Los residentes de Chicago son victimas de una epidemia. Cuando Carter y Abby tratan a dos jóvenes con los mismos síntomas, la sala de urgencias se declara en cuarentena hasta que lleguen los expertos del gobierno federal. Mientras que Carter lucha por salvar a los jóvenes, el personal es atrapado por los pacientes, los heridos del choque de un autobús y con los irritados ciudadanos. Los periodistas rodean el hospital y la policía bloquea las salidas, por iniciativa propia las victimas inquietas organizan un pequeño motín en intento de escapar de unas peligrosas y agobiantes condiciones dentro. Mientras tanto, Pratt y Chen, que pueden haber contraído la enfermedad, ignoran sus propios síntomas mientras intentan salvar la vida de un vagabundo, paciente habitual del hospital.

El County General continúa en cuarentena y las autoridades deciden evacuar el hospital. El Dr. Gallart vacuna contra la viruela a los pacientes y la Dra. Lewis avisa a Abby y Carter de que hay que evacuar el hospital, pero que ellos deben permanecer en el County General dos semanas mas, por estar expuestos a la enfermedad. Chen y Pratt, también deben quedarse. Por otro lado, el Dr. Romano debe subir a un paciente grave para que lo lleven en helicóptero y pelea con Luka, quien tiene otro paciente grave en la misma situación. Romano levanta un papel y la hélice del helicóptero le corta el brazo izquierdo y Luka y la Dra. Lewis lo trasladan urgentemente al quirófano para operar. La Dra. Weaver visita a Romano y se entera de que podría perder la mano, aunque al final la operación sale con éxito, mientras que Elisabeth Corday está trabajando en un hospital de Londres, confiesa a su padre que extraña su hogar y decide volver a Chicago con su hija. Al final el Dr. Carter explica a Abby la teoría del caos y le cuenta que lleva dos años enamorado de ella, pero el caos siempre reinó en su vida.