Un extraño barco se dirige hacia la Tierra, y el SGC sospecha que Martin Lloyd y sus compañeros pueden tener algo que ver con ello. O'Neill es enviado a hablar con Martin y se le asigna como consultor militar en el nuevo programa de Martin, "Wormhole X-Treme!", que extrañamente se asemeja a SG-1 a pesar de que Martin vuelve a perder la memoria. Sus antiguos compañeros del barco detienen a Carter y Daniel al desviar su camino y ponerlos en manos del NID.

El senador Kinsey es disparado en el pecho durante un evento público, matándolo justo antes de la nominación presidencial de su partido. Jack es arrestado por el asesinato, y el general Hammond asigna al resto del SG-1 para descubrir la verdad.

Agent Barrett of the NID calls SG-1 to Los Angeles for a consult on a mass murdering of a rogue sleeper cell by a young woman. There they find many Goa'uld artifacts relating to Sekhmet, a subordinate of Ra. But how this operation is related to the Goa'uld eludes SG-1.

Following the death of a Jaffa on Earth and the disappearance of a prominent businessman, SG-1 starts an investigation into what remains of the Trust and into the actions of the Jaffa Nation. They discover that Ba'al is hiding on Earth after losing his forces to the Jaffa and that the Jaffa are secretly attempting his capture.

The SGC is approached by an Al'kesh bomber which lets itself be taken down, so they can capture Ba'al, who offers to exchange the necessary information to find Merlin's weapon for human help to eliminate his clones, which want to kill him. They mistrust his story, as does NID Agent Malcolm Barrett, who, however, fails to take over the investigation. Since the captive might actually be a clone, several missions to different planets retrieve and capture all clones, but which is the real Ba'al, and what are his true intentions?

Vala apuesta, gana un carguero, pero es descubierta haciendo trampa; luego aparece Adria, echa a todos y afirma que tiene una nueva flota Ori y una Puerta Estelar intergaláctica operativa. Vala le cuenta a su aterradora hija cómo ayudó a Daniel, después de un sueño, leyendo el misterio del símbolo clava thessara, que condujo a la dirección de un solo planeta, donde debe estar el tesoro de Athena; después de una desastrosa visita allí, el equipo se niega a seguir la siguiente interpretación, temiendo que sea solo una trampa preparada por Adria, por lo que Vala es declarada un riesgo de seguridad, restringida y confinada en el Área 51, pero escapa a través de la Puerta Estelar. Adria la lleva consigo al enterarse de que el equipo aún planea visitar la dirección, en nave estelar. Al llegar, quedan atrapados por el SG-1, que sin embargo se encuentra rodeado por las tropas del señor Ba'al. Ba'al utiliza los anillos para teletransportar a Adria a una jaula electromagnética en su nave estelar. De regreso en la Tierra, el general Landry se preocupa por el daño que los dos puedan hacer juntos y quiere recuperar a Adria. Daniel y Sam muestran ahora a Vala que ha sido implantada con tecnología Galaran con falsos recuerdos de toda su aventura hasta el encuentro con Adria. Aunque ella afirma que eso es imposible, Ba'al está seguro de que puede tomar el control de las leales tropas Ori de Adria a través de ella, implantando un simbionte. El equipo encuentra a los Jaffa y clones de Ba'al muertos por veneno de simbionte, excepto un Jaffa que secretamente usó tretonina. El equipo se teletransporta desde la nave estelar Odyssey camuflada hacia la de Ba'al, lo dispara y captura a Adria, pero de regreso en la Tierra, se descubre que está bajo el control de su simbionte. En lugar