Jack y su equipo buscan a Andy Deaver, un joven de diecisiete años visto por última vez por Graham Spalding, el carismático líder de la Academia Spalding, una escuela privada a la que el chico asistía. Cuando denuncian la desaparición, Jack sospecha inmediatamente del director: un ex veterinario sin más cualificaciones para ese puesto que el que su padre fuera el fundador del centro. Además, parece que su relación con Andy, como ya ocurrió con otros alumnos en el pasado, no era demasiado buena.

Jack se encuentra en medio de una investigación que trata de analizar los casos de personas desaparecidas en los que ha participado, incluidos aquellos más controvertidos como el de Graham Spaulding, acusado de pedofilia en tres ocasiones y cuya confesión Jack debía conseguir. Cada miembro del equipo es interrogado por un representante de la Oficina de Responsabilidad Profesional, por lo que un nivel de frustración y miedo se instala entre los integrantes del grupo de investigación de "Sin rastro". Estos interrogatorios dejarán en el aire el futuro de estos profesionales.

Jack y su equipo buscan a una oficinista, Sydney Harrison, que ha desparecido del edificio donde trabaja. Sus empleados reciben un e-mail pidiendo un rescate de 50.000 dólares. Pronto identifican al secuestrador. Se trata de Barry Mashburn, el marido de una antigua asistente de Sydney. Una vez localizado Mashburn, Samantha acudirá a su escondite para tratar de capturarle.

Samantha recibe un disparo de Mashburn y es herida de gravedad. Jack negocia con el secuestrador y le ofrece dejar libre a Samantha, que está muy grave, y en su lugar, convertirse él en rehén.

Jack y su equipo tratan de averiguar si hubo deficiencias en la adopción de la joven de 16 años Serene Barnes después de que la chica se presentase en las oficinas del FBI asegurando que fue secuestrada cuando tenía 3 años. Serene descubrió un artículo en un periódico de la época en el que se hablaba del secuestro de una niña de 3 años con su mismo nombre de pila. La joven se pregunta si sus padres adoptivos, en realidad, la secuestraron. Los investigadores comprueban que hace 13 años desapareció una niña llamada Serene Andrews y nunca fue encontrada. Mientras, Jack sorprende a todos al comunicar que se traslada a Chicago con su familia.

Dos adolescentes desaparecen al mismo tiempo: un chico negro y una chica blanca. El equipo se enfrenta a la difícil tarea de encontrar a ambos adolescentes, lo cual se vuelve increíblemente complicado debido a toda la cobertura mediática otorgada a la adolescente blanca.