El joven merlín es enviado por su madre a Camelot, para que tenga una vida mejor, donde aprenderá de Cayo, el médico del rey Uther, que cree que la magia es el mal y castiga con la muerte. Cuando se da cuenta de que Cayo Merlin ha mágico, telekinetic poderes que se compromete a mantener el secreto del niño. Uther ha ejecutado un brujo, cuya madre viene a Camelot bajo la apariencia de una hermosa niña de los encantos que el tribunal a dormir con su canto. Merlin sólo ve lo que está sucediendo y se mantiene despierto, el ahorro de la situación sin que se expone como un brujo. Como recompensa es ascendido a camarero de el hijo de Uther, Arthur.

Merlín vuelve a casa con Gwen, Morgana y Arturo y en el camino, éste último intenta pacificar a unos aldeanos que se encuentran en medio de un combate.

Amistad, lealtad y amor son puestos a prueba en el último episodio de la serie. Merlín se ve forzado a elegir entre aquello que más ama en el mundo. ¿Qué tendrá que sacrificar merlín para proteger su destino?

A medida que las fuerzas de Morgana capturan Camelot, Arthur finalmente logra ver la traición de su tío. Aunque es renuente a huir, Merlin lo hechiza para que escape con él, bloqueando temporalmente su memoria y vistiéndolo como un campesino. Elyan, Gaius y Gwaine son tomados prisioneros, aunque Morgana está impresionada por el desempeño de Gwaine en los juicios por combate. Separados de Leon y Percival, Merlin y Arthur se encuentran con los contrabandistas Tristan e Isolda, durante los cuales el hechizo de Merlin se desvanece y el joven rey puede revelar su identidad ante ellos. El cuarteto escapa a Ealdor, el pueblo de Merlin, donde un herido Arthur es cuidado por Guinevere mientras Agravaine y su ejército se acercan.