espera a nuestros héroes. Habiendo saltado cinco años al futuro, Hiro y Ando descubren que la gente con habilidades extraordinarias no sólo son conocidas en todo el mundo (después de la destrucción de Nueva York y la muerte de millones de personas), además los "héroes" están siendo registrados, encarcelados, cazados e incluso asesinados como "terroristas". Mientras el Presidente da el primer paso hacia una "solución final", Hiro y Ando se verán involucrados en la que podría ser la batalla final de los "Héroes" y se encontrarán con un nuevo y oscuro grupo de caras familiares. Si sobreviven a esta experiencia, ¿podrán volver al presente y salvar al mundo?